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Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)

Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica). Nomenclatura. Reactividad del esqueleto. Desnaturalización. Daño y reparación. Enzimología básica de Acidos Nucleicos. Secuenciación y síntesis de Acidos Nucleicos. Acidos Nucléicos (estructuras). Papel moderno de DNA y RNA.

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Presentation Transcript

  1. Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica) Nomenclatura. Reactividad del esqueleto. Desnaturalización. Daño y reparación. Enzimología básica de Acidos Nucleicos. Secuenciación y síntesis de Acidos Nucleicos.

  2. Acidos Nucléicos (estructuras) Papel moderno de DNA y RNA. Fuerzas que intervienen. Flexibilidad y polimorfismo del DNA. Topología. Acidos Nucléicos y Genomas.

  3. Acidos Nucleicos Bioquímica y Biofísica

  4. Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica) Nomenclatura. Notación. Tipos de bases. RNA vs. DNA Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  5. Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica) Tautomería Bases Raras Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  6. Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica) • Reactividad del esqueleto. • H+, OH- (RNA vs. DNA). • Fragilidad mecánica y sus implicaciones. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  7. Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica) • Reactividad del esqueleto. • Despurinación. Metilación. Desaminación. Implicaciones de sustitución en anillo en la reactividad del esqueleto. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  8. Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica) Desnaturalización.Tm (Composición de bases, efecto de sal). Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  9. Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica) Desnaturalización.UV. Hipercromicidad Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  10. Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica) • Hibridación. Fenómeno notable. Utilización. • PNA Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  11. Hibridación multiple en chips Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  12. Secuenciación y síntesis de Acidos Nucleicos. • Síntesis: Problema básico resuelto (fase sólida, grupos protectores, automatización. Dinámica de la síntesis comercial). DNA vs. RNA. • Secuenciación: Métodos originales. Método actual. Métodos futuros. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  13. Síntesis Química de DNA Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  14. Secuenciación Enzimática Estado del arte: electroforesis capilar Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  15. Desarrollos futuros • Degradación enzimática (procesiva) de moleculas individuales. Depende de la detección de una sola molécula • Detección electroquímica (canales en membranas) del paso de una sola molécula. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  16. Daño y reparación. Enzimología importante. Motor de la evolución. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  17. Enzimología básica de Acidos Nucleicos. • Nucleasas (inespecíficas, restricción, dependientes de estructura o estado). Nick. Gap. • Fosfatasas, cinasas. • Ligasas • Metilasas. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  18. Papel moderno de DNA y RNA. (Papel primitivo. ¿Por qué la pregunta?) • Estructura clásica del DNA. (¿Cómo sabemos que es así? Watson y Crick fué un modelo satisfactorio.) • Medidas. • Complementaria. • Antiparalela. • Implicaciones de la estructura propuesta. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  19. Libertad Conformacional Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  20. Estructura de Acidos Nucléicos: Fuerzas que intervienen. • (¿Serán las mismas que en proteínas?). • Hidrofobicidad y apilamiento (stacking). • Puentes de hidrógeno (complementaridad estérica y dirección). Implicaciones que perfilan estructuras alternativas. • Fuerzas electrostáticas. Realmente desestabilizan. (Pensar consecuencias) Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  21. Stacking Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  22. Apareamiento de Bases Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  23. Flexibilidad y polimorfismo del DNA. • DNA A. • DNA Z. • DNA H. • Bending y kinking. • Polimorfismo e interacción proteína-DNA. (Contenido informacional de los surcos). Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  24. DNA B DNA A Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  25. DNA B DNA A Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  26. DNA Z Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  27. Telómeros Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  28. Interacción Proteína-DNA Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  29. Topología. • Loops. Cruciformes. • Lineal vs. circular (círculos efectivos). • Superenrrollamiento. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  30. Superenrrollamiento Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  31. Superenrrollamiento Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  32. Superenrrollamiento Al disminuir L, se facilitan los procesos de replicación y transcripción. Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  33. Superenrrollamiento Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  34. Estructura de RNAs (tRNA y rRNA)

  35. RNA de transferencia Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  36. RNA ribosomal Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

  37. Acidos Nucléicos y Genomas • Diversidad de tipos y tamaños. • Avance sostenido de la ciencia genómica Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

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