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染色体 6q13 拷贝数多态与 胰腺癌发病相关

染色体 6q13 拷贝数多态与 胰腺癌发病相关. 报告人：黄理明 导 师：林东昕 教授. 中国医学科学院肿瘤研究所. 胰腺癌临床及流行病学特点. 临床特点： 1 、病程短，进展快， 预后差 ； 2 、目前最有效的治疗方法就是 早期 根治性切除； 3 、起病 隐匿 ，根治性切除率仅 20% 。. 流行病学特点： 1 、发病水平与社会 经济 状况 有一定关系； 2 、我国胰腺癌的发病率和死 亡率均 呈上升趋势 。.

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染色体 6q13 拷贝数多态与 胰腺癌发病相关

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Presentation Transcript

  1. 染色体6q13拷贝数多态与胰腺癌发病相关 报告人：黄理明 导 师：林东昕 教授 中国医学科学院肿瘤研究所

  2. 胰腺癌临床及流行病学特点 • 临床特点： 1、病程短，进展快，预后差； 2、目前最有效的治疗方法就是早期根治性切除； 3、起病隐匿，根治性切除率仅20% 。 • 流行病学特点： • 1、发病水平与社会经济状况 有一定关系； • 2、我国胰腺癌的发病率和死 亡率均呈上升趋势。 Wang L, et al. 2005

  3. 胰腺癌发病的危险因素 确定的危险因素 可能的危险因素 年龄 糖尿病 吸烟 不良饮食习惯 慢性胰腺炎 某些职业性暴露 遗传性胰腺炎 胆囊炎或胆囊切除史

  4. 胰腺癌发病的遗传因素 研究人群 病例数量 对照数量 基因 基因功能 高加索及美国人 309 964GSTT1香烟致癌物代谢 高加索及德国人 52 235UGT1A7香烟致癌物代谢 高加索、西班牙、 365 379 NAT1 香烟致癌物代谢 非洲及北美人群 高加索及美国人 309 964 XRCC1 碱基切除修复 多人群GWAS 3851 3934ABO 血型抗原 中国人 163 337MTHFR/TS 叶酸代谢 中国人 397 907FasL/CASP8死亡受体通路 中国人 393 786 COX2 前列腺素合成

  5. 拷贝数多态的定义 拷贝数变异： copy number variation, CNV >1kb 的DNA片段 获得（插入或重复）和缺失 包含碱基数 > SNP 拷贝数多态： copy number polymorphism, CNP 人群中发生的频率 >1%

  6. 拷贝数多态与疾病关联研究

  7. SNP芯片

  8. 病例和对照的基本资料 * Two-sided 2 test.

  9. 染色体6q13拷贝数多态与 胰腺癌发病风险的关系 *Data were calculated by logistic regression, adjusted for sex, age and smoking status.

  10. Mapping breakpoint chr6:74,648,791 chr6:74,659,169 CNV精确定位 芯片粗略定位：chr6:74649185-74658419 长度：9235bp

  11. PreMod Predicted Regulatory Modules (hg17, Build 35) BLASTN align human and mouse genome Human Mouse 生物信息学分析

  12. 功能研究假设 Feuk L, et al. 2006

  13. 1000 2000 3000 4000 5000 6000 SV40 promoter Predicted Regulatory Module P-target P-control * * 报告基因实验 P<0.01

  14. 初步结论 • 染色体6q13拷贝数多态与胰腺癌发病相关 • 该拷贝数多态的具体定位： chr6:74,648,791-74,659,169 • 该区段可能包含一个负调控元件

  15. 主要参考文献 1. Wang L, et al. The changing pancreatic cancer mortality in China (1991-2000). Chin J Intern Med, 2005, 44(7):509-513. 2. Lochan R, et al. Genetic susceptibility in pancreatic ductal adenocarcinoma. Br J Surg, 2008, 95(1):22-32. 3. Wang L, et al. Genetic polymorphisms in methylenetetrahydrofolate reductase and thymidylate synthase and risk of pancreatic cancer. Clin Gastroenterol Hepatol, 2005, 3(8):743-751. 4. Xu DK, et al. Association between single nucleotide polymorphisms in the promoter of cyclooxygenase COX-2 gene and hereditary susceptibility to pancreatic cancer. Zhonghua Yi Xue Za Zhi, 2008, 88(28):1961-1965. 5. Yang M, et al. Functional variants in cell death pathway genes and risk of pancreatic cancer. Clin Cancer Res, 2008, 14(10):3230-3236. 6. Freeman JL, et al. Copy number variation: new insights in genome diversity. Genome Res, 2006, 16(8):949-961. 7. Feuk L, et al. Structural variation in the human genome. Nat Rev Genet, 2006, 7(2):85-97. 8. McCarroll SA, et al. Copy-number variation and association studies of human disease. Nat Genet, 2007, 39(7 Suppl):S37-42.

  16. 谢谢！

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