1 / 40

Иерархия белковых структур

первичная. вторичная. третичная. четвертичная. Иерархия белковых структур. Последовательность аминокислот α -спирали, β -слои, петли Мотивы Домены Многодоменный белок Белок, состоящий из нескольких полипептидных цепей (субъедениц). СУПЕРВТОРИЧЕЫЕ СТРУКТУРЫ МОТИВЫ.

lyle-robles
Download Presentation

Иерархия белковых структур

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. первичная вторичная третичная четвертичная Иерархия белковых структур • Последовательность аминокислот • α-спирали, β-слои, петли • Мотивы • Домены • Многодоменный белок • Белок, состоящий из нескольких полипептидных цепей (субъедениц)

  2. СУПЕРВТОРИЧЕЫЕ СТРУКТУРЫ МОТИВЫ

  3. Супервторичные структуры (мотивы) представляют собой определенные сочетания регулярных пространственных структур. Мотивы могут непосредственно участвовать в функционировании белка. Одна или несколько структурных единиц мотива могут формировать пространственную структуру белка. Пространственные структуры большинства белков основаны на относительно небольшом количестве общих супервторичных структур. Может быть и по другому.

  4. Супервторичные структуры (Мотивы) -шпилька (- - звено) В составе -складчатого слоя Индивидуальная β-corner Изгиб реки или дороги змейка

  5. Up and down barrel

  6. Ретинол-связывающий белок

  7. «6-лопасной пропеллер» в нейраминидазе

  8. Возможные топологии листов из 4 β-участков.

  9. МОТИВ ГРЕЧЕСКИЙ КЛЮЧ

  10. Мотив Греческий ключ 1 2 4 3

  11. Баррел на основе греческих ключей

  12. Глобулярные домены в γ-кристаллине

  13. Баррел на основе греческих ключей Up and down barrel

  14. JELLY ROLL -галактозидаза E.coli Restrict *c, 50-216

  15. Спираль-петля-спираль αα шпилька αα угол Спираль-петля-спираль

  16. E-F HAND

  17. -α- звено Укладка Россмана

  18. /-пропеллер Укладка Россмана гингипаин кинезин Restrict 1-350

  19. eight b-a motifs односторонние витки

  20. triose phosphate isomerase TIM-укладка Restrict *a

  21. ZINC FINGER C2H2 3 domains 3 sheets, 6 strands, 4 helices 1 C107-H129 CPVESCDRRFSDSSNLTRHIRIH 2 C137-H157 CRICMRNFSRSDHLTTHIRTH 3 C165-H185 CDICGRKFARSDERKRHTKIH

  22. Сиквенс-специфическое взаимодействие между ДНК и узнающей спиралью глюкокортикоидного рецептора

  23. Альбебетин. 74 АК, 8 кДа. N C Полные повторы Белки DE NOVO

  24. Свободные NH и СО Альфа и бета области Гидрофобное ядро СТРУКТУРА БЕЛКОВОЙ ГЛОБУЛЫ 1. Не менее половины гидрофобных остатков спрятано внутрь. 2. 20-30% аминокислотных остатков входит в гидрофобное ядро. 3. Не менее 90% водородных связей должны быть насыщены

  25. Каркас - плотная упаковка альфа и бета структур • Эти структуры идут от одного края глобулы до другого • Нерегулярные участки не лежат внутри глобулы

  26. Что такое домен? • Домен – это часть полипептидной цепи (или вся цепочка) , которая сворачивается независимо в стабильную третичную структуру [C.Brenden & John Tooze] • Доменами в белках называют области в третичной структуре, которым свойственна определенная автономия структурной организации [Степанов В.М.]

  27. ДОМЕНЫ Levitt, Chothia-домены,/-домены, -домены, +-домены. -ДОМЕНЫ • Длинные альфа-спирали собираются в пучки • Для коротких альфа-спиралей квазисферическая укладка вокруг гидрофобного центра.

  28. -ДОМЕНЫ Связка из 4 спиралей Глобиновая укладка Лейциновая молния

  29. А E D D А Лейциновая молния COILED COIL Левая суперспираль из 2-х правых спиралей, 3,5 остатка на виток Схема “Кнопки” 1A92 дельта – антиген вируса гепатита

  30. 1BB1 искусственный белок

  31. Комплекс между ДНК-связывающим доменом GCN и фрагментом ДНК.

  32. Связка из 4 спиралей Схема «Хребты в долинах Направление спиралей любое

  33. /-ДОМЕНЫ /-пропеллер Укладка Россмана TIM-укладка Подкова Метилмалонил-коА-мутаза

  34. HORSESHOE Porcine ribonuclease inhibitor. 1 складка, 17 стрендов, 18 спиралей.

  35. -ДОМЕНЫ Up and down barrel Баррел на основе греческих ключей Jelly roll barrel

  36. -ДОМЕНЫ b sandwiches

  37. -ДОМЕНЫ 1993 Пектат-лиаза, apr P.aeruginosa

  38. β-призма в ацилтрансферазе (а) и в пиктатлиазе (б).

More Related