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Biochimie structurale et métabolique. L’enseignement de Biochimie Structurale et Métabolique se divise en 2 modules : L'organisation cellulaire Structure et fonctions des organites cellulaires au sein de la cellule végétale en approfondissant la paroi, la membrane et la vacuole.

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Presentation Transcript
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Biochimie structurale et métabolique

L’enseignement de Biochimie Structurale et Métabolique se divise en 2 modules :

L'organisation cellulaire

Structure et fonctions des organites cellulaires au sein de la cellule végétale en approfondissant la paroi, la membrane

et la vacuole.

Le métabolisme cellulaire

Les principes de base de la photosynthèse (photophosphorylation, cycle de Calvin etc.) et de la respiration cellulaire (glycolyse, cycle de Krebs, chaîne de transport des électrons).

Enfin, une synthèse est réalisée par l’étude de la bioénergétique où la production et l’utilisation de l’énergie est mis

en évidence.

Chaque module comprends 2 niveaux :

: les fondamentaux. Vue synthétique et globale. Des mécanismes importants détaillés. A savoir

: les approfondissements. Ils ne sont pas indispensables en 1ère lecture mais permettent d’acquérir

une vision plus complète du module proposée, soit les mécanismes sont détaillés au niveau biochimique,

soit des formules développées.

Module 1

Module 2

Niveau 1

Niveau 2

J. RAYNAL

Mise à jour : février 2005

slide2

Biochimie structurale et métabolique

Module 1 : L'organisation cellulaire

Les différences entre une cellule procaryote et une cellule eucaryote, entre une cellule animale et végétale.

Structures et fonctions des organites cellulaires. Les structures et fonctions des plastes, de la membrane cellulaire et de la paroi seront aussi détaillées.

Module 2 : Le métabolisme cellulaire

Les principes de base de la photosynthèse (photophosphorylation, cycle de Calvin etc.) et de la

respiration cellulaire (glycolyse, cycle de Krebs, chaîne de transport des électrons).

Notions de bioénergétique et vue d’ensemble du métabolisme des différents composés.

Dans chaque module, nous nous intéresserons principalement aux composés et au fonctionnement cellulaire de la cellule végétale.

  • Ouvrages recommandés
  • J.H. Weil, 2001 (9è ed). Biochimie générale. Dunod.
  • C. ALAIS et G. LINDEN, 1987. Biochimie alimentaire. Masson.

KEGG PATHWAY Database : Current knowledge on molecular interaction networks,including metabolic pathways, regulatory pathways, and molecular complexes

http://www.genome.jp/kegg/pathway.html

slide3

Biochimie structurale - Aide à la Navigation

Utilisation des sigles

(1)

Définition

ou Information

Affichage d’un texte

Affichage d’une animation de texte

indique des précisions (expériences, équation, …) ou des principes de chimie ou de physique indispensables

Retour au plan détaillé du module

et passage à un autre module

Passage au niveau 2

Vous êtes dans ce module

Les fondamentaux

Pour aller plus loin

Niveau 2

Retour au Niveau 1 ou de la Définition

Module 1

Niveau 1

Niveau 2

slide4

La Biochimie - Définition

La Biochimie : C'est d'une part l'étude des molécules qui constituent les êtres vivants, plus précisément l'étude de leur structure ou conformation. C'est d'autre part, l'étude de la transformation de ces molécules, c'est-à-dire l'étude des réactions chimiques au sein de la cellule et des organismes, notamment :      - les réactions de dégradation (ou catabolisme) des aliments qui fournissent l'énergie nécessaire aux organismes      - les réactions de biosynthèse (ou anabolisme) des composés dont les cellules ont besoin.

Enfin, le but de la biochimie est d'intégrer les données obtenus à l'échelle moléculaire à un niveau de complexité supérieure, celui de la cellule, puis celui de l'organe et enfin celui de l'organisme.

Pour mener à bien leurs études, les biochimistes font appel à des techniques et des connaissances issues de nombreuses disciplines scientifiques autres que la biologie, par exemple :      - la nomenclature de chimie organique pour la dénomination des molécules biologiques;      - la cinétique chimique pour l'étude des réactions chimiques et celle des propriétés catalytiques des enzymes (enzymologie);      - la thermodynamique pour l'étude de l'évolution des réactions chimiques et des variations de l'énergie emmagasinée dans les biomolécules au cours de ces réactions (bioénergétique);      - la physique pour la détermination de structure tridimensionnelle de macromolécules (diffraction des rayons X, résonance magnétique nucléaire);      - l'informatique pour l'analyse de séquences nucléotidiques ou d'acides aminés (alignements, recherche dans les banques de données).

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Plan du module 1 : Organisation cellulaire

Module 1 : L'organisation cellulaire

Objectif général :

Comprendre la structure et le fonctionnement de la cellule végétale.

Connaître en particulier la structure et les fonctions des plastes, de la vacuole, des membranes et de la paroi.

La cellule

Caractéristiques de la cellule

Le cytoplasme et les organites

Rôles et fonctions des constituants

La membrane

Structure chimique de la membrane

Rôles de la membrane

Les transports membranaires

Transport passif

Transport actif

Transport des macromolécules

Les plastes

Structure du chloroplaste

Fonction du chloroplaste

Amyloplaste

Chromoplaste

Evolution et différenciation des plastes

La paroi

Constituants biochimiques

Architecture biochimique

Paroi et forme cellulaire

Paroi et croissanceParoi et communications intercellulairesParoi et turgescenceParoi et spécialisation cellulaire

La vacuole

Vacuole et turgescence

Evolution du système vacuolaire

Fonctions des vacuoles

Entrez dans le module

Module 1

Module 2

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Plan du module 2 : Métabolisme cellulaire

Module 2 : Le métabolisme cellulaire

Objectif général :

Comprendre les transformations énergétiques qui ont lieu dans les cellules végétales et animales.

Comprendre le métabolisme des différents composés d’une cellule.

Connaître les principes de base de la photosynthèse.

Connaître les principes de base de la respiration cellulaire.

Introduction au métabolisme

Notion d’autotrophie

Bioénergétique

Métabolisme des divers composés

Métabolisme des glucides

Métabolisme des lipides

Métabolisme protéique

Régulation du métabolisme

La cellule chlorophyllienne

Exportation du chloroplaste au hyaloplasme

Métabolisme de la cellule chlorophyllienne

Notion d’organisme photosynthétique

La photosynthèse

Réactions photochimiques

Réactions biochimiques

La respiration

La glycolyse

Le cycle de Krebs

La phosphorylation oxydative

Bilan énergétique

Entrez dans le module

Module 1

Module 2