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生物医学信息资源

生物医学信息资源. 按载体或媒介：文献、网络（多媒介出版） 按主办和承建者：机构、大学、学者 按学科：基础、临床各学科等 搜集与评价路径： 引擎或权威机构网站出发 →推荐网址或链接→评价和筛选（承办者、内容、资源类型） 本课程：抛开媒介类型，以网络为依托. 基础医学信息资源之. 四大综述. 什么叫综述？ 综述在科学研究中具有什么作用？ 综述在哪里？如何查综述？. 生理学评论（ Physiological Reviews ） http://physrev.physiology.org/ 药理学评论（ Pharmacological Reviews ）

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Presentation Transcript

  1. 生物医学信息资源 • 按载体或媒介：文献、网络（多媒介出版） • 按主办和承建者：机构、大学、学者 • 按学科：基础、临床各学科等 • 搜集与评价路径： • 引擎或权威机构网站出发→推荐网址或链接→评价和筛选（承办者、内容、资源类型） • 本课程：抛开媒介类型，以网络为依托

  2. 基础医学信息资源之 四大综述

  3. 什么叫综述？ • 综述在科学研究中具有什么作用？ • 综述在哪里？如何查综述？

  4. 生理学评论（Physiological Reviews） • http://physrev.physiology.org/ • 药理学评论（ Pharmacological Reviews ） • http://pharmrev.aspetjournals.org/ • 临床微生物学评论（Clinical Microbiology Reviews） • http://cmr.asm.org/ • 微生物与分子生物学评论（Microbiology and Molecular Biology Reviews，MMBR） • http://mmbr.asm.org/，http://mmbr.asm.org/contents-by-date.0.shtml

  5. 课堂练习I（40分钟） • 分别登录四大综述的网站，查看并记录其： • 主办者（版权归属） • 出版频率 • 刊文内容 • 网站都有哪些栏目（可以点击进去并提供更多内容的版块）

  6. 生理学评论（Physiological Reviews）http://physrev.physiology.org/ • 美国生理学会主办 • 综述生理学和生物医学领域最近焦点问题 • 2008年JCR显示IF值为35.000，居生理学期刊之首 • 于出版前约3-4周预先公布将出版的计划目次表 ，出版12个月后全文免费 • 该杂志综述相当于记述某专题研究历史和最新进展的专著。均由世界著名生理学家撰写。 • 每篇约两万字，文中附相应的图表。参考文献数百篇，发表年份跨时约一个世纪。

  7. 生理学评论（Physiological Reviews）http://physrev.physiology.org/ • 除生理学以外，还涉及综合自然科学、综合医学、生命科学基础综合（包括解剖、组胚、生化、分子生物、细胞生物、生物学、动物学）、临床医学（包括呼吸病学、癌症、循环等）。 • 在参考文献下方，提供引用该文的主要论文的题录信息和全文链接。该杂志的综述论文被其它学科书刊引用极为广泛，往往也涉及综合自然科学、综合医学及基础医学各学科。可以说，该刊的学术影响遍及基础医学各学科和临床医学许多相关学科。

  8. 生理学评论（Physiological Reviews）http://physrev.physiology.org/ • 提供参考文献、引用该文文献列表与链接，尤其后者只给出其中的精要，主要作用是帮助读者快速追溯与该文密切相关的文献和密切相关的最新研究，起到为读者导读、辅助读者精读的作用。

  9. 生理学评论（Physiological Reviews）http://physrev.physiology.org/ • 提供文章的可视化引证图，直观地反映该文引用其它杂志论文和被其它杂志论文引用的情况，帮助读者了解该文和刊载该文的杂志与哪些论文和杂志存在着相互影响，进而了解学科间交叉渗透的情况。可取与该文存在引证关系的文献记录集中（以HighWire为统计数据源）按被引频次降序排列的前10、15、20、25、30条引证记录查看可视图。图下提供图中显示出来的引证记录的题录信息以及摘要和全文链接，或者在图中直接点击文献记录也可查看这些信息。

  10. 生理学评论（Physiological Reviews）http://physrev.physiology.org/

  11. Pharmacological Reviews《药理学评论》http://pharmrev.aspetjournals.org/ • 美国药理学与实验治疗学会主办的综述杂志。季刊。登载对当前研究热点问题的综述文章。内容包括：生化与细胞药理学、药物代谢与分布、肾脏药理学、神经药理学、行为药理学、临床药理学和毒理学。2004年JCR显示IF值为22.837，列药理学与药学杂志之首.2008年IF值21.936。 • 每一篇综述都精辟而全面地阐述了药理学领域某专题研究的进展情况，相关于专题专著。

  12. 微生物与分子生物学评论（Microbiology and Molecular Biology Reviews，MMBR）http://mmbr.asm.org/，http://mmbr.asm.org/contents-by-date.0.shtml • 1937年创刊，其前身为《Microbiological Reviews》。1992年，更为现名，同时分出一种临床综述刊《Clinical Microbiology Reviews》。美国微生物学会主办。每年4期。评论涉及微生物学、免疫学、分子与细胞生物学，为读者介绍有关细菌、病毒、寄生虫、真菌以及其它真核细胞生物研究的最新发现。内容范畴有生理学与酶学、分子生物学、遗传学、生态学、引发疾病的宿主-寄生虫关系、细胞生物学、病毒学。 出版12个月后全文在线免费。IF=16.950

  13. 临床微生物学评论（Clinical Microbiology Reviews）http://cmr.asm.org/ • 1988年创刊。美国微生物学会主办。 • 2008年JCR显示IF值为16.409，居141种刊第3位。2005年IF值10.443。文献出版12个月后全文在线免费。

  14. 课堂练习II(20分钟) • 分别查阅上述四大综述的网站，点击其当前“most cited”的论文，查看该论文的： • 标题及内容 • 引用参考文献的篇数 • 参考文献发表年代的分布和时间跨度 • 参考文献都来自哪些杂志？ • 该文献被哪些文献引用？引用文献来自哪些杂志？ • 查看该文的“Citation Map”，解释该图。 • 形成书面记录。

  15. 思考题 • 为何《Physiological Reviews》的Citation Map很多只有右半图（the cited articles by the paper in PR）而左半图（the articles citing the paper in PR）鲜以显示出来？

  16. 基础医学之 生化、分子生物、遗传学大刊

  17. 生物化学、分子生物学与遗传学大刊 • 生物化学杂志（Journal of Biological Chemistry，JBC） • http://www.jbc.org • Cell • http://www.cell.com • Nature Genetics自然遗传学 • http://www.nature.com/ng/index.html Nature Publishing Group (http://www.nature.com/index.html)出版的Nature系列杂志之一。1992年创刊，月刊。

  18. 生物化学杂志（Journal of Biological Chemistry，JBC）http://www.jbc.org • 由美国生物化学与分子生物学会（American Society for Biochemistry and Molecular Biology,ASBMB,http://www.asbmb.org/ASBMB/site.nsf）主办。1905年创刊。周刊，每年原始研究报告总印数达55000多页。有印刷本和电子版两种刊载载体。原始研究论文经同行评议确认对生物化学、分子生物学领域有创新性重要贡献才能予以发表。 • 可采用常规发表和快速发表两种形式。前者录用率约为15%，后者5%。快速发表的研究成果要求特别具有新颖性、创造性、重要性并特别吸引读者。 • 稿件一旦获准录用，将在24小时内进入“JBC Papers in Press”在网上公布。相应地，如果论文中涉及到新认定的生物大分子结构，那么新的结构信息也必须同步录入Protein Data Bank。

  19. 生物化学杂志（Journal of Biological Chemistry，JBC）http://www.jbc.org • JBC论文按内容分编，主要类目有方法学、测序与克隆、酶学、蛋白与蛋白相互作用、转录、代谢调节与基因表达、翻译后修饰、糖生物学（glycobiology）、蛋白突变分析、转基因与敲除、功能性基因组蛋白质组分析、生物信息学、用流式细胞计数研究细胞周期与凋亡、RNAi。JBI还设有小综述栏目，发表对当前热点问题的特邀小综述。2008年JCR显示该刊IF值为5.520，407492,居上述388种期刊的第43位。文献出版后一年全文免费。

  20. Nature Genetics http://www.nature.com/ng/index.html • Nature Publishing Group (http://www.nature.com/index.html)出版的Nature系列杂志之一。1992年创刊，月刊。 • 该杂志发表遗传学高质量研究成果，包括人类性征和其它动物模型如鼠、蝇、线虫和酵母菌的基因和功能性基因组的研究。当前侧重常见疾病和复杂疾病的遗传学机理，也侧重通过实验干预研究基因网络的功能机制、结构和演变。具体包括：人类疾病病理中的基因、简单与复杂基因性征的分子分析、癌症遗传学、实验胚胎学、基因疗法、发育遗传学、基因表达调节、从基因组数据中提取功能的策略与技术、药物基因组学、基因组进化。

  21. Nature Genetics http://www.nature.com/ng/index.html • 杂志设有编者述评、通信(Correspondence)、书评、新闻与观点、综述、短篇通讯(Brief Communications)、原始论文、读者来信（Letters）等栏目。 • 通信(Correspondence)原为Letters to the Editor，登载读者感兴趣的问题，可以是政策争论，也可以是由研究论文引发的问题公告，该类文章的原始研究数据要求以摘要形式描述。 • 短篇通讯(Brief Communications)报告高质量且具有广泛兴趣的简洁研究成果。 • 读者来信（Letters）发表重要的新的研究成果，但其重要性又较原始论文（Articles）次之。 • 2008年是30.259，均居120种遗传学(Genetics & Hereditary)期刊的首位。

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