1 / 10

RNA-Dependent RNA Polymerases, Viruses, and RNA Silencing Paul Ahlquist

RNA-Dependent RNA Polymerases, Viruses, and RNA Silencing Paul Ahlquist. Polimerazy RNA zależne od RNA, wirusy i wyciszanie RNA. Jolanta Mazurek i Cyprian Cukier. RdRp (RNA-dependent RNA polymerase) wirusowe.

borna
Download Presentation

RNA-Dependent RNA Polymerases, Viruses, and RNA Silencing Paul Ahlquist

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. RNA-Dependent RNA Polymerases, Viruses, and RNA Silencing Paul Ahlquist Polimerazy RNA zależne od RNA, wirusy i wyciszanie RNA Jolanta Mazurek i Cyprian Cukier

  2. RdRp (RNA-dependent RNA polymerase) wirusowe

  3. Polimerazy RNA (RdRps i DdRps) oraz odwrotna transkryptaza (RdDp) mają podobną budowę: charakterystyczny kształt prawej ręki. RdDp DdRp RdRp

  4. Komórkowe RdRps Komórkowe i wirusowe RdRps nie są homologami, ale mimo to cechuje je wysokie podobieństwo funkcjonalne. • Znane są dwa rodzaje białek o aktywności enzymatycznej RdRps: • polimerazy RNA zależne od DNA; • białko o masie 127 kDa (wyizolowane z pomidora, homologi genu znaleziono u innych gatunków, ale nie wyizolowano produktów tego genu).

  5. degradacja RNA

  6. Badania na C. elegans Homologi genu RdRp z pomidora są niezbędne do wyciszania RNA. C. elegans ma cztery homologi (rrf-1, rrf-2, rrf-3 i ego-1), a nicienie z knock-out’ami np. genu rrf-1 nie mają możliwości wyciszania genów w komórkach somatycznych, ale nie w komórkach linii płciowej. Mutacja w genie ego-1 blokuje wyciszenie tylko w komórkach linii płciowej.

  7. w komórkach C. elegans powstają transkrypty AB oraz A; • do komórek wprowadzono dsRNA odpowiadające odcinkowi B; • po pocięciu podanego dsRNA przez dicer jeden z fragmentów łączy się z komplementarną sekwencją w genie B; • zgodnie z oczekiwaniami z komórek zniknął transkrypt AB; • zaobserwowano też wyciszenie transkryptu A, co wyjaśniono następująco: • fragment egzogennego dsRNA połączony z transkryptem AB przez RdRp traktowany jest jako primer; • powstały dsRNA cięty jest przez dicer, więc powstaje siRNA o sekwencji odcinka A; • degradacja transkryptu A możliwa jest dzięki obecności odpowiadającego mu fragmentu komplementarnego - wynik etapu .

  8. Rola mechanizmu w komórkach roślinnych Knock-out genu RdRp w Arabidopsis thaliana powoduje akumulację wirusa mozaiki ogórka i replikonu wirusa X ziemniaka. Nie zaobserwowano wzrostu akumulacji niektórych wirusów ssRNA + - wirusy te wydajnie hamują mechanizmy obronne roślin (brak wyciszania transkryptów wirusowych).

  9. Literatura: Ahlquist P., RNA-dependent RNA polymerases, Viruses and RNA silencing, Science 296, 1270(2002); http://www.ias.ac.in/currsci/oct25/articles16.htm; http://www.ejbiotechnology.info/content/vol6/issue1/full/1/; http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=138860.

More Related