2 de Octubre, 2014

1. CURSO BÁSICO BIOESTADÍSTICA Departamento de Salud Pública y Planificación Sanitaria. Unidad de Bioestadística. Mackarena Aparicio A. 2 de Octubre, 2014

2. I. Estadística La idea original de la “estadística” era la recolección de información sobre y para el “estado”. La palabra estadística se deriva directamente, no de raíces griegas o latinas clásicas, sino de la palabra italiana estado. El nacimiento de la estadística se ubica a mediados del siglo XVII. Un ciudadano común llamado Juan Graunt, nacido en Londres, comenzó a revisar la publicación semanal de la iglesia, la cual era distribuida en la parroquia local y que listaba el número de nacimientos, bautizos, y de muertes en cada parroquia. Las cifras de mortalidad también enumeraban las causas de muerte. Graunt que era comerciante organizó estos datos en la forma que hoy llamamos estadística descriptiva, la cual fue publicada como Observaciones Naturales y políticas hechas sobre tasa de Mortalidad. Luego de la publicación, fue elegido como miembro de la sociedad real. De esta forma, la estadística tomo prestados algunos conceptos de la sociología, tal como el concepto de población.

3. Análisis Exploratorio de Datos El Análisis Exploratorio de Datos o Estadística Descriptiva es examinar los datos previamente a la aplicación de cualquier técnica estadística. De esta forma el analista consigue un entendimiento básico de los datos y de las relaciones existentes entre las variables analizadas. El A.E.D. proporciona métodos sencillos para organizar y preparar los datos, detectar fallas en el diseño y recogida de datos, tratamiento evaluación de datos ausentes, identificación de casos atípicos y comprobación de los supuestos subyacentes en la mayor parte de las técnicas multivariantes. El Análisis Exploratorio de Datos utiliza técnicas gráficas y numéricas para estudiar patrones de conducta y el origen de los mismos. Las técnicas de estadística descriptiva normalmente usadas son: Distribución de frecuencia; Histogramas, Boxplot, Gráficos de dispersión, Diagramas de barras y errores, etc.

4. Análisis Exploratorio de Datos Para realizar un A. E. D. hay que seguir los siguientes pasos: Preparar los datos para hacerlos accesibles a cualquier técnica estadística. Realizar un examen gráfico de la naturaleza de las variables individuales a analizar y un análisis descriptivo numérico que permita cuantificar algunos aspectos gráficos de los datos. Realizar un examen gráfico de las relaciones entre las variables analizadas y un análisis descriptivo numérico que cuantifique el grado de interrelación existente entre ellas. Evaluar, si fuera necesario, algunos supuestos básicos subyacentes a muchas técnicas estadísticas como, por ejemplo, la normalidad, homocedasticidad, etc. Identificar posibles casos atípicos (outliers) y evaluar el impacto potencial que puedan ejercer en análisis estadísticos posteriores.

5. Preparación de los datos: Se deben hacer accesibles los datos a cualquier técnica estadística. Ello conlleva la selección del método de entrada y codificación de los datos así como la de un paquete estadístico adecuado para procesarlos. Algunos de los programas más utilizados son: SPSS, Infostat, STATISTICA, SAS, R y la planilla Excel (la cual utilizaremos en este taller). Con estos programas se pueden realizar las siguientes manipulaciones de los datos previas a un análisis: Combinar conjuntos de datos Transformar variables Eliminar casos y/o variables Ordenar casos Guardar datos y/o resultados Entre otros.

6. Análisis Estadístico Unidimensional Una vez organizados los datos, el paso siguiente consiste en realizar un análisis estadístico gráfico y numérico de las variables del problema con el fin de tener una idea inicial de la información contenida en el conjunto de datos, así como también detectar la existencia de posibles errores en la codificación de los mismos. Para iniciar el estudio del análisis estadístico se deben tener presentes algunos conceptos básicos, tales como: Población: es el universo de objetos al cual se refiere el estudio que se pretende realizar. Por ejemplo: defunciones en la región del Biobío en el año 2012. Observación o dato: cualquier valor cualitativo o cuantitativo asociado a una variable. Variable: cualquier característica objeto de estudio en la población. Se les llama variables, ya que pueden variar de un individuo a otro. Muestra: Un subconjunto de una población o universo que se selecciona para ser estudiada ya que la población es demasiado grande como para analizarla en su totalidad. Unidad de muestreo: Son los objetos básicos sobre los cuales se ejecuta el estudio o experimento, por ejemplo: una persona, un animal, una planta, etc.

7. Variables Cualitativas y Cuantitativas El tipo de análisis a realizar depende del tipo, y la escala de medida de la variable a analizar. Se distinguen dos tipos de variables: cualitativa y cuantitativa. Una variable cualitativa es aquella cuyos valores corresponden a conceptos, categorías, atributos o cualidades como, por ejemplo: sexo, profesión, estado civil, nivel escolaridad, etc. Si en dichas categorías hay un orden subyacente se denomina variable ordinal, si no se denomina variable nominal. Una variable cuantitativa es aquella que se puede expresar numéricamente, es decir, pueden tomar valores reales. Este tipo de variables se puede clasificar según el tipo de valores que pueden tomar. Existen dos clasificaciones, variables cuantitativas discretas que son aquellas donde el conjunto de valores que puede asumir la variable se puede enumerar, por ejemplo: número de hijos de la madre. Las variables cuantitativas continuas con aquellas que pueden asumir cualquier valor en un intervalo real, por ejemplo: peso del hijo al nacer.

8. Creando tablas de frecuencias Para comprender y resumir los datos, es útil representarlos en una tabla o gráficos en la que aparezca los valores posibles de la variable, llamados clases, . La frecuencia absoluta es el número de veces que aparece un determinado valor en un estudio estadístico, el cual es representado por . La suma de las frecuencias absolutas es igual al número total de observaciones, que se representa por Donde k es el número de clases. La frecuencia relativa, es el cociente entre la frecuencia absoluta de la clase y el número total de observaciones N. La suma de la frecuencia relativa es 1

9. Creando tablas de frecuencias La frecuencia acumulada, es el número de elementos de la población o muestra cuya modalidad es inferior o equivalente a la modalidad , es decir, es la suma de las frecuencias absolutas de la clase y las anteriores a ella, La frecuencia relativa acumulada, es el cociente entre la frecuencia acumulada de una clase y el número total de datos. Se puede expresar en tantos por ciento.

10. Calculando marca de clases No existen criterios óptimos para elegir la cantidad de intervalos. En general, entre 5 y 15 intervalos deberían ser suficientes. Para calcular la marca de clases: Para decidir el número de intervalos o clases, se puede utilizar como referencia: si n no es grande , en otro caso Localizar la observación mínimo y máximo. Hallar la diferencia entre estos dos valores , denominado como rango. Hallar la amplitud de la clase , se define como Así la división en clases o intervalos podría tomarse:

11. Calculando marca de clases Hallar la marca de clases de cada intervalo. Se define por:

12. Creando tablas de frecuencia con base de datos de Enfermedades de Notificación Obligatoria (ENO) N=1676 Variable cuantitativa discreta: Edad

13. Creando tablas de frecuencia con base de datos de Enfermedades de Notificación Obligatoria (ENO) N=1676 Variable cualitativa nominal: Grupo Minsal

16. II. Calculando Tasas Una de las actividades que se realiza con mayor frecuencia dentro de los profesionales de la salud pública es la comparación de tasas de algún evento o característica entre dos o más poblaciones, Schoenbach. (1999). Se pueden calcular distintos tipos de tasas, tales como: mortalidad, incidencia, prevalencia, fecundidad, entre otras. Definiciones de las tasas más utilizadas en Salud Pública: Prevalencia: corresponde al número de casos existentes de una enfermedad o condición en una población determinada. Se multiplica por 100.000 habitantes. Incidencia: corresponde al número de casos nuevos de una enfermedad en la población en un período de tiempo determinado. Se multiplica por 100.000 habitantes.

17. II. Calculando Tasas Mortalidad: Corresponde al número de personas que fallecen en un lugar y tiempo determinado respecto al total de la población en riesgo. Se multiplica por 100.000 habitantes. Letalidad: Corresponde al número de personas que fallecen en un lugar y tiempo determinado en relación a los afectado por la misma enfermedad. Se multiplica por 100, ya que es una proporción. Fecundidad: corresponde a la relación que existe entre el número de nacimientos ocurrido en un cierto periodo de tiempo y la cantidad de población femenina en edad fértil en el mismo periodo. Se suele calcular en el período de un año. Natalidad: corresponde a la cantidad de niños que nacieron en un determinado año en una cierta población. La tasa se calcula por cada 1.000 habitantes.

18. II. Calculando Tasas Ejemplo: Tasa de mortalidad por cáncer de mama en el año 2011

19. II. Calculando Tasas Ejemplo: Tasa de mortalidad por tumor maligno (CIE 10: C00-C97) Quinquenio 2008-2012

20. III ¿Qué es un brote o una epidemia? Cuando una enfermedad o evento relacionado con la Salud, supera o excede la frecuencia usual en una población específica, en un lugar y en un período de tiempo determinado, hablamos de Brote o Epidemia. Para poder definir en la práctica una Epidemia debemos conocer los conceptos de : Canal Endémico o Curva Endémica Índice Endémico

21. Curva Endémica o Canal Endémico Para saber que estamos en presencia de una "frecuencia inusual" de un evento debemos conocer cuál es la "frecuencia esperada" del mismo para la población de interés en el tiempo y lugar estudiado. Para esto se elaboran los corredores endémicos. Éstos consisten en gráficos elaborados a partir de la frecuencia del evento en estudio de por lo menos 5 años endémicos. En líneas generales, diremos que para elaborar un corredor endémico recolectamos la frecuencia de casos de la patología en estudio en cada semana epidemiológica o mes (según la patología de la cual se trate) de los últimos 5 años endémicos.

22. Curva Endémica o Canal Endémico Es un patrón de comportamiento, expresa la distribución típica de una enfermedad durante un año cualquiera, captura la tendencia estacional de la enfermedad y representa el comportamiento esperado de dicha enfermedad en un año calendario. Propósito: le sirve a la vigilancia epidemiológica para detectar precozmente variaciones significativas en el patrón de comportamiento habitual de las enfermedades, rápida y eficazmente.

23. Curva Endémica o Canal Endémico Para la elaboración de un canal endémico se requiere: Contar con las frecuencias semanales o mensuales de la enfermedad correspondiente a una serie de 5 a más años. El canal ideal es el semanal, los mensuales limitan la posibilidad de detectar oportunamente los brotes y por tanto la implementación de medidas de control oportunas. Frecuencia de casos semanales o mensuales correspondiente al año actual. Elementos: La curva endémica propiamente dicha o canal endémico: frecuencia esperada promedio de casos en cada unidad de tiempo del año calendario (Mediana, Media, etc.) El límite superior, o umbral epidémico: línea superior del gráfico, representa la frecuencia esperada máxima de casos. (3º cuartil, desviación estándar, etc.) El límite inferior, o nivel de seguridad: la línea inferior del gráfico, representa la frecuencia esperada mínima de casos. (1º cuartil, desviación estándar, etc.)

24. Curva Endémica o Canal Endémico

25. Cálculo de Curva Endémica o Canal Endémico Ejemplo:

26. Índice Endémico Es la razón entre el número de casos presentados en una semana epidemiológica dada y los que se esperan (según la mediana de los 5 últimos años) para la misma semana. Índices entre 0,75 y 1,24 se consideran esperables. Por sobre 1,25 la incidencia es sobre lo esperado.

27. Ejemplo: Datos ordenados: Noviembre: 15 17 18 20 22 Para el mes de Noviembre, la mediana es 18, por lo tanto, si tenemos en el año 1996 en el mes de Noviembre 21 casos, el índice endémico sería 1,16. Por lo tanto estaríamos en presencia de una incidencia esperada, ya que no supera el umbral de 1,24.

28. ¡¡GRACIAS!!