Pengantar biokimia maria ulfah s si m pd jurusan pend biologi fpmipa ikip pgri semarang
Download
1 / 26

Pengantar Biokimia MARIA ULFAH, S.Si, M.Pd JURUSAN PEND.BIOLOGI FPMIPA IKIP PGRI SEMARANG - PowerPoint PPT Presentation


  • 166 Views
  • Uploaded on

Pengantar Biokimia MARIA ULFAH, S.Si, M.Pd JURUSAN PEND.BIOLOGI FPMIPA IKIP PGRI SEMARANG. Tujuan Perkuliahan.

loader
I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.
capcha
Download Presentation

PowerPoint Slideshow about 'Pengantar Biokimia MARIA ULFAH, S.Si, M.Pd JURUSAN PEND.BIOLOGI FPMIPA IKIP PGRI SEMARANG' - loring


An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Presentation Transcript
Pengantar biokimia maria ulfah s si m pd jurusan pend biologi fpmipa ikip pgri semarang

Pengantar BiokimiaMARIA ULFAH, S.Si, M.PdJURUSAN PEND.BIOLOGI FPMIPAIKIP PGRI SEMARANG


Tujuan perkuliahan
Tujuan Perkuliahan

  • Memperkenalkan bahasa biokimia: Kosakata (istilah dan struktur), tatabahasa (reaksi-reaksi), struktur kalimat (jalur-jalur metabolisme), dan pengertian (hubungan-hubungan metabolisme)

  • Mengajarkan cara mengambil intisari proses kehidupan

  • Menyarikan kesatuan konsep yang mendasari proses kehidupan

  • Menularkan hasrat mencari tahu atas hal yang akan dipelajari dan hal yang perlu diketahui


Filosofi pembelajaran
Filosofi Pembelajaran

  • Menjelaskan, bukan mengindoktrinasi

  • Menunjukkan hal yang perlu diketahui dan yang tidak perlu diketahui

  • Menghargai pertanyaan tentang hal yang belum diketahui

  • Mempelajari semua hal adalah tidak mungkin, tetapi yang lebih penting adalah mengorganisir hal yang kita ketahui agar dapat digunakan


Tentang struktur
Tentang Struktur

  • Struktur biokimia yang rumit tidak akan pernah dapat ditiru, akan tetapi hal yang perlu dipikirkan tentang struktur tersebut adalah:

    • Bagaimana konsentrasinya berubah sebagai tanggapan atas kondisi metabolisme tertentu

    • Bagaimana struktur tersebut berperan terhadap aktifitas biologisnya

    • Dalam jalur metabolisme mana senyawa dengan struktur tersebut ditemukan (dari apa/mana asal senyawa tersebut dan menjadi apa selanjutnya?)


Ciri ciri kehidupan
Ciri-Ciri Kehidupan

  • Keragaman biologis: mikroba, ganggang, lumut, tanaman, serangga, burung, monyet, kamu

  • Kesatuan kimiawi: sistem kehidupan (di bumi) mengikuti hukum fisika-kimia organik– tidak ada aturan khusus


3 kebutuhan kehidupan 1 energi perlu diketahui bagaimana
3 Kebutuhan Kehidupan:(1) ENERGI, perlu diketahui bagaimana:

  • Memperolehnya

  • Mengubahnya

  • Menggunakannya

Fig. 1-28


2 molekul s ederhana perlu diketahui bagaimana
(2) MOLEKUL SEDERHANA, perlu diketahui bagaimana:

  • Mengubahnya

  • Mempolimerasinya

  • Menghancurkannya


3 mekanisme kimia untuk
(3) MEKANISMEKiMIA, untuk:

  • Memperoleh energi

  • Mengendalikan reaksi kimia yang berurutan

  • Mensintesis & mendegradasi makromolekul

  • Mempertahankan kesetimbangan yang dinamis

  • Swa-susun struktur yang kompleks

  • Mengganda secara akurat & efisien

  • Mempertahankan keteraturan proses biokimia dalam lingkungan yang berubah-ubah


Pengantar biokimia maria ulfah s si m pd jurusan pend biologi fpmipa ikip pgri semarang
Strategi 1: Mahluk hidup menggunakan pasangan kimia untuk mengendalikan proses kimia yang normalnya tidak dapat terjadi

Fig. 1-26b




Bagaimana enzim memacu reaksi penjelasan mekanismenya
Bagaimana enzim memacu reaksi, penjelasan mekanismenya? reaksi yang biasanya lambat?

Fig. 1-22


Biomolekul komposisi
Biomolekul - Komposisi reaksi yang biasanya lambat


Atom karbon yang fleksibel adalah tulang punggung kehidupan

* reaksi yang biasanya lambat

Atom Karbon yang Fleksibel adalah Tulang Punggung Kehidupan

Fig. 1-14


Isomer kimia rumus kimia sama bentuk berbeda
Isomer Kimia reaksi yang biasanya lambatRumus kimia sama, bentuk berbeda

Fig. 1-18a


Molekul khiral bentuk putaran berbeda dengan bentuk bayangan
Molekul Khiral reaksi yang biasanya lambatbentuk putaran berbeda dengan bentuk bayangan

Fig. 1-19a


Stereoisomer rumus dan bentuk kimia sama fungsi biologis
Stereoisomer reaksi yang biasanya lambatRumus dan bentuk kimia sama – fungsi biologis

Fig. 1-23a


Perubahan biokimia dapat dikelompokkan dalam 5 kategori

* reaksi yang biasanya lambat

Perubahan BiokimiaDapat Dikelompokkan dalam 5 kategori

  • Reaksi pemindahan gugus

  • Reaksi oksidasi-reduksi

  • Penataan kembali (isomerisasi)

  • Reaksi pemotongan

  • Reaksi kondensasi


Struktur biomolekul

Senyawa penyusun reaksi yang biasanya lambat

Gula sederhana

Asam amino

Nukleotida

Asam lemak

Makromolekul

Polisakarida

Protein (peptida)

RNA atau DNA

Lipida

Anabolik

Katabolik

Struktur Biomolekul


Biosintesis membutuhkan molekul sederhana untuk digabung secara kovalen melalui berbagai cara
Biosintesis Membutuhkan Molekul Sederhana untuk Digabung secara Kovalen melalui Berbagai Cara …

3eFig. 3-25


Pengantar biokimia maria ulfah s si m pd jurusan pend biologi fpmipa ikip pgri semarang

O 3.5 secara Kovalen melalui Berbagai Cara …

Cl 3.0

N 3.0

C 2.5

P 2.1

H 2.1

Na 0.9

K 0.8

Kekuatan ikatan kimia tergantung pada1. Kelektronegativan relatif dari dua atom yang berikatanKeelectronegativantinggi = Afinitas elektron tinggi

From 3eTable 3-4


2 jumlah elektron pengikat

* secara Kovalen melalui Berbagai Cara …

2. Jumlah elektron pengikat

See Fig. 1-13


Kekuatan ikatan yang umum
Kekuatan ikatan yang umum secara Kovalen melalui Berbagai Cara …

Approx. Avg.

Triple: 820 kJ/mole

Double: 610 kJ/mole

Single: 350 kJ/mole


Gugus fungsional yang umum

* secara Kovalen melalui Berbagai Cara …

Gugus Fungsional yang Umum

Fig. 1-15


Nukleofil biologis yang penting gugus fungsional kaya elektron

* secara Kovalen melalui Berbagai Cara …

Nukleofil Biologis yang Penting: gugus fungsional kaya elektron

3eTable 3-4


Ringkasan
Ringkasan… secara Kovalen melalui Berbagai Cara …

  • Atom karbon tetrahedral memiliki sifat ikatan yang fleksibel

  • Senyawa-senyawa beratom banyak dapat memiliki beberapa bentuk isomerik

  • Pengubahan bentuk membutuhkan pemutusan ikatan-ikatan kimia

  • Molekul-molekul besar disusun dari molekul- molekul kecil melalui pembentukan ikatan kimia baru