1 / 24

Seminar Tugas Akhir Heteroplasmi pada Gen 12S rRNA mtDNA Penderita Diabetes Mellitus Tipe 2

Sofi Siti Shofiyah 10506063 Pembimbing : Achmad S. Noer , Ph.D. Seminar Tugas Akhir Heteroplasmi pada Gen 12S rRNA mtDNA Penderita Diabetes Mellitus Tipe 2. Agenda Presentasi. Pendahuluan Metodologi Penelitian Hasil Penelitian Pembahasan Kesimpulan. Pendahuluan. DNA Mitokondria.

chione
Download Presentation

Seminar Tugas Akhir Heteroplasmi pada Gen 12S rRNA mtDNA Penderita Diabetes Mellitus Tipe 2

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. SofiSitiShofiyah 10506063 Pembimbing: Achmad S. Noer, Ph.D Seminar TugasAkhirHeteroplasmipadaGen 12S rRNAmtDNAPenderitaDiabetes Mellitus Tipe 2

  2. Agenda Presentasi Pendahuluan MetodologiPenelitian HasilPenelitian Pembahasan Kesimpulan Seminar TugasAkhir / 24

  3. Pendahuluan

  4. DNA Mitokondria Pendahuluan :: MetodologiPenelitian :: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan • Laju Mutasi mtDNA 10 x lebih cepat dibandingkan DNA inti  mitochondrial disease • Fokus penelitian merupakan gen 12S rRNA Seminar Tugas Akhir

  5. Diabetes Mellitus Pendahuluan :: MetodologiPenelitian :: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan • Diabetes mellitus adalah penyakit yang ditandai dengan peningkatan kadar gula darah yang terus menerus. • Penderita diabetes di Indonesia mencapai angka 8,4 juta di tahun 2004 dan akan meningkat pada 2030 menjadi sebanyak 21,3 juta penderita (WHO,2004) Seminar Tugas Akhir

  6. Heteroplasmi Pendahuluan :: MetodologiPenelitian :: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan Heteroplasmi adalah campuran antara mtDNA termutasi dan normal pada satu sel Seminar Tugas Akhir

  7. Kloning Pendahuluan :: MetodologiPenelitian :: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan 1 4 2 3 Seminar Tugas Akhir

  8. TujuanPenelitian Pendahuluan :: MetodologiPenelitian :: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan • Sampel urin penderita diabetes merupakan sampel yang tidak positif PASA (PCR Alelle Specific Alignment) A3243 G • Penelitian sebelumnya (Maksum, 2009) menduga adanya heteroplasmi pada sampel di daerah gen 12s rRNA T1349G T1420G mengidentifikasimutasipadadaerah 12s rRNAmelaluiduametodeamplifikasi (PCR dankloning gen) danmembandingkannya. Seminar TugasAkhir

  9. MetodologiPenelitian Seminar Tugas Akhir

  10. Diagram AlirPenelitian Pendahuluan:: MetodologiPenelitian :: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan HasilLisissampelPenderita DM Amplifikasidengan PCR Hasil PCR Elektroforesis Pita fragmen DNA Direct Sequencing Kloning gen Elektroforegram KoloniBakteri ScreeningdanIsolasiPlamid Plasmid tersisipifragmen Elektroforegram Analisisin silico Sequencing Data Mutasi DNA

  11. PCR (Polymerase Chain Reaction) Pendahuluan:: MetodologiPenelitian :: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan 94oC 94oC 72oC 72oC Afor (458-479) 5:00 1:00 1:00 50oC 4:00 1:00 458 4oC A rev (2473-2491) ∞ Fragmen A (2034 pb) 2491 Seminar Tugas Akhir

  12. Kloning Gen Pendahuluan:: MetodologiPenelitian :: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan Seminar Tugas Akhir

  13. HasilPenelitian &Pembahasan Seminar Tugas Akhir

  14. ElektroforesisHasil PCR Pendahuluan :: MetodologiPenelitian:: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan Marker Sampel (-) Seminar Tugas Akhir

  15. SeleksiKoloniHasilTransformasi Pendahuluan :: MetodologiPenelitian:: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan Seminar Tugas Akhir

  16. Isolasi Plasmid Pendahuluan :: MetodologiPenelitian:: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan Marker 7 9 14 Ukuran tidak dapat ditentukan dengan jelas Seminar Tugas Akhir

  17. Pemotongan Plasmid denganEnzimRestriksiPstI Pendahuluan :: MetodologiPenelitian:: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan Marker 7 9 14 1kb DNA ladder 20.000 pb 5.000 pb 1.500 pb 500 pb 75 kb Sampel berukuran 5 kb Seminar Tugas Akhir

  18. ContohHasilElektroforegram Pendahuluan :: MetodologiPenelitian:: Hasil :: Pembahasan :: Kesimpulan Seminar Tugas Akhir

  19. AnalisisHasilSequencing Pendahuluan :: MetodologiPenelitian :: Hasil:: Pembahasan :: Kesimpulan Penelitian Sebelumnya – Perlakuan 1 (PCR) – Perlakuan 2 (Kloning gen) (Maksum, 2009) Maksum, 2009 Tidakadanyamutasipadaperlakukan 1 dan 2 padaposisi 1349 dan 1420 dibandingkandenganpenelitiansebelumnya Perlakuan 2 Perlakuan 1 Seminar Tugas Akhir

  20. MutasipadaPosisi Lain Pendahuluan :: MetodologiPenelitian :: Hasil:: Pembahasan :: Kesimpulan • Ditemukan mutasi yang ada pada setiap sampel, yaitu A1438G • Terdapat mutasi lain pada sampel hasil kloning 7 , yaitu G1485A Seminar Tugas Akhir

  21. KonfirmasiMutasidenganMitomap Pendahuluan :: MetodologiPenelitian :: Hasil:: Pembahasan :: Kesimpulan • Mutasi A1438G (Ada pada setiap sampel) dilaporkan di database Mitomap sebagai mutasi yang berkaitan dengan diabetes mellitus (Tawata, 1998) • Mutasi G1485A belum dilaporkan ke Mitomap Seminar Tugas Akhir

  22. Pendahuluan :: MetodologiPenelitian :: Hasil:: Pembahasan :: Kesimpulan • Sampel merupakan penderita diabetes mellitus tanpa penyakit neuropatik yang menyertai sehingga mutasi yang diperoleh diperkirakan berkaitan dengan penyakit diabetes mellitus. Seminar TugasAkhir

  23. Kesimpulan Pendahuluan :: MetodologiPenelitian :: Hasil :: Pembahasan:: Kesimpulan • SampelbersifatheteroplasmikarenamemilikicampuranmtDNAtermutasi yang berbedaantaraperlakuan 1, perlakuan 2, danpenelitiansebelumnya • Terdapatmutasi A1438G padasampeldenganperlakuan PCR dankloning yang dilaporkanberkaitandengandiabetes mellitus • Terdapatmutasi yang belumdilaporkan, G1485A, padasampeldenganperlakuan 2 (kloning) Seminar Tugas Akhir

  24. TERIMA KASIH Seminar Tugas Akhir

More Related