1 / 7

Microarray gene expression profiling analysis combined with bioinformatics in multiple sclerosis

Microarray gene expression profiling analysis combined with bioinformatics in multiple sclerosis. К. Федоров. Рассеянный склероз. Методика. Данные : профиль экспрессии генов при рассеянном склерозе

lulu
Download Presentation

Microarray gene expression profiling analysis combined with bioinformatics in multiple sclerosis

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Microarray gene expression profiling analysis combined with bioinformatics in multiple sclerosis К. Федоров

  2. Рассеянный склероз

  3. Методика Данные: • профиль экспрессии генов при рассеянном склерозе • Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) – база знаний по систематическому анализу функций генов – pathway • UCSC – transcription factors • NCBI – chromosome annotation information

  4. Инструменты • differentially coexpressed genes and links (DCGL) package in R • Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) • Regulatory impact factor:

  5. Результаты (1) • Найдены зависимости между 42-мя транскрипционными факторами исоответствующим им 243-м генам • Найдены транскрипционные факторы, оказывающие наибольшее влияние на экспрессию генов при рассеянном склерозе

  6. Результаты (2) Определены основные метаболитические пути, соответствующие использованному профилю экспрессии генов Отношение между 5-ю транскрипционными факторами и соответствующими им генами

  7. Спасибо за внимание

More Related