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基于蛋白质序列、结构的特征选取 和约简的耐热蛋白预测系统构建

基于蛋白质序列、结构的特征选取 和约简的耐热蛋白预测系统构建. 团队成员：王德 杨亮 付正起. 指导老师：夏静波. 答 辩 人：王德. 作品意义. 以生物信息学的方法研究蛋白质的序列、结构和功能对嗜热菌稳定性的作用，有助于解释蛋白质热稳定性的生物化学原理，加速发现耐热蛋白的规律。 有助于耐热性蛋白质在分子改良、酶工业、医药工业中的应用。. 基本思路. 实验结论. 以遗传算法进行约简后的特征向量构造的分类器取得了很好的判别效果，其判别准确率和 Matthew 相关系数分别为 96% 和 0.92. 实验结论.

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基于蛋白质序列、结构的特征选取 和约简的耐热蛋白预测系统构建

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Presentation Transcript

  1. 基于蛋白质序列、结构的特征选取 和约简的耐热蛋白预测系统构建 团队成员：王德 杨亮 付正起 指导老师：夏静波 答 辩 人：王德

  2. 作品意义 • 以生物信息学的方法研究蛋白质的序列、结构和功能对嗜热菌稳定性的作用，有助于解释蛋白质热稳定性的生物化学原理，加速发现耐热蛋白的规律。 • 有助于耐热性蛋白质在分子改良、酶工业、医药工业中的应用。

  3. 基本思路

  4. 实验结论 • 以遗传算法进行约简后的特征向量构造的分类器取得了很好的判别效果，其判别准确率和Matthew相关系数分别为96%和0.92

  5. 实验结论 • 通过特征约简算法，得出了影响蛋白质热稳定性的TOP30关键特征，如右表所示

  6. 作品创新点 1.除氨基酸组成特征、二肽组成特征外，还提取了可能影响蛋白质耐热性的物化性质特征和全局描述性特征； 2.利用遗传算法，Relief算法和Filter算法，对提取的蛋白质序列特征、二级结构特征和全局描述性特征进行适当的约简，其中以遗传算法进行约简后的特征向量构造的耐热蛋白的分类器取得了最好的判别效果，其判别准确率和Matthew相关系数分别为96%和0.92。

  7. 实际意义 根据本文构造的分类器，可以建立一个耐热蛋白预测系统在线服务器

  8. Thank you

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