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Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)

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Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica). Nomenclatura. Reactividad del esqueleto. Desnaturalización. Daño y reparación. Enzimología básica de Acidos Nucleicos. Secuenciación y síntesis de Acidos Nucleicos. Acidos Nucléicos (estructuras). Papel moderno de DNA y RNA.

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Presentation Transcript
acidos nucleicos bioqu mica y biof sica

Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)

Nomenclatura.

Reactividad del esqueleto.

Desnaturalización.

Daño y reparación.

Enzimología básica de Acidos Nucleicos.

Secuenciación y síntesis de Acidos Nucleicos.

acidos nucl icos estructuras

Acidos Nucléicos (estructuras)

Papel moderno de DNA y RNA.

Fuerzas que intervienen.

Flexibilidad y polimorfismo del DNA.

Topología.

Acidos Nucléicos y Genomas.

acidos nucleicos

Acidos Nucleicos

Bioquímica y Biofísica

acidos nucleicos bioqu mica y biof sica4
Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)

Nomenclatura. Notación. Tipos de bases. RNA vs. DNA

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

acidos nucleicos bioqu mica y biof sica5
Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)

Tautomería

Bases Raras

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

acidos nucleicos bioqu mica y biof sica6
Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)
  • Reactividad del esqueleto.
    • H+, OH- (RNA vs. DNA).
    • Fragilidad mecánica y sus implicaciones.

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

acidos nucleicos bioqu mica y biof sica7
Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)
  • Reactividad del esqueleto.
    • Despurinación. Metilación. Desaminación. Implicaciones de sustitución en anillo en la reactividad del esqueleto.

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

acidos nucleicos bioqu mica y biof sica8
Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)

Desnaturalización.Tm (Composición de bases, efecto de sal).

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

acidos nucleicos bioqu mica y biof sica9
Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)

Desnaturalización.UV. Hipercromicidad

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

acidos nucleicos bioqu mica y biof sica10
Acidos Nucleicos (bioquímica y biofísica)
  • Hibridación. Fenómeno notable. Utilización.
  • PNA

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

hibridaci n multiple en chips
Hibridación multiple en chips

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

slide12
Secuenciación y síntesis de Acidos Nucleicos.
    • Síntesis: Problema básico resuelto (fase sólida, grupos protectores, automatización. Dinámica de la síntesis comercial). DNA vs. RNA.
    • Secuenciación: Métodos originales. Método actual. Métodos futuros.

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

slide13

Síntesis Química de DNA

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

secuenciaci n enzim tica
Secuenciación Enzimática

Estado del arte: electroforesis capilar

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

desarrollos futuros
Desarrollos futuros
  • Degradación enzimática (procesiva) de moleculas individuales. Depende de la detección de una sola molécula
  • Detección electroquímica (canales en membranas) del paso de una sola molécula.

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

slide16
Daño y reparación. Enzimología importante. Motor de la evolución.

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

slide17
Enzimología básica de Acidos Nucleicos.
    • Nucleasas (inespecíficas, restricción, dependientes de estructura o estado). Nick. Gap.
    • Fosfatasas, cinasas.
    • Ligasas
    • Metilasas.

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

slide18
Papel moderno de DNA y RNA. (Papel primitivo. ¿Por qué la pregunta?)
  • Estructura clásica del DNA. (¿Cómo sabemos que es así? Watson y Crick fué un modelo satisfactorio.)
    • Medidas.
    • Complementaria.
    • Antiparalela.
    • Implicaciones de la estructura propuesta.

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

libertad conformacional
Libertad Conformacional

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

estructura de acidos nucl icos fuerzas que intervienen
Estructura de Acidos Nucléicos: Fuerzas que intervienen.
  • (¿Serán las mismas que en proteínas?).
  • Hidrofobicidad y apilamiento (stacking).
  • Puentes de hidrógeno (complementaridad estérica y dirección). Implicaciones que perfilan estructuras alternativas.
  • Fuerzas electrostáticas. Realmente desestabilizan. (Pensar consecuencias)

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

stacking
Stacking

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

apareamiento de bases
Apareamiento de Bases

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

flexibilidad y polimorfismo del dna
Flexibilidad y polimorfismo del DNA.
  • DNA A.
  • DNA Z.
  • DNA H.
  • Bending y kinking.
  • Polimorfismo e interacción proteína-DNA. (Contenido informacional de los surcos).

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

dna b
DNA B

DNA A

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

dna b25
DNA B

DNA A

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

dna z
DNA Z

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

tel meros
Telómeros

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

interacci n prote na dna
Interacción Proteína-DNA

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

topolog a
Topología.
  • Loops. Cruciformes.
  • Lineal vs. circular (círculos efectivos).
  • Superenrrollamiento.

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

superenrrollamiento
Superenrrollamiento

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

superenrrollamiento31
Superenrrollamiento

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

superenrrollamiento32
Superenrrollamiento

Al disminuir L, se facilitan los procesos de replicación y transcripción.

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

superenrrollamiento33
Superenrrollamiento

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

rna de transferencia
RNA de transferencia

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

rna ribosomal
RNA ribosomal

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)

acidos nucl icos y genomas
Acidos Nucléicos y Genomas
  • Diversidad de tipos y tamaños.
  • Avance sostenido de la ciencia genómica

Acidos Nucleicos (Sección Bioquímica)