1 / 43

ASAM NUKLEAT DAN SINTESIS PROTEIN

ASAM NUKLEAT DAN SINTESIS PROTEIN. STRUKTUR ASAM NUKLEAT. Asam nukleat terdiri atas: Gula 5 karbon (pentosa): Deoksiribosa (DNA) atau ribosa (RNA); Basa nitrogen; dan osfat. 5’. OH. OH. CH 2. O. 4’. 1’. H. H. H. H. 3’. 2’. OH. H. STRUKTUR ASAM NUKLEAT. Gula pentosa.

britanney-kidd
Download Presentation

ASAM NUKLEAT DAN SINTESIS PROTEIN

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. ASAM NUKLEAT DAN SINTESIS PROTEIN BIOSEL 2010

  2. STRUKTUR ASAM NUKLEAT • Asam nukleat terdiri atas: Gula 5 karbon (pentosa): Deoksiribosa (DNA) atau ribosa (RNA); Basa nitrogen; dan osfat BIOSEL 2010

  3. 5’ OH OH CH2 O 4’ 1’ H H H H 3’ 2’ OH H STRUKTUR ASAM NUKLEAT Gula pentosa Deoksiribosa BIOSEL 2010

  4. 5’ OH OH CH2 O 4’ 1’ H H H H 3’ 2’ OH OH Ribosa BIOSEL 2010

  5. NH2 O H 6 N 6 N N N 5 7 5 7 1 1 8 8 2 9 2 4 4 9 N N NH2 3 3 N N H H Basa nitrogen Purin Adenin Guanin BIOSEL 2010

  6. NH2 4 N 5 3 2 6 1 O N H O H 4 CH3 N 5 3 2 6 1 O N H Pirimidin Thymin Sitosin BIOSEL 2010

  7. O H 4 H N 5 3 2 6 1 O N H Urasil BIOSEL 2010

  8. Nukleosida adalah struktur yang terbentuk oleh adanya ikatan antara gula pentosa dan basa nitrogen dengan ikatan glikosidik • Basa akan selalu terikat pada posisi 1’ dari pentosa • Titik ikatan pada basa adalah posisi-1 (N-1) pada Pirimidindan posisi-9 (N9) pada Purin BIOSEL 2010

  9. BIOSEL 2006

  10. DNA: adalah sebuah polinukleotida • Terbentuk ketika 5’ fosfat dari satu nukleotida berikatan dengan 3’ -OH dari nukleotida yang lain, dengan cara menghilangkan gugus -OH dari posisi 3’ • Ikatan 3’ - 5’ disebut ikatan posphodiester BIOSEL 2010

  11. NH2 NH2 6 N N 7 5 1 4 N 8 5 5’ 5’ 2 3 4 9 N 3 O O CH2 CH2 O O N 2 6 4’ 4’ 1 O H H H H H H N H H 3’ 3’ 2’ 2’ OH O H H -O -O P O -O P O

  12. Pada umumnya DNA adalah double helix • Kedua rantai yang terpisah saling memilin, searah jarum jam (right-handed), dan terdapat 10 bp/putaran • Ikatan gula dan fosfat berada diluar dan basa-basa bertumpuk satu dengan lainnya di bagian tengah • Dua pita dalam double helix membentuk major dan minor grooves BIOSEL 2010

  13. Kedua pita DNA dihubungkan secara non-kovalen oleh ikatan hidrogen antara dua basa dari dua pita yang berlawanana • Kedua pita tersusun antiparallel • Kedua pita bersifat komplimen • Ikatan hidrogen bersifat khusus/unik BIOSEL 2010

  14. NH O 6 N N H 7 5 1 4 CH3 N 8 5 3 2 4 9 N 3 N 2 6 1 O N H H BIOSEL 2010

  15. H H N O 4 H N 6 N 5 3 N 7 5 1 2 6 8 H 1 2 9 4 O N N N 3 N H H H

  16. Sekuen basa pada DNA mengkode informasi genetik BIOSEL 2010

  17. SINTESIS PROTEIN Gen adalah segmen DNA yang mengkode sebuah protein tertentu / segmen DNA yang dapat ditranskripsi BIOSEL 2010

  18. 3’ 5’ 5’ 3’ DNA Template/antisense/noncoding strand Nontemplate/sense/coding strand BIOSEL 2010

  19. Sekuen DNA selalu ditulis 5’ - 3’ • Sekuen DNA biasanya adalah dari Nontemplate/coding/sense strand BIOSEL 2010

  20. translasi ekspresi transkripsi mRNA protein Sifat BIOSEL 2010

  21. Kode genetika: 43 = 64 kodons • Hanya 20 asam amino, sehingga 1 asam dikodekan oleh lebih dari satu kodon; dikenal dengan Degenerasi/redundansi • Kodon berbeda yang mengkode Asam amino yang sama disebut sinonim • Variasi kodon tersebut terjadi pada basa ketiga. Gejala ini disebut Wobble position • Valin: GUU, GUC, GUA, GUG BIOSEL 2010

  22. Dari ke 64 kodon tsb, hanya 61 yang mengkode AA. • 1 start kodon = Metionin (AUG) • 3 termination kodon UAG, UGA, UAA BIOSEL 2010

  23. ORF (Open Reading Frame) adalah satu set kodon yang berjalan berturutan, yang dimulai dengan start kodon dan diakhiri dengan stop kodon BIOSEL 2010

  24. coding sequence Termination sequence Promoter Promoter initiates transcription; affects when, where, and how much gene product is produced. Termination sequence marks end of gene BIOSEL 2010

  25. TRANSKRIPSI • Adalah proses sintesis RNA dari sekuen DNA sebuah gen oleh ensim RNA polymerase • RNA diproduksi dengan menggunakan template/anti-sense/non-coding strand • RNA merupakan copy dari non-template/sense/coding strand BIOSEL 2010

  26. mRNA PROCESSING • Hasil proses transkripsi sebuah gen yang mengkode protein adalah sebuah pre-mRNA • Pre-mRNA (pada eukariotik) terdiri dari intron dan exon

  27. mRNA PROCESSING • Langkah pertama: Splicing, yaitu menghilangkan sekuen non-coding (intron), sehingga menghasilkan mRNA tanpa intron • Langkah kedua: 5’Capping, yaitu menambahkan 7-methylguanosin (GTP + CH3), pada ujung 5’ untuk menghindari degradasi exonuklease pada ujung 5’

  28. mRNA PROCESSING • Langkah ketiga: 3’ Polyadenilatin, yaitu menambahkan ± 250 Adenin pada ujung 3’, sehingga membentuk ekor poli-A, untuk menghindari degradasi exonuklease pada ujung 3’ • Setiap mRNA pasti mengandung ekor poli-A. BIOSEL 2010

  29. BIOSEL 2010

  30. tRNA PROCESSING • Sebanyak 74 – 95 nukleotida RNA membentuk struktur berbentuk daun cengkih (cloverleaf structure) BIOSEL 20010

  31. 3’ A C C 5’ tRNA Acceptor arm TC arm dHU arm Optional arm Anticodon arm

  32. Acceptor arm: memiliki ujung CCA3’, yang tidak berpasangan, dan merupakan titik pengikatan tRNA dengan Asam Amino • Anticodon arm: berperan untuk mengenali dan melekatkan diri pada codon dalam mRNA BIOSEL 2010

  33. rRNA PROCESSING • rRNA terbentuk dari asosiasi antara ribosom dengan RNA • Ribosom Prokariotik 70S • Ribosom Eukariotik 80S BIOSEL 2010

  34. TRANSLASI • Adalah proses sintesis protein dalam sel • mRNA akan menentukan sekuen AA dalam sebuah protein • Peran tRNA sangat penting karena akan mengantarkan AA ke dalam ribosom BIOSEL 2010

  35. terdapat 31 – 40 tRNA • Sehingga 1 AA kemungkinan akan dibawa oleh > 1 tRNA • tRNA berbeda yang membawa AA yang sama disebut Isoacceptors BIOSEL 2010

  36. PROSES TRANSLASI • AA akan berikatan dengan tRNA pada proses yang disebut Aminoacylation/charging, yang kemudian akan mengenali kodon pada mRNA • Pengenalan antikodon (tRNA) dengan kodon (mRNA) dengan prinsip komplementaritas pasangan basa BIOSEL 2010

  37. 3. Tahapan translasi: • Inisiasi (Initiation): adalah pengikatan ssRibosom dengan mRNA membentuk sebuah “inisiation complex” • Proses ini dimulai dari AUG (met) sehingga kodon ini disebut ‘translation initiation codon” BIOSEL 2010

  38. b. Pemanjangan/elongation: • Dimulai dengan penggabungan lsRibosom pada inisiation complex • Sehingga terbentuk 2 buah ruangan pada kompleks, dimana satu ruangan telah diisi oleh tRNA Met, dan ruangan yang kedua diisi oleh tRNA yang ditentukan oleh kodon kedua dari mRNA. BIOSEL 2010

  39. Kompleks ini kemudian akan bergeser kearah 3’ (downstream) sehingga ruangan pertama akan disi oleh tRNA kedua, dan ruangan kedua akan diisi oleh tRNA ketiga yang ditentukan oleh kodon ketiga dst. BIOSEL 2010

  40. Terminasi (termination): • tRNA tidak akan mampu berikatan dengan termination codon • Terdapat beberapa protein yang disebut “Release Factors” yang akan mengenali kodon stop (UAA, UAG, UGA), dan akan menambahkan air pada polipeptida, sehingga terjadi pelepasan polipeptida. BIOSEL 2010

  41. BIOSEL 2010

  42. Dilanjutkan dengan pelepasan ribosom dari mRNA. Biosel 2010

More Related