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Ribozyme. 1 조 07 윤여준 08 홍효원 , 김아름 , 김청운 , 김흥덕 , 박정환 , 정진영 09 박경민 10 김주엽 , 이재성 , 현민우 11 김세희 , 윤하경. 닭 VS 달걀. DNA VS Protein. Central Dogma. RNA Splicing. 3. Ribozyme 의 종류. Group Ⅰ intron Hairpin ribozyme Hammerhead ribozyme RNase P. (1) Group I intron.
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Ribozyme 1조 07 윤여준 08 홍효원, 김아름, 김청운, 김흥덕, 박정환, 정진영 09 박경민 10 김주엽, 이재성, 현민우 11 김세희, 윤하경
3. Ribozyme의 종류 • Group Ⅰ intron • Hairpin ribozyme • Hammerhead ribozyme • RNase P
(1) Group I intron • 역할 : RNA splicing • (cleavage & ligation) • free G (guanosine) residue가 결합할 수 있는 pocket이 구조 내에 존재
Free G의 OH기의 작용에 의해 5`쪽 exon – intron 결합 끊어짐 끊어진 exon의 -OH기 작용에 의해 3`쪽 exon – intron 결합 끊어짐 Exon끼리 접합
(2) Hairpin ribozyme • TRSVsatellite RNA에서 처음 발견 • Plant virus의 satellite RNA로 존재 - Tobacco ring spot virus (TRSV) - Chicory yellow mottle virus (CYMV) - Arabis mosaic virus (ARMV)
Hairpin RNA의 Biological function-satellite RNA의 replication 촉진
Rolling circle replication Plasmid, bacteriophagegenome 등의 circularDNA, RNA & viroid의 circularRNA 복제의 기전
(3) Hammerhead ribozyme 가장 작은 RNA ribozyme Secondary structure 가 망치머리 모양 Virus의 Satellite RNA에서 처음 발견 됨 조작해서 치료물질로서 사용이 가능한 ribozyme
GUC • -가장 효과적인 절단부위 • 절단 반응 부위에 있는 NUX triplet을 가진 Oligonucleotide는 모두 hammerhead ribozyme에 의해 절단이 가능함(N=A,U,G,C/X=A,U,C) • 조작한 hammerhead ribozyme의 표적부위로 GUC를 많이 선택함
(4) RNase P • 내부 RNA가수분해 효소 • Pre-tRNA 5’말단의 염기서열을 절단해 • 성숙한 tRNA를 만듬 • tRNA만드는 모든 세포와 세포소기관 • 에 존재함 • RNase P는 RNA와 Protein subunit로 • 구성되어 있다 • Alchaea, Bacteria, Eukarya등에서 발견
RNase P ribozyme촉매에는 K+, NH4+ (1가양이온), Mg2+, Mn2+(2가양이온) 이 모두 필요함→RNaes P는 • 금속효소! • RNase P ribozyme은 직접적인 가수분해를통해서 pre-RNA를 절단해 성숙한 tRNA를 만든다.
Reference • Self-splicing RNA: Autoexcision and Autocyclization of the Ribsomal RNA Intervening Sequence of Tetrahymena (Kelly Kruger, Thomas R. Cech) • 과학동아-1982년 토머스 체크 교수의 RNA 효소 발견