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第九章 核酸的降解与核苷酸代谢. 本章重点与难点 重点:了解核酸的酶促降解及核苷酸合成与分解途径特点,掌握嘌呤环、嘧啶环的原子来源;了解核苷酸水解酶类,特别是限制性内切酶作用的特点。 难点:嘌呤核苷酸与嘧啶核苷酸合成途径异同点,不同种类的生物分解嘌呤碱的终产物。. 第一节 核酸的酶促降解. 食物核蛋白. 蛋白质. 核酸 (RNA 与 DNA). RNA 酶. ( 磷酸二酯酶 ). 胰核酸酶. DNA 酶. 单核苷酸. ( 磷酸单酯酶 ). 胰、肠核苷酸酶. 排出,很少利用. 核苷. 磷酸. ( 水解或磷酸解 ). 核苷酶. 戊糖或磷酸戊糖. 碱基.
E N D
本章重点与难点 重点:了解核酸的酶促降解及核苷酸合成与分解途径特点,掌握嘌呤环、嘧啶环的原子来源;了解核苷酸水解酶类,特别是限制性内切酶作用的特点。 难点:嘌呤核苷酸与嘧啶核苷酸合成途径异同点,不同种类的生物分解嘌呤碱的终产物。
食物核蛋白 蛋白质 核酸(RNA与DNA) RNA酶 (磷酸二酯酶) 胰核酸酶 DNA酶 单核苷酸 (磷酸单酯酶) 胰、肠核苷酸酶 排出,很少利用 核苷 磷酸 (水解或磷酸解) 核苷酶 戊糖或磷酸戊糖 碱基 核酸的消化
第一节 核酸的酶促降解 核酸酶 核苷酸酶 核苷磷酸化酶 核酸 核苷酸 核苷 碱基+戊糖-1-P 磷酸 一、核酸酶 二、限制性内切酶
核糖核酸酶(RNase) 脱氧核糖核酸酶(DNase) 非特异性核酸酶 核酸内切酶 核酸外切酶 一、核 酸 酶 1、核酸酶的分类 (1)根据对底物的 专一性分为 (2)根据切割位点分为 2、核酸酶的作用特点
p p p p p p p p 外切核酸酶对核酸的水解位点 B B B B B B B B 5´ OH 3´ 牛脾磷酸二酯酶( 5´端外切 蛇毒磷酸二酯酶( 3´端外切
双链核酸外切酶:核酸外切酶 III(ExoIII),特异性地从3‘ 端外切 双链核酸外切酶:l 核酸外切酶( lExo),特异性地从5‘ 端外切 单链核酸外切酶:核酸外切酶VII(ExoVII) Bal31核酸酶单链内切双链外切的核酸酶
二、限制性内切酶 细菌细胞内存在的一类能识别一定特异序列并水解外源DNA的一类酶称为限制性内切酶(ristriction endonuclease)。
(B) 宿主的限制和修饰现象 4×10 —4 1 大肠杆菌B 大肠杆菌K 1 (K) 10 — 4 E.O.P 成斑率 efficiency of plating 50年代初发现了由寄主控制的限制和修饰现象
(B) (B) 噬菌体DNA 被切割 酶切位点 不被修饰 酶切位点 被修饰 基因组DNA 不被切割 限制—修饰的酶学假说 1968年,Meselson 和Yuan发现了I型限制性核酸内切酶; 1970年,Smith和Wilcox从流感嗜血杆菌中分离纯化了第一个II型限制性核酸内切酶Hind II。
限制性核酸内切酶的类型 1. I型限制性内切酶 首先由M. Meselson和R. Yuan在1968年从大肠杆菌B株和K株分离的。 如EcoB和EcoK。 (1)识别位点序列 未甲基化修饰的特异序列。 EcoB:TGA(N)8TGCT EcoK:AAC(N)6GTGC
(2)切割位点 在距离特异性识别位点约1000—1500 bp处随机切开一条单链。 Recognize site cut 1-1.5kb (3)作用机理 需ATP、Mg2+和SAM(S-腺苷蛋氨酸)。
2. II类限制性内切酶 首先由H.O. Smith和K.W. Wilcox在1970年从流感嗜血菌中分离出来。 分离的第一个酶是Hind Ⅱ (1)识别位点序列 未甲基化修饰的双链DNA上的特殊靶序列(多数是回文序列)。 与DNA的来源无关。
(2)切割位点 识别位点处。 切开双链DNA。形成粘性末端(sticky end)或平齐末端(blunt end)。如:
(3)粘性末端(sticky ends,cohensive ends) 含有几个核苷酸单链的末端。 分两种类型: ① 5’端凸出(如EcoR I切点) 5’- GAATTC -3’ 3’- CTTAAG -5’ 5’- G AATTC -3’ 3’- CTTAAG -5’
② 3’端凸出(如Pst I切点) 5’- CTGCAG -3’ 3’- GACGTC -5’ 5’- CTGCA G -3’ 3’- -5’ G ACGTC
3. III类限制性内切酶 在完全肯定的位点切割DNA,但反应需要ATP、Mg2+和SAM(S-腺苷蛋氨酸)。 EcoP1: AGACC EcoP15: CAGCAG 用途不大。
限制性核酸内切酶的类型 主要特性 I 型 II 型 III 型 限制修饰 多功能 单功能 双功能 蛋白结构 异源三聚体 同源二聚体 异源二聚体 辅助因子 ATP Mg2+ SAM Mg2+ ATP Mg2+ SAM 识别序列 TGAN8TGCT 旋转对称序列 GAGCC CAGCAG AACN6GTGC 切割位点 距识别序列下游 距识别序列1kb处 识别序列内或附近 随机性切割 特异性切割 24-26bp处
限制性核酸内切酶的命名 限制性核酸内切酶的命名 属名 种名 株名 Haemophilus influenzae d 嗜血流感杆菌d株 H i n d IIIH i n d III 同一菌株中所含的多个不同的限制性核酸内切酶 限制酶前面要带上R(Restriction), 修饰酶前面要带上M(Modification)。
第二节 核苷酸的降解 核苷酸酶 核苷磷酸化酶 核苷酸 核苷 碱基+(脱氧)戊糖-1-P 磷酸 一、嘌呤的降解 二、嘧啶的降解
第三节 核苷酸的合成代谢 一、核糖核苷酸的生物合成 二、脱氧核糖核苷酸的生物合成 三、单核苷酸转变成核苷二磷酸和核苷 三磷酸(自学) 四、各种核苷酸的相互转变
一、核糖核苷酸的生物合成 1、嘌呤核苷酸的生物合成 (1)从头合成途径 (2)补救途径 2、嘧啶核苷酸的生物合成 (1)从头合成途径 (2)补救合成途径(自学)
1、嘌呤环上各原子的来源 来自CO2 来自甘氨酸 来自天冬氨酸 来自“甲酸盐” 来自“甲酸盐” 来自谷氨酰胺的酰胺氮
IMP的 生物合成 5-磷酸核糖胺 5-磷酸核糖焦磷酸 甘氨酸 甲酰THFA 甲酰甘氨咪核苷酸 甲酰甘氨酰胺核苷酸 甘氨酰胺核苷酸 5-氨基咪唑-4-琥珀基-甲酰胺核苷酸 5-氨基咪唑核苷酸 5-氨基咪唑-4-羧核苷酸 次黄嘌呤核苷酸(IMP) 5-氨基咪唑-4-氨甲酰核苷酸 5-甲酰氨基咪唑-4-氨甲酰核苷酸
嘌呤核苷酸合成补救途径 磷酸核糖转移酶 嘌呤+PRPP A(G)MP+PPi 嘌呤+1-P-核糖 嘌呤核苷 ATPADP A(G)MP
CTP合成酶 CTP UMP UDP UTP ATP Gln H2O 2、嘧啶核苷酸从头合成途径 1、嘧啶环上原子的来源 2、UMP的从头合成 3 、UMP转变为CTP
H2N-CO- P 嘧啶环上各原子的来源 4 C 天冬氨酸 NH3 C 5 N 3 氨甲酰磷酸 CO2 C 2 C 6 1 N
嘧啶核苷酸补救合成途径 尿嘧啶+PRPP UMP+PPi 尿嘧啶+1-P-核糖 尿嘧啶核苷+Pi UMP+ADP 尿嘧啶核苷+ATP
二、脱氧核苷酸的合成 1、脱氧核苷酸的合成 2、脱氧胸腺嘧啶核苷酸的合成
NADP+ NADPH+H+ 硫氧还蛋白还原酶 SH FAD S 硫氧还蛋白(还原型) 硫氧还蛋白(氧化型) SH S ATP 、Mg2+ P-P-CH2 P-P-CH2 N N O O + H2O OH OH OH H 核糖核苷二磷酸 脱氧核糖核苷二磷酸 核糖核苷酸的还原反应 核糖核苷酸还原酶
硫氧还蛋白 核糖核酸还原酶系 硫氧还蛋白还原酶 核糖核苷酸还原酶