Virus & Bakteri

1. Virus & Bakteri Chapter 14 Biology 11 DR. HARUN RASYID, MP

2. What are Viruses Virus adalah partikel non seluler yang terbuat dari materi genetik dan protein yang dapat menginvasi sel hidup

3. Virus ukurannya sangat kecil dan dapat melalui saringan (filter) bakteri. Ukuran virus umumnya 0,01-0,1 µ. Virus tidak dapat diendapkan dengan sentrifugasi biasa. Untuk melihat virus diperlukan mikroskop elektron.Sifat-sifat virus yang penting antara lain: 1. Virus hanya mempunyai 1 macam asam nuklein (RNA atau DNA) 2. Untuk reproduksinya hanya memerlukan asam nuklein saja. 3. Virus tidak dapat tumbuh atau membelah diri seperti mikrobia lainnyaVirus memiliki sifat-sifat khas dan tidak merupakan jasad yang dapat berdiri sendiri. Virus memperbanyak diri dalam sel jasad inang (parasit obligat) dan menyebabkan sel-sel itu mati. Sel inang adalah sel manusia, hewan, tumbuhan, atau pada jasad renik yang lain. Sel jasad yang ditumpangi virus dan mati itu akan mempengaruhi sel-sel sehat yang ada didekatnya, dan karenanya dapat mengganggu seluruh kompleks sel (bercak-bercak daun, bercak-bercak nekrotik dan sebagainya.

4. BAKTERIOPHAGE (VIRUS YANG MENYERANG BAKTERI) Virus pada bakteri coli (T-phage) terdiri atas dua bagian, yaitu bagian kepala yang berbentuk heksagonal dan bagian ekornya. Bentuk demikian itu hanya dapat dilihat pada pengamatan dengan mikroskop elektron. Bagian kepala terdiri atas bagian utama yang bagian pusatnya terdiri atas DNA; sedang bagian luarnya merupakan selubung protein yang berfungsi sebagai pelindung. Bagian ekornya berupa tubus yang mempunyai sumbat, selain itu dilengkapi pula dengan serabut ekor. Bakteri yang terserang bakteriofag akan lisis.

5. T4 Bacteriophage

6. BAKTERIOPHAGE (VIRUS YANG MENYERANG BAKTERI) Untuk mendapatkan gambaran tentang siklus hidup bakteriofag, perlu ditinjau tingkatan-tingkatan yang terjadi pada waktu phage menyerang bakteri: a. Pada permulaannya phage melekat dengan bagian ekornya pada bagian tertentu dari sel (fase adsorpsi phage pada sel) . b. DNA phage dimasukkan ke dalam sel melalui tubus ekornya, DNA phage merusak DNA bakteri sehingga proses di dalam sel dikendalikan oleh DNA phage, kemudian akan terbentuk protein (selubung) phage dan DNA phage yang baru (fase perkembangan phage). c. Fase yang terakhir ialah keluarnya partikel-partikel virus (bekteriophage) dari sel. Sel bakteri mengalami lisis (bakteriolisis/ fase pembebasan phage).

7. Herpes Virus

8. Escherichia Coli Bacterium E. coli is a bacterium. That is a crude cell, it is not a virus because viruses are protein containers with DNA cores or RNA cores.

9. E. Coli and the Bacteriophage What it looks like in real life

10. The Structure Of a Virus • Viruses are composed of a core of nucleic acid • The Nucleic acid core is surrounded by a protein coat called a capsid • The Nucleic core is either made up of DNA or RNA but never both

11. Cycle of Lytic and Lysogenic

12. VIRUS TUMBUHAN • Virus tumbuhanpadaumumnyamasukkedalamselmelaluiluka, jaditidakdapatmenerobossecaraaktif. • Di alam virus tumbuhandisebarkandenganpertolonganhewanseranggavektorataudengancara lain, misalnyatanamanCuscutadenganhaustorianyajugamemindahkan virus melaluisistemjaringanangkutannya (buluh-buluhpengangkutan). • Banyakjenis virus yang memperbanyakdiriterlebihdahuludidalamtractusdigestivushewan-hewanvektornya. • Setelahmasainkubasitertentudapatmenyebabkaninfeksipadatumbuh-tumbuhanlagi. Virus semacamitudikenalsebagai virus yang persisten. • Virus tumbuhan yang telahbanyakdipelajariadalah TMV (Tobacco Mozaic) • Virus = Virus MozaikTembakau). Bahangenetik virus iniialah RNA.

13. Plant Viruses • Tobacco Mosaic Virus (TMV) causes mottling symptoms • Rose mosaic virus • Spots on fruit • Wheat stunt virus

14. BENTUK VIRUS • Suatuvirionterdiriatasbahangenetik (RNA atau DNA) yang diselubungiolehselubung protein. • Selubung protein inidisebutkapsid. • Asamnuklein yang diselubungikapsiddisebutnukleokapsid. • Nukleokapsiddapattelanjangmisalnyapada TMV (Tobacco Mozaik • Virus yang menyebabkanpenyakitbercakdaun), Adenovirus dan virus kutil (Warzervirus); ataudiselubungiolehsuatumembranpembungkusmisalnyapada virus influenza, virus herpes.

15. BENTUK VIRUS • Kapsidterdiriatasbagian-bagian yang disebutkapsomer (misalnyapada TMV dapatterdiriatashanyasaturantaianpolipeptida, jugadapatterdiriatas protein monomer-protein monomer yang identik yang masing-masingterdiriatasrantaianpolipeptida). • Padadasarnyakapsidterdiriatasbanyaksatuan-satuandasar yang identik. Padaumumnyakapsidtersusunsimetris. • Pada TMV (suatu virus yang berbentukbatang) kapsomernyatersusundalambentukanaktanggauliran spiral. • Bentukdasar virus adalah yang bulat, silindris, kubus, polihedral, sepertihuruf T, dan lain-lain.

16. Virus structure • Viruses: Just a protein coat for protection (capsid) and a nucleic acid (RNA or DNA) for information on how to make more copies of the same virus • Cannot replicate/reproduce onits own! Needs a host…

17. Virus is a cellular parasite • Uses cell machinery of a host cell to replicate and to produce more viruses • They come in many varieties, sizes & shapes

18. Viruses cause diseases • Viruses cause numerous diseases in Plants, animals, bacteria & fungi… • Examples of human viruses: • Herpes virus • Hepatitis virus • Rabies • Ebola – emerging epidemics • Influenza (“flu”) – respiratory infection (fever, headache, chills, cough, stuffy nose, sore throat) caused by a variety of viruses. Flu season: Nov. – March. • Passed on by sneezing, coughing – air, hand-to-mouth, etc. • Vaccine helps prevent outbreaks.

19. Human Viruses • Human Immunodeficiency Virus (HIV) – causes AIDS. • Transmitted through sexual contact, sharing infected needles, blood transfusions, mother to baby. • Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) – brand new deadly virus, started in China, causes atypical pneumonia. Spreads quickly.

20. Retrovirus • Change DNA into RNA. • Example of a Retrovirus is HIV

21. A typical, "minimal" retrovirus consists of: • an outer envelope which was derived from the plasma membrane of its host • many copies of an envelope protein embedded in the lipid bilayer of its envelope • a capsid; a protein shell containing • two molecules of RNA and • molecules of the enzyme reverse transcriptase

22. Bacteria Cell

23. Bakteri merupakan mikrobia prokariotik uniselular, termasuk klas Schizomycetes, berkembang biak secara aseksual dengan pembelahan sel. Bakteri tidak berklorofil kecuali beberapa yang bersifat fotosintetik. • Cara hidup bakteri ada yang dapat hidup bebas, parasitik, saprofitik, patogen pada manusia, hewan dan tumbuhan. Habitatnya tersebar luas di alam, dalam tanah, atmosfer (sampai + 10 km diatas bumi), di dalam lumpur, dan di laut. • Bakteri mempunyai bentuk dasar bulat, batang, dan lengkung. Bentuk bakteri juga dapat dipengaruhi oleh umur dan syarat pertumbuhan tertentu. • Bakteri dapat mengalami involusi, yaitu perubahan bentuk yang disebabkan faktor makanan, suhu, dan lingkungan yang kurang menguntungkan bagi bakteri. Selain itu dapat mengalami pleomorfi, yaitu bentuk yang bermacam-macam dan teratur walaupun ditumbuhkan pada syarat pertumbuhan yang sesuai. Umumnya bakteri berukuran 0,5-10 µ.

24. Berdasarkan klasifikasi artifisial yang dimuat dalam buku “Bergey’s manual of determinative bacteriology” tahun 1974, bakteri diklasifikasikan berdasarkan deskripsi sifat morfologi dan fisiologi. • Dalam buku ini juga terdapat kunci determinasi untuk mengklasifikasikan isolat bakteri yang baru ditemukan. • Menurut Bergey’s manual, bakteri dibagi menjadi 1 kelompok (grup), dengan Cyanobacteria pada grup 20. • Pembagian ini berdasarkan bentuk, sifat gram, kebutuhan oksigen, dan apabila tidak dapat dibedakan menurut ketiganya maka dimasukkan ke dalam kelompok khusus.

25. Prokaryotes • Cells that do not have a nucleus • Exist almost every where on earth • Grow in numbers so great you can see them with the unaided eye • Are placed in either the Eubacteria or the Archebacteria Kingdoms • Make up the smaller of the two kingdoms

27. Eubacteria • Make up the larger of the two prokaryote kingdoms • Generally are surrounded by a cell wall composed of complex carbohydrates

28. Cyanobacteria • Photosynthetic bacterium • Bluish-greenish color • Contain membranes that carry out the process of photosynthesis • Do not contain the same type of chloroplasts as plants do • This bluish-greenish algae can be found nearly everywhere on earth. • Can survive in extremely hot environments and even extremely cold environment

29. Archaebacteria • Lack important carbohydrate found in cell walls • Have different lipids in their cell membrane • Different types of ribosomes • Very different gene sequences • Archaebacteria can live in extremely harsh environments • They do not require oxygen and can live in extremely salty environments as well as extremely hot environments.

30. Identifying Prokaryotes • Cell Shape • Cell Wall • Movement

31. Bacterium Shapes • Cocci~ Sphere shaped bacteria • Bacillus~ Rod shaped bacteria • Spirrillium ~ Spiral shaped bacteria • Flagella~ Leg-like structures that help to propel the bacterium.

32. Gram + and Gram – Bacterium Cell Walls

33. Cellular Walls • Chemical nature of a cell wall can be determined by Gram Staining • By finding out what color the cell produces when it is gram stained you can figure out the type of carbohydrates in the cell wall

34. Movement • Flagella ~ Tail like structure the whips around to propel the bacterium • Cillia ~ Miniature flagella surround the cell that help to “swim” • Non motile ~ Sticky cillia like structures that keep the bacterium from moving

35. Flagella

37. Bacteria and their energy • Autotrophs • Chemotrophs • Heterotrophs

38. Autotrophs • Make their own energy • Using Solar energy • Eg. Cyanobacteria

39. Chemotrophs • Make own Energy • Using Chemical energy • Eg. Archaebacteria

40. Heterotrophs • Obtain food • By eating • Eg. E-coli

41. Obligate Anaerobes Facultative Anaerobes Obligate Aerobes Live without Oxygen Can live with or without oxygen Cannot live without oxygen. Bacteria Respiration

42. Bacteria Reproduction • Binary Fission • Conjugation • Spore Formation

43. Cellular organism copies it’s genetic information then splits into two identical daughter cells

44. Conjugation • A type of Bacteria Sex • Two organism swap genetic information, that contains the information such as a resistance to penicillin

45. Spore Formation: Endospore • A type of dormant cell • Exhibit no signs of life • Highly resistant to environmental stresses such as: -High temperatures -Irradiation -Strong acids -Disinfectants • Endospores are formed by vegetative cells in response to environmental signals that indicate a limiting factor for vegetative growth, such as exhaustion of an essential nutrient.

46. Symbiosis • Close relationship between to species in which at least one species benefits from the other • Live together for LIFE

47. Parasitism • Bacteria exploit the host cell, injuring them • Eg. Mychobacterium tuberculosis

48. Mutualism • Symbiosis in which two of the species live together in such a way that both benefit from the relationship • Eg. E-coli

49. Nitrogen Fixations • Process by which nitrogen in the atmosphere is converted into a form that can be used by living things

50. THE END