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基因扩增检验专业现场评审方法和技巧. 医学实验室评审员持续培训 / 评审组长同级转换培训班 上海 2009-4-25~26. 现场评审的基本思路. 基因扩增检验实验室均经过卫生部临床检验中心的技术验收,验收标准又基本参照了 ISO15189 认可准则的要求,所以,在评审准备要实验室提供验收合格证书 日程安排上不能因通过了技术验收而忽视了 PCR 实验室的认可 重点关注申请的项目是否都有批文、各项记录是否完善等内容. 常见不符合项举例及分析.
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基因扩增检验专业现场评审方法和技巧 医学实验室评审员持续培训/ 评审组长同级转换培训班 上海 2009-4-25~26
现场评审的基本思路 基因扩增检验实验室均经过卫生部临床检验中心的技术验收,验收标准又基本参照了ISO15189认可准则的要求,所以,在评审准备要实验室提供验收合格证书 日程安排上不能因通过了技术验收而忽视了PCR实验室的认可 重点关注申请的项目是否都有批文、各项记录是否完善等内容
常见不符合项举例及分析 HBV-DNA可报告范围为103-108,HCV-RNA可报告范围为103-107,标准曲线和室内质控的浓度设定都在104以上,建议观察103低浓度值。 有一位从事临床基因扩增检验工作人员未获得培训合格证书
现场评审的重要环节 • 检验前程序(PCR技术验收表6--标本管理) --验收表比较简单,应注意RNA、分泌物等标本的采集、运输和保存 • 检验程序(见后) • 检验后程序(注意TAT是否满足质量目标的要求;报告单所必须包含的内容) • 座谈会(要了解临床对定量HBV-DNA;性病检测)
DNA、RNA的保存 DNA标本无菌条件2-8℃保存不超过3天,超过3天- 20 ℃ 。标本长期保存应在-70℃。避免多次反复冻融。DNA在TE缓冲液中(10mmol/L Tris-Hcl,1mmol/L EDTA,PH 8.0),4℃储存6个月以上,其中EDTA还可抑制微生物生长。 RNA容易降解,操作和储存中要防止RNA酶的污染。所用器皿高压灭菌后用,重蒸水配制或用焦碳酸二乙酯(DEPC)处理过的蒸馏水溶解RNA,RNA溶液中加入RNA酶抑制剂(RNasin), 终浓度为2U/10μl,置-20℃保存备用。冰块上操作为宜。
其他标本 • 棉拭子 --生理盐水充分振荡洗涤、静置5~10min、取上清、离心、沉淀物提DNA。如不立即提取,存-70℃ • 脓液 --沉淀标本的保存同样为-70℃ • 体液 --沉淀标本的保存同上
检测系统 • 校准(加样器、温湿度计、扩增仪) -查看文件与实际校准的情况 频度:首次(新安装); 后续(主要部件维修,强制周期如 每年,不定期) PCR仪:温度准确度及升降速率;荧光本底;激发及吸收波长的准确度、杂闪光、重复性、线性
检测系统 • 比对--没有开展室间质评的项目;比对的结果 • 性能验证--新启用的设备 • 维护保养 --保养程序、操作手册 严格按照仪器使用手册编写, 包括日、周、月、季、半年、年 --标识(时间、名称) --记录
现场评审的关注点 检测系统 室内质控 室间质评 溯源及测量不确定度 现场试验 人员能力 检验前程序观察 检验报告 生物安全 座谈会
室内质控 • 采用一系列统计学的方法连续地评价检测工作的可靠程度,判断检验报告是否可以发出的过程 • 目的是控制本实验室测定工作的精密度,监测其准确度的改变,提高常规检验工作的批间、批内标本检测结果的一致性 • 室内质控规则的制定是否合理(质控图、质控水平、质控频率) --每次现场验收问题最多的地方
室内质控 • 质控目的:假阴性、假阳性,准确性、精密度 • 质控点:样本质量、模板提取、扩增效率 • 质控物安排:空白、阴对、弱阳对、标准品 • 控制范围:空白、阴对-------阴性 弱阳对-------阳性(上下一次方) 标准品-------r值( - 0.998) 斜率(-3.1--- -3.5) 截距(﹥40左右;达安﹥ 30) 点间CT值 (3.3左右)
如何确定阈值 基线的作用(Baseline cycles ) 消除检测中背景荧光信号的影响,确定阈值 基线的范围:仪器一般默认的范围(应根据试剂合要求) PE-5700 、PE-7000 3-15 iCycle 2-10 LightCycle 3-12 基线需根据实验结果进行适当调整:延长基线以包括最高浓度样本扩增曲线起跳前尽可能多的循环,可以使扩增曲线更平滑、数据也得到一定改善。
阈值线 荧光阈值线的调整 需根据实验结果进行适当调整 1、落在阴性对照线最高点上方 2、外标准扩增曲线的均一位置(点间CT3.3左右)3、尽量接近扩增曲线刚真正进入指数扩增期的位置(避免弱阳性漏检以及一些扩增反应影响因素在指数期的放大)
Threshold Cycle Calculation: Baseline cycles Through Threshold Position 2 14 20.8
标准曲线 通过基线和荧光域值线的调整应达到: 相关系数( r值) ≥0.998 斜率 -3.0 ----3.5 截距 -40±4 (这些参数根据仪器和试剂有所不同)
室间质评 参加卫生部及省内质评计划 原始记录及结果报告 室间质评结果分析报告(如果没有分析报告,应该开观察项还是不符合项?开在哪一条?) 不符合项(原因分析及整改措施有效性)
溯源及测量不确定度 检测系统配置的基本情况 溯源性确认的基本原则 不能溯源时,结果可靠性的确认原则 测量不确定度(评审把握的尺度、具体举例)
现场试验 现场试验选择的原则 现场试验的方式(人员比对) 现场试验结果分析和判定 盲样试验的基本要求
人员能力 评审方式(查看技术人员档案、提问、现场试验、现场操作) 理论知识(防污染知识、生物安全知识) 技术能力 问题处理(发现问题、分析问题和解决问题的能力)
座谈会 座谈的原则与技巧(了解、关注临床新技术新进展) 关注的关键问题(明确几个必问的与专业相关的问题)
HBV DNA与肝细胞癌和肝硬化发生危险升高相关 REVEAL: 长期随访台湾未治疗的HBsAg阳性个体 50 随访13年 累积肝细胞癌的发生率[1] (N = 3653) 随访13年 累积肝硬化发生率[2] (N = 3582) 40 36.2 30 23.5 患者(%) 基线HBV DNA (拷贝/mL) 20 14.9 12.2 9.8 10 5.9 4.5 3.6 1.4 1.3 0 100,000- 999,999 ≥ 1 million 300- 999 1000- 9999 10,000- 99,999 300- 9999 < 300 ≥ 100,000 < 300 10,000- 99,999 1. Chen CJ, et al. JAMA. 2006;295:65-73. 2. Iloeje UH, et al. Gastroenterology. 2006;130:678-686.
HCC 病死率与基线HBV病毒载量的关系 1.00 HBV DNA (-) 0.96 HBV DNA Low (+) RR=1.8 (0.5–5.8) 0.92 Survival distribution function 0.88 HBV DNA High (+) RR=9.9 (3.2–31.0) 0.84 Survival time (years) 0.80 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 Chen G et al. 55th AASLD Boston, Nov 2004; Poster 1362
慢性乙肝病死率(除外HCC)与基线 HBV病毒载量的关系 HBV DNA (-) 1.00 HBV DNA Low (+) RR=1.5 (0.2–11.8) 0.96 0.92 HBV DNA High (+) RR=13.4 (1.9–97.1) Survival distribution function 0.88 0.84 Survival time (years) 0.80 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 Chen G et al. 55th AASLD Boston, Nov 2004; Poster 1362
小结 技术验收不能替代现场评审 PCR检测手工操作多、过程复杂、技术要求高、人员素质也应该高 对评审员的要求也高