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分子情報データベースに関する研究 - Xgrid による計算速度の向上 -

分子情報データベースに関する研究 - Xgrid による計算速度の向上 -. 08H084 NAMLISAKUL KESORN 08H114 　堀田　駿平. 目次. 1. 研究目的 2. 手法　 3. システム設計 4. 実行方法 5. 結果と考察. 研究目的. 分子設計に役立つ分子情報データベースの 開発 •XML 形式 •GAUSSIAN で計算 • Xgrid で処理 本研究では、これらの処理を Xgrid で効率よく実行させるシステムを検討した。. 手法. •GAUSSIAN

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分子情報データベースに関する研究 - Xgrid による計算速度の向上 -

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  1. 分子情報データベースに関する研究-Xgridによる計算速度の向上-分子情報データベースに関する研究-Xgridによる計算速度の向上- 08H084 NAMLISAKUL KESORN 08H114 　堀田　駿平

  2. 目次 1.研究目的 2.手法　 3.システム設計 4.実行方法 5.結果と考察

  3. 研究目的 分子設計に役立つ分子情報データベースの開発 •XML形式 •GAUSSIANで計算 •Xgridで処理 本研究では、これらの処理をXgridで効率よく実行させるシステムを検討した。

  4. 手法 •GAUSSIAN •JAVAとJAXP •XML

  5. Xgrid XgridとはApple社が提供する複数のコンピュータに計算作業を分担させることを可能とする技術である。複雑な設定を必要とせずに環境を構築できる。 グリッドコンピューティング ネットワークで相互に接続された複数のコンピュータが連携することによって、処理を分散させる技術のこと。

  6. 図１.Xgridの動作

  7. Xgrid用の共有ファイルシステム Network File System(NFS) NFSを使うと離れた場所にあるコンピュータのファイルを、あたかも自分のコンピュータにあるファイルのように操作することができる。 Gfarm ペタバイトを超える容量、大規模なデータ処理の要求に応えるスケーラブルなファイルシステム。 /Network/Xgrid

  8. 使用したシステム ４台のiMacマシンのスペック 表１.iMacのスペック

  9. XMLデータ作成プログラムの開発 図２.プログラムの流れ

  10. 表２.必要なファイル Desktopにcomフォルダを置き、中に必要なファイルを入れて置く。

  11. 考察 fileload2.java fileload.java → 振動解析or構造最適化　　→ 振動解析or構造最適化 　　２択の判断 orそれ以外 ３択の判断

  12. 図３.実験結果のグラフ

  13. ご清聴ありがとうございます

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