1 / 15

Garcia Diego Pellecuer Marie-Agnès Roucaute Camilla

Epistasis is a fundamental component of genetic architecture of prolificacy in pigs. L’epistasie est une composante fondamentale de l’architecture génétique de la prolificité chez les porcs. Garcia Diego Pellecuer Marie-Agnès Roucaute Camilla. ULG 2006/2007. OBJECTIF DE LA RECHERCHE.

lois
Download Presentation

Garcia Diego Pellecuer Marie-Agnès Roucaute Camilla

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript


  1. Epistasis is a fundamental component of genetic architecture of prolificacy in pigs.L’epistasie est une composante fondamentale de l’architecture génétique de la prolificité chez les porcs Garcia Diego Pellecuer Marie-Agnès Roucaute Camilla ULG 2006/2007

  2. OBJECTIF DE LA RECHERCHE Démontrer que l’epistasie contribue de façon majeure à la variabilité phénotypique de la prolificité chez les porcs.

  3. Comment y parvenir…de quoi a-t-on besoin, quels outils statistiques va-t-on utiliser?

  4. MATERIEL UTILISE • 2 races de porcs: Différence significative au niveau de la prolificité ibérique meishan NBA: Nombre de porcelets nés vivants

  5. Croisements réalisés: 3 verrats ibériques (QQ) x 18 truies meishan (qq) 8 verrats F1 x 97 truies F1 (Qq) 255 truies F2 (QQ) (Qq) (qq) 881 porcelets nés vivants

  6. F0, F1, F2 génotypés pour 117 marqueurs. 109 microsatellites, 8 SNP (single nucleotid polymorphisms) QTL: Locus à effet quantitatif • Modèles mathématiques pour analyses statistiques.

  7. ANALYSES STATISTIQUES - Analyse 1: cartographie QTL à 1dimension pour déterminer les QTL influençant le caractère NBA par un test-F comparant les modèles suivants; Yijk = Hi + uj + pj + caa + cdd + eijk (1) Yijk = Hi + uj + pj + eijk

  8. Yijk = Hi + uj + pj + caa + cdd + eijk Yijk = observation ijk pour le NBA Hi = i-ème effet année-saison uj = effet polygénique du j-ème individu pj = effet de l’environnement permanentsur le j-ème individu ca= p(QQ)- p(qq) cd= p(Qq) eijk = résidu a et d= effets d’additivité et de dominance du QTL Yijk = Hi + uj + pj + eijk

  9. Tableau 1: simple QTL significatif pour le NBA G=A+D

  10. - Analyse 2 : analyse à 2 QTL Modèle 1 : sans épistasie (pas d’interaction entre les 2 QTL) Yijk = Hi + uj + pj + ca1a1+ cd1d1+ ca2a2 + cd2d2 + eijk (2) a1, d1: effets d’additivité et de dominance du QTL1 a2, d2 : effets d’additivité et de dominance du QTL2

  11. Modèle 2 : avec épistasie (avec interaction entre les 2 QTL) Yijk = Hi + uj + pj + ca1a1 + cd1d1+ ca2a2 + cd2d2 + caxaIaxa+ caxdIaxd+ cdxaIdxa + cdxdIdxd + eijk (3) Iaxa , Iaxd , Idxa , Idxd : effets d’ interactions épistatiques caxa , caxd , cdxa , cdxd : coeff. de régression

  12. Tableau 2 :

  13. CONCLUSION • Effet significatif de l’épistasie sur la prolificité. G=A+D+I • Grande difficulté d’identification des gènes influents la prolificité, et d’application pratique dans la sélection des porcs.

  14. DISCUSSION • Croisements comme alternative à la sélection saturée. • Sélection possible sur base des interactions épistatiques?

  15. Marie Diego Camilla Vous remercient !!!!!

More Related