450 likes | 605 Views
转基因生物安全性检测评估共享服务平台 ( 06DZ22908 ) 实施方案及进展 梁婉琪 上海交通大学,上海食品药品监督所, 农业部转基因植物环境安全监督检验测试中心(上海), 上海出入境检验检疫局,上海大学. 目录. 计划任务书实施方案. 专家论证意见扫描图片. 项目实施方案调整 ( 1 ). 原计划中的四个平台合并为一个平台. 样品检测服务平台. 转基因生物检测 新方法验证. 转基因生物 检测技术远程培训. 标准物质在线查询和订购平台. 转基因生物检测在线服务平台. 项目实施方案调整 ( 2 ). 风险交流 信息. +.
E N D
转基因生物安全性检测评估共享服务平台(06DZ22908)转基因生物安全性检测评估共享服务平台(06DZ22908) 实施方案及进展 梁婉琪 上海交通大学,上海食品药品监督所, 农业部转基因植物环境安全监督检验测试中心(上海), 上海出入境检验检疫局,上海大学
项目实施方案调整 (1) 原计划中的四个平台合并为一个平台 样品检测服务平台 转基因生物检测 新方法验证 转基因生物 检测技术远程培训 标准物质在线查询和订购平台 转基因生物检测在线服务平台
项目实施方案调整 (2) 风险交流 信息 + 转基因生物安全公众教育平台 = 转基因生物安全性风险交流与生物安全平台 原计划中的公共教育部分增加了风险交流信息
项目实施方案(调整后) 项目在执行过程中,将整个共享服务平台划分为4个子系统平台,首先独立建设单个独立的子平台,然后利用计算机数据库模块,将4个子平台连接成一个完整的转基因生物安全检测评估共享服务平台。 • 全球商业化转基因生物安全性评价和商业化信息查询检索平台 • 转基因生物检测技术标准方法查询检索平台 • 转基因生物检测在线服务平台 • 转基因生物安全性风险交流与公众教育平台
政府部门 ENGL Rikilt 监管 数据交换共享 数据交换共享 上海转基因生物安全性检测评估共享服务平台 项目调整后,总体结构图示 全球商业化转基因生物安全性评价,商业化信息检索平台 转基因生物检测技术 标准方法查询检索平台 转基因生物检测 在线服务平台 转基因生物安全性 风险交流与公众教育平台 服务对象: 相关科研机构、事业单位、企业 普通大众
全球商业化转基因生物安全性评价和 商业化信息查询检索平台建设 平台提供已批准商业化的近130种转基因植物种类、类型、主要商业化种植国家和地区、外源基因类型、外源插入载体整合情况和拷贝数、外源目的蛋白表达量、基因漂流风险、对非靶标生物影响、食品安全性评价等信息
数据库目前已录入: 转基因品系共129条记录 308条插入基因信息 30常见基因来源、作用机理信息 450条商业化信息记录 526个各国审批文档 51个国家地区相关法规 约50个品系包含详细的中文介绍,与环境安全性评价信息 检索界面已经完成,所有数据均可动态显示。 本平台已基本完成,调试中 数据库地址:http://202.120.45.10:7500/database.php
下一步主要工作为: 数据的补充与完善, 发布到网上,请专家提出改进意见
基本界面 检索界面 (已实现多种关键词的联合检索) 数据库包含的转基因生物安全性评价和商业化信息 Agbios界面
与Agbios的比较 较Agbios添加了插入元件的图示 Agbios 点击该基因, 弹出的窗口 平台数据库 插入基因的信息 Agbios关于插入基因及其表达产物的信息量较少 较Agbios添加了大量插入基因、蛋白序列等相关信息
与Agbios的比较 平台数据库 Agbios 我们的数据库主要采用表格的形式,对食品安全性评价信息进行归类整理,增加了信息的条理性,更加直观、易读。 回到主结构示意图
转基因生物检测技术标准方法查询检索平台建设转基因生物检测技术标准方法查询检索平台建设 目前检测方法主要分为核酸检测方法和蛋白质检测方法两类:其中以核酸为基础的检测方法涉及四个层次,即筛选、基因、构建和品系特异性PCR检测方法。 为了加强转基因检测方法的国际交流,本平台使用英语界面,收集了主要商业化转基因生物(大豆、玉米、油菜、棉花、马铃薯和番茄等)几乎所有公开发表的检测方法(包括文献、欧盟验证报告、中国及国际标准),并进行了详细的分类。
目前已基本完成,调试中 数据库已录入: 250对PCR引物信息,并进行了详尽的分类 20个内标准基因的基本信息 34条插入序列信息 30种蛋白检测方法 70条质粒信息(其中包括目前公开发表的9个标准分子) 85条标准物质信息 共涉及110篇文献 所有功能已经实现,正在调试阶段,最后界面正在完善中 筛选特异性 定性 基因特异性 核酸方法 定量 构建特异性 chip 品系特异性 数据库地址:http://202.120.45.10:7500/detect 包括公开发表文献 欧盟验证报告 国家标准、ISO标准 Zein, zssIIb, hmga, Ivr1, Adh1, lec, BnACCg8, HMG I/Y, apx, lat52, sad1, sps, gos9, oriazain, UGP, hordein, acc1, PKABA1, waxy-D1, helianthinin, cruciferin, SAH7, fsACP
基本界面 插入元件图示 检索界面 引物详细分类
内标准基因及引物链接 标准分子信息 蛋白检测方法 标准物质
自动生成的引物匹配图示 用户注册界面
网站针对普通注册用户的提交界面 回到主结构示意图
会员服务平台总体结构: • 平台内部信息检索功能 • 样品检测服务 • 新方法验证 • 检测技术培训 • 标准分子服务 • 相关的后台控制功能
会员服务平台已经初步建设成功: • 网络平台调试环境已搭建好,使用Tomcat + MySQL + J2EE + Ajax • 目前正由上海大学派具有相关工作经验的专人负责这一部分平台的搭建。
工作进展相关功能正在紧锣密鼓的开发之中……工作进展相关功能正在紧锣密鼓的开发之中…… • 网站架构使用web 2.0相关技术。 • 大量使用开源组织的框架。其中使用的struts,spring,和hibernate框架,是这两年刚出现的,最新,最好的开源框架。 • 把最流行的计算机技术和我们的平台最好的结合起来。
会员服务平台主要包括: • 平台内部信息检索功能 • 样品检测服务 • 新方法验证 • 检测技术培训 • 标准分子服务 • 相关的后台控制功能
平台内部信息检索功能 • 利用各类互联网资源,丰富我们的平台。 在这里输入相关的文字就能检索
会员服务平台主要包括: • 平台内部信息检索功能 • 样品检测服务 • 新方法验证 • 检测技术培训 • 标准分子服务 • 相关的后台控制功能
样品检测服务 • 已建立近20种转基因生物检测技术方法 • 服务上海及全国食品企业、政府监管部门。
样品检测服务(提供相关视频录像) • 向社会各界介绍我们实验室的样品检测实力与相关技术。并欢迎各界与我们交流合作。 • 正在制作检测方法的DV,届时可供大家下载,观看。
申请者 书面形式 未通过 重新提交申请 平台为申请者 提供一个 项目专用账号 申请者可使用该账号 查询验证实验进程 接收 (第一步) 可能需要进一步补充信息 可能需要进一步补充信息 申请未通过 平台内部专业人员对该方法进行科学初次评估, 并建立相应文档 (第二步) 对照样品及网上提交相关数据 平台组织人员对样品及方法进行检测验证 (第三步) 协同试验 (第四步) 最终报告 (第五步) 申请通过 网上提交方法及相关数据 国外已通过多实验室验证的方法
会员服务平台主要包括: • 平台内部信息检索功能 • 样品检测服务 • 新方法验证 • 检测技术培训 • 标准分子服务 • 相关的后台控制功能
新方法验证服务----我们的优势 • 与欧盟的密切合作关系 • 申请单位价值2000多万元的专业器材 • 提供一套完成的GMO安全性检测方法 荧光定量PCR仪(Rotorgene 3000、PE7300、PE7000等)共计6台、PCR超净工作台12台、水平电泳仪、垂直电泳仪、超低温冰箱、高速低温离心机12套、组织培养系统10套、样品研磨混合系统6套、小型温室3个、显微镜及成像系统12个、以及计算机和有关分析标准软件等转基因产品检测的设备
新方法验证服务----具体内容 • 可及时查看新方法验证进程 • 每个合作单位都有自己的账户,可以提交他们的新方法。 • 我们实验室验证他们提交的方法。 • 并反馈验证结果。
会员服务平台主要包括: • 平台内部信息检索功能 • 样品检测服务 • 新方法验证 • 检测技术培训 • 标准分子服务 • 相关的后台控制功能
检测技术在线或现场培训 • 在线下载我们实验室编写的,GMO安全性和检测方法操作手册与流程。 • 在线浏览或下载欧盟的培训手册及相关视频 • 欢迎各界同仁来实验室观摩、学习、交流
会员服务平台主要包括: • 平台内部信息检索功能 • 样品检测服务 • 新方法验证 • 检测技术培训 • 标准分子服务 • 相关的后台控制功能
标准分子服务 • 添置高档仪器,标准化制备标准分子。 • 向全世界提供,我们实验室的标准分子信息。并参与全球合作之中。
标准分子服务 • 让公众检索我们已整理的标准分子 • 可从我们平台直接获得免费产品目录 • 如有需要,我们还能提供邮寄标准分子的服务 标准分子详细信息
会员服务平台主要包括: • 新闻系统,暨公众教育 • 平台内部信息检索功能 • 样品检测服务 • 新方法验证 • 检测技术在线或现场培训 • 标准分子服务 • 相关的后台控制功能 回到主结构示意图
风险交流与公众教育平台: • 风险交流(新闻系统) • 公众教育
新闻系统 • GMO的安全性,众所纷纭。 • 科学引导,削除顾虑。
公众科普教育 • 介绍上海GMO相关信息: • 全球转基因植物大规模商业化种植,大量涌入上海乃至全国市场,对我国农业发展和转基因产品安全管理构成了巨大挑战。
公众科普教育平台 • 介绍世界各国及各个国际组织对GMO的态度:
新闻录入系统 利用互联网的无线延伸性,与先进的计算机编程技术。及时方便的发布我们的新闻内容。 相关的新闻录入系统!(仿word界面设计,能够在浏览器上实现office的功能)
新闻阅读 • 主题鲜明的新闻阅读部分。