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Western blotting. 让我们把蛋白质看作具有独特而奇妙性质的实体. 为什么要作蛋白质印迹实验? 研究一些体外的蛋白质分子,寻找目的蛋白是否存在样品当中 蛋白质的表达情况,上调或下调表达,在不同的样品中,如疾病和正常的样品之间的表达差异性。. 定义:. 印迹法( blotting )是指将样品转移到固相载体上,而后利用相应的探测反应来检测样品的一种方法。 1975 年, Southern 建立了将 DNA 转移到硝酸纤维素膜( NC 膜)上,并利用 DNA - RNA 杂交检测特定的 DNA 片段的方法,称为 Southern 印迹法。
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Western blotting 让我们把蛋白质看作具有独特而奇妙性质的实体
为什么要作蛋白质印迹实验? • 研究一些体外的蛋白质分子,寻找目的蛋白是否存在样品当中 • 蛋白质的表达情况,上调或下调表达,在不同的样品中,如疾病和正常的样品之间的表达差异性。
定义: • 印迹法(blotting)是指将样品转移到固相载体上,而后利用相应的探测反应来检测样品的一种方法。 • 1975年,Southern建立了将DNA转移到硝酸纤维素膜(NC膜)上,并利用DNA-RNA杂交检测特定的DNA片段的方法,称为Southern印迹法。 • 而后人们用类似的方法,对RNA和蛋白质进行印迹分析,对RNA的印迹分析称为Northern印迹法,对单向电泳后的蛋白质分子的印迹分析称为Western印迹法,对双向电泳后蛋白质分子的印迹分析称为Eastern印迹法 Towbin, H., et al. (1979). Electrophoretic transfer of proteins from polyacrylamide gels to nitrocellulose sheets: procedure and some applications. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 76, 4350-4354.
Western Blot基本原理 在电场的作用下将电泳分离的多肽从凝胶转移至一种固相支持体,然后用这种多肽的特异抗体来检测。
Western Blotting 方法一: 直接法 • 优点: • 1.快速(一种抗体) • 2.没有二抗交叉反应引起的非特异性条带 • 缺点: • 1.免疫反应性降低 • 2.无信号二级放大 • 3.抗体标记费时昂贵,使用不方便
Western Blotting 方法二: 间接法 • 优点: • 1. 免疫特异性不受标记影响 • 2. 信号放大灵敏度高(多个二抗结合位点) • 3. 多种标记的二抗可供选择 • 4. 可选择不同的Marker • 缺点: • 1. 交叉反应引起的非特异性条带 • 2. 额外的二抗孵育以及条件优化
Western Blot一般流程 • 蛋白样品的制备 • SDS聚丙烯酰胺 凝胶电泳 • 转膜 • 封闭 • 一抗杂交 • 二抗杂交 • 底物显色
Western Blotting 设计选择 • 分子量标准 • 内参 • 膜 • 转膜和封闭 • 抗体 • 显色
不可小看“蛋白标准”--分子量标准的选择 • 预混分子量标准 • 高分子量标准 • 低分子量标准 • 宽分子量标准 • 预染分子量标准 • 单色预染 • 多色预染 • 修饰分子量标准
预混分子量标准 • 高分子量标准 • 低分子量标准 • 宽分子量标准
预染分子量标准 • 单色预染 • 多色预染
修饰分子量标准 • 糖基化 • 磷酸化 • 荧光标记
不可不加--内参的选择 • 原因:校正蛋白质定量、上样过程中存在的实验误差 • 种类:GAPDH、beta-actin、beta-tubulin • 用法: • 二抗孵育时加入HRP标记内参抗体 • 分子量相差不大 • 分子量大小相差比较明显
原料是基础--膜 • 选择种类 • NC • PVDF • 尼龙膜 • 选择标准 • a.膜与目的蛋白分子的结合能力(也就是单位面积的膜能结合蛋白的载量),以及膜的孔径(也就是拦截蛋白的大小); • b.不影响后续的显色检测(也就是适和用于所选的显色方法,信噪比好); • c. 后继实验有其他要求,比如要做蛋白测序或者质谱分析,还要根据不同目的来挑选不同的转移膜
抗体的选择 • 作为western来讲,理论上单抗比多抗的特异性要好,但单抗种类较少一般价格偏高,所以一般来说多抗足够了。用于western的抗体和用于ELISA的抗体,一般来说用于western的抗体识别的是氨基酸序列特异性;而可用于ELISA的抗体则要看抗原种类,有些是识别氨基酸序列特异性,有些是识别构像特异性。所以一般根据抗体说明书来确定。 做免疫印迹时选择抗体主要应考虑两个问题,一是所选抗体是否能识别凝胶电泳后转印至膜上的变性蛋白,另一个是所选抗体是否会引起交叉反应条带。
八仙过海,各“显”神通--显色方法 • 化学显色法 : 方便、便宜、有毒、灵敏度较低、费抗体、反应慢、线性窄、不易保存、不能重新剥离检测 • 化学发光法 : 灵敏、快速、节省抗体、反应快、线性宽、无害、特异性高、可重新剥离检测 • 同位素法 : 灵敏度高、不安全、环境污染、不方便和半衰期短 • 荧光底物法: Krypton ™荧光底物
掌握 • Western blotting的原理和主要步骤。 谢谢