Çocukluk Çağı Akut Lenfoblastik Lösemide miRNA Ekspresyonlarının Tanı ve Tedavideki Önemi

1. [S25] Çocukluk Çağı Akut LenfoblastikLösemide miRNA Ekspresyonlarının Tanı ve Tedavideki Önemi MuhteremDuyu, BurakDurmaz, CumhurGündüz, CananVergin, DenizYılmazKarapınar, KaanKavaklı, NazanÇetingül, Gülersuİrken, YöntemYaman, FerdaÖzkınay, ÖzgürÇoğulu Dr. Özgür ÇOĞULU EÜTF Pediatrik Genetik BD Tıbbi Genetik AD Ege Üniversitesi Pediatrik Genetik Ege Üniversitesi Pediatrik Hematoloji Ege Üniversitesi Pediatrik Onkoloji Tıbbi Genetik Dokuz Eylül Üniversitesi Pediatrik Hematoloji Dr. Behçet Uz Çocuk Hastanesi Onkoloji ve Hematoloji 109S076 numaralı TÜBİTAK projesidir

2. Kanser Gelişimi Epigenetik Genetik • Onkogenler • Tümör supresör gen • DNA tamir mekanizması • DNA metilasyonu • Histon modifikasyonu • Mikro RNA Çevresel Etki

3. miRNA Hastalık İlişkisi • DNA dizisinde değişiklik olmaksızın gen ekspresyonlarının değişimi • Gen regülasyonunda görevli • Tek bir miRNA 200 kadar mRNA fonksiyonunu düzenleyebilir • Hedef mRNA’ları parçalayarak ya da translasyonunu baskılayarak etkin • Sayıları insanda 1500 üzerinde • Normal gelişim ve patolojik birçok hücresel işlevde etkili • Normal hücrevedokulardaprotoonkogenlerintranslasyonunuinhibeeden miRNA’lar TÜMÖR SUPRESÖR miRNA • Çeşitlerikanserhücrelerindeupregülasyon gösteren ve onkogenik aktivasyon sağlayan miRNA’lar ONKOJENİK miRNA

4. Amaç • Çocukluk çağı ALL’de • miRNAekspresyon profillerinin eş zamanlı alınan periferik tam kan ve kemik iliği örneklerinde çalışılması • Ekspresyon düzeyleri anlamlı farklılık gösteren miRNA’larıntespiti • ALL tanısı ve subtipi, risk grubu ve sağkalım ile ekspresyon profili arasındaki ilişkinin değerlendirilmesi • Tedavinin 6. ayında tekrar değerlendirilerek tedavi ile görülen değişimin ortaya konması

5. Gereç-Yöntem • 0-18 yaş arasında • Yeni tanı • 45 ALL hastası • Yaşça uyumlu kemik iliği değerlendirmesi normal 15 kontrol • Ağustos 2009-Mayıs 2010 • Prospektif • Etik kurul onayı • Bilgilendirilmiş gönüllü onam formu

6. Gereç-YöntemÇalışma Protokolü Tanı anında kan ve kemik iliği örneklerinin stabilizatör içinde alımı miRNA izolasyonu Mikroarray yöntemi (SangermiRBase V16) ile 1136 miRNA’nın ekspresyon analizi Biyoinformatik analiz (Background düzeltmesi ve normalizasyon çalışması) İstatistik analiz (foldchange değeri ± 2 kat olan değerler ile student’s t test, FDR correction) Real time RT-PCR ile konfirmasyon Altı aylık izlem sonrası real time RT-PCR ile kontrol

7. Çalışmaya dahiledilmeyen (n: 2) Sonuçlar B-ALL (n: 34) T-ALL (n: 9) L1: 29 L2: 2 L3: 3 L1: 6 L2: 3 L3: 0 Ex (n: 4) ALL (n: 45)

8. Hasta Grubunun Genel Özellikleri

9. ALL-Kontrol Upregüle: 16 Downregüle: 2

12. 0 ve 6. Ayda Ekspresyon Değerleri ALL

13. T-ALL–Kontrol Karşılaştırması 22 miRNA 16 miRNA

14. B-ALL–Kontrol Karşılaştırması 7 miRNA 2 miRNA

15. T-ALL ve B-ALL Karşılaştırması miR-708 miR-369-3p miR-145 miR-143 Life-16-3p

16. HR-ALL–Kontrol Karşılaştırması 23 miRNA 6 miRNA

17. İzlemde Eksitus Olan ALL Hastaları-Kontrol Karşılaştırması ‘Ham p değerine göre’Farklılık Gösteren miRNA’lar: FDR p<0.05 miRNA yok

18. ALL-miRNASağkalım İlişkisi • ALL grubu ve izlemde eksitus olan ALL grubunda anlamlı bulunan miRNA’lar • miR-145 ile toplam sağkalım arasında anlamlı ilişki (p<0.05) Tahmini ortalama toplam sağkalım süresi: • miR-145 downregülasyonu görülenler: 511±8.3 • miR-145 downregülasyonu görülmeyenler: 400±8.3 • miR-145 downregülasyonu görülenlerde toplam sağkalım süresi daha uzun • Hastalıksız sağkalım ile anlamlı ilişkili miRNA bulunmadı

19. ALL-miRNASağkalım İlişkisi

20. Tartışma ve Sonuç • Tüm yaşlarda lösemili olgularda çalışılan • En geniş miRNA profili • Tedavi ile ilişkisini ortaya koyan ve prospektif yapılan ilk çalışma • Çocukluk çağı ALL’de • miRNA ile yapılan çok az sayıda çalışmadan biri • Alt tipleri içine alan tek çalışma • Yeni miRNA’ların ortaya konduğu bir çalışma • Tespit edilen miRNA’larınbundan sonraki çalışmalarla ALL’de farklı alanlarda ve hastalığın patogenezindeki etkisi araştırılabilir...

21. Teşekkür Ederim