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Reaxys 搜尋使用教學 MarvinSketch 使用方式 PowerPoint Presentation
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Reaxys 搜尋使用教學 MarvinSketch 使用方式

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Reaxys 搜尋使用教學 MarvinSketch 使用方式 - PowerPoint PPT Presentation


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Reaxys 搜尋使用教學 MarvinSketch 使用方式. 搜尋設定. 設定欲搜尋化合物之角色 產物 起始物 任何位置 試劑 / 催化劑. 忽略立體結構 排除同位素 不含電荷 不含自由基 不額外加環 保持分離片段 忽略原子對應. 部分結構搜尋 完全相符 次結構 於雜原子上取代 於所有原子上取代. 消除不必要搜尋結果. 為了消除一些不必要的結果可使用以下方法 ( 尤其是在部分結構搜尋 ) 控制取代基 對於高對稱性分子,畫反應時標記反應位置 指定開、閉環之位置. 取代基控制. Reaxys 選項 :

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Presentation Transcript
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搜尋設定
  • 設定欲搜尋化合物之角色
  • 產物
  • 起始物
  • 任何位置
  • 試劑/催化劑
  • 忽略立體結構
  • 排除同位素
  • 不含電荷
  • 不含自由基
  • 不額外加環
  • 保持分離片段
  • 忽略原子對應
  • 部分結構搜尋
  • 完全相符
  • 次結構
    • 於雜原子上取代
    • 於所有原子上取代

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消除不必要搜尋結果

為了消除一些不必要的結果可使用以下方法(尤其是在部分結構搜尋)

  • 控制取代基
  • 對於高對稱性分子,畫反應時標記反應位置
  • 指定開、閉環之位置

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slide4
取代基控制

Reaxys選項:

可以有取代基:Substructure / on all atoms

無取代基:As drawn

不加取代基最快的方法就是直接加入氫。

取代基位置

取代基位置

取代基位置

  • ①選擇要加入取代基的原子
  • ②依序鍵入”.”, “s” 再鍵入取代數
  • 取代數設定(MarvinSketch)
    • *:鎖定不取代
    • 6:該原子最大取代數

April 2, 2014 Slide 4

mapping
在反應中使用Mapping功能

1

3

2

4

  • 點選在左側”1”的圖案
  • 選擇“Manual Atom Map”
  • 點選反應物的原子並拖曳
  • 拖曳至產物的選定原子
  • 原子上會出現對應標記

5

April 2, 2014 Slide 5

slide6
指定開/閉環位置

在指定位置點擊右鍵

1

選擇”Edit Bond” > “Reaction Center

2

選擇 “Make or Break”

3

April 2, 2014 Slide 6

reaxys generic group

G

G*

Any Group

Any Group

with ring closure

ACY

CYC

Cyclic

Acyclic

ABC

CXX

CBC

AHC

CHC

Carbocyclic

Heterocyclic

Cyclic,

Heteroacyclic

Carbacyclic

N

no carbon

N

N

N

N

使用舉例:烷化反應

ALK

AEL

AYL

AOX

HAR

ARY

CAL

CEL

Alkyl

Alkenyl

Alkynyl

Alkoxy

Heteroaryl(6)

Aryl

Cycloalkyl

Cycloalkenyl

N

O

Reaxys Generic Group

M:Metal

X:Halogen

Reaxys Generic Group只能擺於末端

April 2, 2014 Slide 7

reaxys generic group8
Reaxys Generic Group
  • 在左側視窗點選此圖後,即出現右圖
  • 選擇所需要的Group
  • 按下Close關閉

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slide9
多原子搜尋方式

點擊原子

點選上方圖案,出現左側圖示

選取”Atom List”

點選元素

按下Close關閉

April 2, 2014 Slide 9

slide10
鍵結種類設定

對任意鍵結按右鍵,

”Edit Bond”>”Type”

  • 單鍵 / 雙鍵 / 参鍵 / 苯環雙鍵
  • 單鍵朝上 / 單鍵朝下 / 單鍵朝上or下 / Cis or Trans / Cis or Trans or 不確定
  • 單 or 雙鍵 / 單 or 苯環雙鍵 / 雙 or 苯環雙鍵 / 任何鍵結
  • 配位鍵

April 2, 2014 Slide 10

slide11

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  • 陳建丞
  • c.chen@elsevier.com

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