cap 4 prote na estructura y funci n
Download
Skip this Video
Download Presentation
Cap 4 Proteína: Estructura y Función

Loading in 2 Seconds...

play fullscreen
1 / 51

Cap 4 Proteína: Estructura y Función - PowerPoint PPT Presentation


  • 130 Views
  • Uploaded on

Cap 4 Proteína: Estructura y Función. JA Carde, PhD Universidad Adventista Alberts et al. Proteínas. Genes expresados: todo lo que se ve o se mide Funciones- formas, estructuras, enzimas Canales Bombas Mensajeros Movimientos Defensa Luminiscencia

loader
I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.
capcha
Download Presentation

PowerPoint Slideshow about ' Cap 4 Proteína: Estructura y Función' - claudia-clay


An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Presentation Transcript
cap 4 prote na estructura y funci n

Cap 4 Proteína: Estructura y Función

JA Carde, PhD

Universidad Adventista

Alberts et al.

prote nas
Proteínas
  • Genes expresados: todo lo que se ve o se mide
  • Funciones- formas, estructuras, enzimas
    • Canales
    • Bombas
    • Mensajeros
    • Movimientos
    • Defensa
    • Luminiscencia
    • Panel 4-1 :multiplicidad de funciones
04 01 peptide bonds jpg
Covalente
  • Condensación
  • Polipéptidos
  • Cadenas de AA
04_01_peptide bonds.jpg
prote nas1
Proteínas
  • Esqueleto polipeptídico
  • Grupos R de los 20 AA
  • No polares
  • Con cargas
  • Panel 2-5 - Estructuras de los AA
  • Nombres y abreviaturas Fig 4-3
04 04 noncovalent jpg
Enlaces NO covalentes04_04_noncovalent.jpg

Enlaces de H

Enlaces iónicos

Van der Waals

Interacciones hidrofóbicas

04 05 hydrophobic jpg
Interacciones hidrofóbicas

Distribución de grupos polares vs no polares

04_05_Hydrophobic.jpg
04 07 denatured prot jpg
Conformación - energía mínima04_07_Denatured prot.jpg
  • AG mínimo
  • Denaturar - alterar fuerzas no covalentes
  • Renaturar
  • al renaturar la molécula readquiere la conformación: toda la informacion necesaria esta en la secuencia lineal de AA
  • Alzheimer?
04 08 prion diseases jpg
04_08_Prion diseases.jpg

Priones

Vacas locas

CJD

Misfolding= infection

Convierte normales en anormales

Chaperonas

La forma 3D esta en la secuencia no en las chaperonas

proteinas
Proteinas
  • Macromoléculas de mayor diversidad estructural
  • De 30 a 10000 AA (50-2000)
  • Formas: globulares, fibrosas, anulares esferas, hojas
  • Como se obtiene la estructura de una proteína o la secuencia de AA?
  • Lisar celulas > purificar proteínas > secuenciar >
  • Insulina 1955
  • Hoy : Bioinformática
  • Molecular Toolkit- para traduccion in silico
caracterizaci n
Caracterización
  • determinar secuencia
  • Conformación 3D - no sabemos predecir
  • Cristalografía de Rayos X
  • Nuclear Magnetic Resonance (NMR)
  • Phosphocarrier HPrp
  • Panel 4-2
  • A) esqueleto c) cable
  • B) cinta d) space filling
patrones de dobleces
Patrones de Dobleces
  • Son patrones repetidos en las proteínas
  • Hélice alfa - keratina
  • Placa beta - fibrosina
  • Son el resultado de enlaces de H entre el N-H y el C=O del esqueleto peptídico (NO el grupo R)
  • Forman estructura repetitiva
04 10 1 alpha h beta s jpg
04_10_1_alpha h. beta s.jpg

1 vuelta/3.6aa cada 4 enlace péptido

C=O |||||||| N-H

04 14 helix jpg
04_14_helix.jpg

Hélices: en estructuras biologicas

Patrones repetitivos

04 15 ahelix lip bilayer jpg
04_15_ahelix_lip_bilayer.jpg

Hélices en regiones transmembranales

Canales o recepores

Parte hidrofílica escondida por grupos R no polares

04 16 coiled coil jpg
Coiled/Coil

Pares de hélices enrolladas entre si

Aa polares en un lado

AA no polares aglomerados entre sí

04_16_coiled-coil.jpg
04 10 2 alpha h beta s jpg
04_10_2_alpha h. beta s.jpg

Enlaces H intracadenas paralelas o antiP

04 17 2 beta sheets jpg
Placas B

Estructuras rígidas

Enlaces de H intercadenas

Forman “core” núcleos de proteínas

Dan resitencia tensión

Pueden ser paralelas o antiP

04_17_2 beta sheets.jpg
niveles de organizacion
Niveles de Organizacion
  • nivel 1rio - cadena lineal de AA
  • Nivel 2rio - hélices o placas, dobleces, segmentos de la proteina
  • Nivel 3rio - 3D, completa: hélices, placas,” random coils”, lazos y dobleces desde el N hasta el C
  • Nivel 4rio - cuando la proteína esta compuesta por más de un polipeptido, dos polipéptidos o 3 o 4 interactuando para formar una proteína
04 19 functiondomains jpg
Dominios - nivel de organización superior,

Cualquier segmento de polipéptido que:

04_19_functiondomains.jpg

Doble independiente

Estructura estable-compacta

Forme unidad modular

Tenga funciones independientes

04 20 protein domains jpg
3 Dominios distintos:04_20_protein domains.jpg

Cyt-b NAD binding domain Region Var de AB

04 21 serine proteases jpg
Familias de Proteínas: relación estructural aunque no funcional

Proteasas de serina: comparten AA, y estructura 3D; pero…

04_21_Serine proteases.jpg
estructura 4ria
Estructura 4ria
  • más de una cadena polipeptídica
  • Enlaces no covalentes
  • Binding site - región en la proteína donde interactúa alguien más
  • Subunidad - cada polipéptido de una proteína de estructura 4ria
  • Dominios- regiones en cada SubU
  • Dímeros
04 24 complexstructure jpg
04_24_complexstructure.jpg
  • Otros Arreglos:
  • Dímeros, hélices, anillos
  • Filamentos
  • Capas
  • Esferas
04 27 viral capsids jpg
Tomato, bushy stunt virus

Ensamblajes esfericos de proteinas

04_27_Viral capsids.jpg
04 30 selective binding jpg
Como trabajan las proteinas?

Forma / Función

04_30_selective binding.jpg
  • Uniéndose a otras moléculas
  • AB
  • ATPasa
  • Actina
  • Especificidad - ligando

Unión por enlaces NO covalentes

Topología y contornos

04 31 specific ligands jpg
Pobre contorno = pocas interacciones

Binding site

04_31_specific ligands.jpg

AA en esa zona son distantes pero se acercan al doblarse la proteina

Regulatory sites

04 32 antibody jpg
Anticuerpos: binding sites bien versátiles!!!! Vs antigenos

Inmunoglobulinas

04_32_antibody.jpg

Alta especificidad

Alta variabilidad!!! Asig

04 33 lysozyme jpg
Enzimas - catalíticos poderosos

Sustratos --> productos

Hace y rehace enlaces covalentes

Específicas

Ej: Lisozima:

Antibiótico natural- saliva,lagrimas…

  • sitio activo - 6 azucares
04_33_Lysozyme.jpg

Sustrato - polisacáridos, lísis osmótica

Reacción - hidrólisis- añade agua entre dos azucares del polisac

Energéticamente favorable: porq?

04 37 feed inhibition jpg
Como son controladas: Niveles de control04_37_feed inhibition.jpg
  • -Expresión genética
  • Compartamentalización
  • Enzima per se: responde a cambios en el ambiente
  • Retroalimentación
  • -; +
  • Regulación
  • - ; +
04 38 metabolic react jpg
Retroalimentación…

Cada AA controla la

Primera enzima en su

síntesis

Cuantas enzimas comienzan?

Cuantos productos?

04_38_metabolic react.jpg
04 41 phosphorylation jpg
Fosforilación

Controla: cambia conforma

Añade un PO4-2 covalente a un AA

Añade 2 cargas (-)

Altera interacciones iónicas

04_41_phosphorylation.jpg
04 42 molec switches jpg
Regulacion:Proteinas que ligan GTP

-activas con GTP

-lo hidrolizan, libera un fosfato y se inactiva al cambiar conform o viceversa

04_42_molec. switches.jpg
  • transducción de señales
  • EF-Tu
04 44 walk along jpg
Motor Proteins: Funciones mediadas por cambio en conformación: movimientos

-contracción muscular

-transporte intracelular, citoesqueleto, virus

04_44_walk along.jpg

Cambios conformacionales capaces de generar movimientos

04 11 mass spectrom jpg
Mass Spect

Determina masa de los AA

Ayuda a determinar las proteinas y las secuencias

Bancos de data

Identificar el gen

04_11_Mass spectrom.jpg
04 12 crystallography jpg
Cristalografia de Rayos X04_12_crystallography.jpg
  • Difracción
  • Para estructura
  • Rayos - dispersión
  • Patrones según átomo, y posición
04 13 nmr jpg
NMR - espectroscopía04_13_NMR.jpg

Magnetismo del núcleo de cada átomo

Su conducta afectada por átomos alrededor

Bombardeo de frecuencias de radio

Núcleo de H genera señales que se usan para determinar distancias entre AA y otras partes

ad