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第二十章 生物能学. 一、有关热力学的一些基本概念. (一)、体系 宇宙 太阳系 地球 每个生物或非生物 化学反应体系. 能量的传递形式. (二)、能的两种形式. ?. 热. 内能 的传递方式. ?. 功. 动能、势能 转化和传递的方式 包括机械功、电功、化学功等. 体系总能量 = 可做功的能 + 不能做功的能
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(一)、体系 宇宙 太阳系 地球 每个生物或非生物 化学反应体系
能量的传递形式 (二)、能的两种形式 ? 热 内能的传递方式 ? 功 动能、势能转化和传递的方式 包括机械功、电功、化学功等
体系总能量 = 可做功的能+ 不能做功的能 (H) (自由能G) (热能)
当体系的状态发生变化后 总能量不变 变化的是G( △G) 热力学第一定律 (能量转化与守恒定律) 变化朝自由能降低的方向进行 (—△G) 热力学第二定律 (能量传递的方向性定律)
二、化学反应体系中的自由能 (一)根据自由能变化可以判断中间物质代谢方向
当反应体系恒温、恒压下发生变化时 状态 B 状态 A GB GA △G = GB — GA
① △G<0时,W>0,体系对外作功,该反应可自发进行,放能反应 • ② △G = 0时,W =0,该反应处于平衡 • ③ △G>0时,W<0,该反应不可自发进行,必须吸收外来能量才能进行(吸能反应),同时,该反应的逆过程可以自发进行。
任何状态下 △G= △GO + RTlnK △GO—这一反应在标准状态(pH=0, 25℃ 1atm)的自由能变化(标准自由能)(可查表或计算,参见《物理化学》),与反应的平衡常数有关。 K=[B]/[A] 或[B1][B2]…[Bn]/ [A1][A2]…[An] R:气体常数(1.98x10-3 kcal/mol k ) ( 8.31x10 -3 kJ/mol k) T: 绝对温度(k)
生物代谢略有不同, △GO改为△GO`(pH=7) • △G= △GO`+ RTlnK △G<0,可;=0,平衡;>0,否
例:当 磷酸二羟丙酮 与 3-磷酸-甘 油醛 平衡时, 浓度比为 0.0475(Keq) pH=7, 25℃ 1atm
该反应平衡点时: [甘油醛-3-磷酸] K= = 4.75x10-2 [磷酸二羟丙酮]
判断:当磷酸二羟丙酮为 3 x 10-6 mol/L,3-磷酸-甘油醛 为 2 x 10-4 mol/L 时,反应怎样进行?
△G= △GO`+ RTlnK 平衡时, △G= 0 K = Keq △GO`= - RTlnKeq = - 2.303RTlgKeq
△GO`= - RTlnKeq = - 2.303 x1.98x10-3 x298 x log (0.0475) = 1.81kcal/mol
△G= △GO` + RTln[产物]/[反应物] = 1.81kcal/mol +2.303 x1.98x10-3 x298 x log [3 x 10-6 mol/L (甘) / 2 x 10-4 mol/L (丙)] =-0.067 kcal/mol
(二)偶联化学反应标准自由能变化的可加性 热力学上不利的反应可以由热力学上有利的 反应所驱动 A→B△GO>0 (不能自发进行) • C→D △GO<0 (能自发进行) A+C→B+D △GO<0 (能自发进行)
三、 高能化合物 • 定义:一般将水解时能够释放21 kJ /mol(5千卡/mol)以上自由能(G’< -21 kJ / mol)的化合物称为高能化合物。 (一)功能 有着十分重要的生物意义 • 高能化合物(水解)→低能化合物 △GO<0 (能自发进行) • ———————————————————————————————— A→B△GO>0 (不能自发进行) A+高能化合物→B+低能化合物△GO<0 (能自发进行) 两反应如何可以结合在一起呢? 高能基团的传递
活化(能量增加)反应 A+高能化合物 B+低能化合物 激酶 D-葡萄糖+ATP D-6-磷酸葡萄糖+ADP 激酶 • D-6-磷酸葡萄糖比D-葡萄糖G高,更易于分解,这步活化是细胞内葡萄糖分解的第一步,也是后续葡萄糖分解的根基。 激酶——激活底物(A)连接高能键的酶 例 • 类似的活化反应十分普遍存在。
磷氧型 -O~P 磷酸化合物 磷氮型 HN =C-N~P(O) 硫酯键化合物 ~S 甲硫键化合物CH3~S+- C-C O 非磷酸化合物 ~ 高能键,水解断开,并可传递能量 (二)高能化合物的种类
1,磷氧键型(—O~P) (1)酰基磷酸化合物 乙酰磷酸 1,3-二磷酸甘油酸 11.8千卡/摩尔 10.1千卡/摩尔
酰基腺苷酸 氨甲酰磷酸 氨酰基腺苷酸
(2)焦磷酸化合物 焦磷酸 ATP(三磷酸腺苷) 7.3千卡/摩尔
(3)烯醇式磷酸化合物 磷酸烯醇式丙酮酸 14.8千卡/摩尔
2, 氮磷键型 磷酸精氨酸 磷酸肌酸(N-甲基-胍基乙酸) 10.3千卡/摩尔 7.7千卡/摩尔(虾、蟹) 这两种高能化合物在生物体内起储存能量的作用。
3,硫酯键型 酰基辅酶A 3‘-磷酸腺苷-5’-磷酸硫酸
4, 甲硫键型 S-腺苷甲硫氨酸
(三)ATP的结构特点 酸酐键 磷酯键
1、酸酐键上的P争夺电子,导致使氧桥的稳定性降低,甚至断裂。1、酸酐键上的P争夺电子,导致使氧桥的稳定性降低,甚至断裂。 2、pH=7时,ATP带4个负电荷,互相排斥。 3、产物(ADP和磷酸)比ATP稳定。
高能化合物由于内在因素本身化学不稳定(G高),水解产物稳定(G低)。高能化合物由于内在因素本身化学不稳定(G高),水解产物稳定(G低)。
(四)细胞内影响ATP水解的因素 pH( pH越高,放出的能量越多)
(五)ATP “能量中间体” • 稳定程度不同,各种高能化合物的△Go`有高低之分
活化(能量增加)反应 A+高能化合物 B+低能化合物 激酶 D-葡萄糖+ATP D-6-磷酸葡萄糖+ADP 激酶 • D-6-磷酸葡萄糖比D-葡萄糖G高,更易于分解,这步活化是细胞内葡萄糖分解的第一步,也是后续葡萄糖分解的根基。 激酶——激活底物(A)连接高能键的酶 例 • 类似的活化反应十分普遍存在。
磷酸烯醇式丙酮酸 磷酸肌酸暂时储能物质 葡萄糖6-磷酸 葡萄糖1-磷酸 作用:能量传递 转化 传递 传递
(六)磷酸肌酸和磷酸精氨酸 这两种高能化合物在生物体内起储存能量的作用 H 磷酸精氨酸(虾、蟹) 磷酸肌酸(哺乳类)
磷酸肌酸 + ADP 肌酸 + ATP △G = △G 1 + △G2 = -43.1 +30.5 = -12.6 KJ/ mol 在机体中,由于反应物和产物的浓度接近平衡点,所以,所以,当反应物或产物的量有所变化时,机体会很灵敏地进行调节,使反应朝ATP生成或磷酸肌酸生成的方向进行。磷酸肌酸被称为ATP缓冲剂。
(七)ATP断裂成AMP 和焦磷酸 焦磷酸 7.7千卡/摩尔
2 - 6.9千卡/摩尔 7.7 + 6.9 = 14.6千卡/摩尔 活化底物需要更多能量时
机械能(运动) 化学能(合成反应) 渗透能(分泌、吸收) 电能(生物电) 热能(体温维持) 光能(生物发光) ATP ADP 分解代谢 氧化产能 UTP、GTP、CTP、TTP 合成,供能 能量源自 能源物质(糖、脂、偶尔是蛋白质)的分解
(九) 能荷 [ATP]+1/2[ADP] 能 荷 = [ATP]+[ADP]+[AMP] 分母是个定值,能荷在一定范围内波动(0.8-0.95),受到机体的严格调控。