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第五章 遗传信息的表达. 转录. 翻译. pr. DNA. RNA. 逆转录. 中心法则:. 第一节 转录( transcription ). 以DNA为模板合成RNA的过程. 与复制的相同之处 :. (1) 都以 DNA 为模板. (2) 都以 nt 为原料 , 合成方向都是 5 ' 3 '. (3) 都服从碱基配对原则. 不同之处 :. (1) 四种原料不同 : DNA dNTP, RNA NTP. (2) 配对碱基不同: A=T ; A=U. ( 3 )酶不同: DNA 聚合酶; RNA 聚合酶.
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转录 翻译 pr DNA RNA 逆转录 中心法则: 第一节 转录(transcription) 以DNA为模板合成RNA的过程
与复制的相同之处: (1)都以DNA为模板. (2) 都以nt 为原料,合成方向都是5'3'. (3) 都服从碱基配对原则 不同之处: (1)四种原料不同: DNAdNTP, RNANTP (2)配对碱基不同:A=T;A=U (3)酶不同: DNA聚合酶;RNA聚合酶 (4)模板: 复制: 两条全部DNA分子; 转录:一条DNA分子的部分
一、原核生物RNA的生物合成 (一)RNA聚合酶(RNA polymerase) : 1 种 大肠杆菌中: 全酶为:五聚体(2'): :识别结合启动子 2:启动子上游 :催化形成二酯键 ':酶与模板的结合部位 需Mg2+,Mn2+, 无校对功能 RNA合成的错误率为10-6(DNA合成的错误率为10-9-10-10)
(二)转录模板 基因1:链2:转录模板链(template strand) or 反意义链(antisense strand) 链1:信息链or 有意义链(sense strand) or 编码链(coding strand) 基因2: 链1:转录模板链(template strand) or 反意义链(antisense strand) 链2 为信息链or 有意义链(sense strand) or 编码链(coding strand)
(三) 转录过程 1、起始阶段: 不需要引物, 全酶中识别并结合启动子 DNA构象发生变化 RNA聚合酶催化两个相邻的nt与模板配对 第一个nt为5'pppG or pppA, 第二个nt有游离3'-OH 继续加入NTP,延长 几个nt之后 因子脱落 全酶-DNA- pppGpN'-OH 称为起始复合物
2、延长阶段: 核心酶(core enzyme) 沿模板3'5'滑行, RNA按5'3'方向合成 >12nt, RNA 5'端与DNA模板脱离 mRNA: 45nt/sec, rRNA: 90nt/sec 3、.终止阶段 两种方式: 因子不依赖终止 因子依赖终止
(1)因子不依赖终止 图5-1 • RNA酶行进到模板的终止子部位(富含GC,可在RNA 上形成发夹结构) • • 发夹结构影响RNA酶的行进 • • RNA链先从DNA上释放,再与核心酶分离 • • 终止转录
(2)因子依赖终止 图5-2 因子与RNA聚合酶结合(终止子) 使RNA-DNA杂交体解开 因子、RNA聚合酶与DNA分离 转录终止
(四)、转录后加工 初级转录产物(primary transcrips):一个操纵子转录出的一条完整RNA。 mRNA:不需要加工 rRNA:需加工、修饰 tRNA:需加工、修饰 • 如大肠杆菌 rrnD操纵子 (rRNA、tRNA混排)图5-3 • 6个基因: 3个tRNA • 16s rRNA • 23 s rRNA 称为30 s RNA • 5 s rRNA • 间隔序列
30 s RNA • 核酸内切酶(RNase P) • 16 s 、23 s 、5 s rRNA前体 + tRNA 前体 • • (内、外切酶) (1) 剪切作用:多余序列 • 切除原间隔序列 (2)添加和修复3‘端CCA序列 (3)某些碱基的化学修饰 • • 成熟16 s 、23 s 、5 s rRNA 成熟tRNA
二、真核生物RNA的生物合成 (一)RNA聚合酶 pol 1 :核仁:5.8S、18S、28S rRNA pol 2:核浆:mRNA pol 3 :核浆:tRNA (二)转录单位: 为一个基因(一个结构基因加相应调控元件) 三、转录过程:
1.起始阶段:需一些蛋白质参与,称转录因子(transcrption factor,TF) • (1) mRNA前体的转录 图5-4 :pol 2 • TF2D(含一个TATAbox 结合蛋白(TBP)和多个TBP结合因子(TAF)) • + TATA box • • TF2A,TF2B结合TF2D • • TF2F+ pol2 结合TF2B • • TF2E、TF2H加入,形成起始复合物
(2)rRNA前体的转录 :pol 1 人基因:核心启动子 + 上游调控元件(UCE) 转录因子: 上游结合因子(UBF1)、 选择因子1(selectivity factor1,SL1) (含一个TBP 和 3个TBP结合因子) UBF1与核心启动子和UCE 结合 SL1与UBF1结合 pol 1与 SL1 中的TBP结合 起始转录
(3)tRNA、5SrRNA:pol 3 基因:A box、B box TF 3 C结合与B box TF 3 B结合与启动子 pol 3进入
2、延长阶段:与原核生物相似,方向5'3' 3、终止阶段:机制不清
(四)转录产物的加工 5'端加帽子 1.mRNA前体的加工: 3'端加尾巴(poly A) 去除内含子拼接外显子 (1)5'端加帽子(capping)图5-5 7mG:5'-5'磷酸二酯键(正常:3'-5'磷酸二酯键) 两种: 1 型帽子结构:m7G-nt1(2'-OH被甲基化) 2型帽子结构: m7G-nt1(2'-OH被甲基化)- nt2(2’ -OH被甲基化)
(2)3'端加尾巴(poly A tail)图5-6 mRNA中 AAUAAA序列被核酸内切酶识别并在其下游11 nt -30nt 处切断, 在poly A聚合酶作用下加入poly A.
(3) 去除内含子拼接外显子(splicing): 图5-7 内含子的结构: 5'GU------------------A-------AG 3' (5'剪切位点) (分支点) (3'剪切位点 ) • 剪接反应: 在剪接体(spliceosome)中进行 • (两步) SnRNA: U1, U2,U3…..U6 • 蛋白质 第一步: 分支点A 攻击5'侧剪接位点G, 释放5'外显子. 第二步: 5'外显子攻击3'剪接位点,两个外显子拼接,同时释放套索状中间产物.
特点:内含子自我剪接 / 核酶 产物:套索结构 (4)化学修饰: 主要是甲基化修饰 (5)RNA的编辑(RNA editing) • 隐蔽基因(cryptogene) 产物 • 如 线粒体细胞色素氧化酶C亚基mRNA: • 在145个不同位点插入407个U, • 在9个不同位点删除19个U, 编辑nt占成熟mRNA的一半以上。
(2)tRNA 前体的加工 A:tRNA 前体的剪接:去除内含子和5'侧先导序列。 B: 添加或修复3'端CCA序列。 C: 化学修饰:形成稀有碱基。 (3)rRNA 前体的加工: A:rRNA 前体的剪接; B:化学修饰
第三节 翻译 一、原核生物蛋白质的生物合成 (一)蛋白质生物合成体系 • 1、mRNA : • (1)密码子(codon):每三个相邻的nt决定一个氨基酸。 • (2)开放阅读框(open reading frame,ORF):从起始密码子到终止密码子。
(3)遗传密码:64个密码子的统称。密码子表( P78) 特点: (1)起始密码子:AUG- met; (2)终止密码子:UAG,UAA,UGA (3)读写方向: 5'3'; (4) 连续性; (5)兼并性:几个密码子决定同一个氨基酸; (6) 通用性; (7)摆动性(wobble):密码子的第三位与反密码子的第一位 碱基的配对不十分严格。
第一位(5端) 碱基 第二位(中间)碱基 第三位(3端)碱基 A G U C A AAA赖氨酸 AAG赖氨酸 AAU天冬酰胺 AAC天冬酰胺 AGA精氨酸 AGG精氨酸 AGU丝氨酸 AGC丝氨酸 AUA异亮氨酸 AUG甲硫氨酸 +起始信号 AUU异亮氨酸 AUC异亮氨酸 ACA苏氨酸 ACG苏氨酸 ACU苏氨酸 ACC苏氨酸 A G U C G GAA谷氨酸 GAG谷氨酸 GAU天冬氨酸 GAC天冬氨酸 GGA甘氨酸 GGG甘氨酸 GGU甘氨酸 GGC甘氨酸 GUA缬氨酸 GUG缬氨酸 GUU缬氨酸 GUC缬氨酸 GCA丙氨酸 GCG丙氨酸 GCU丙氨酸 GCC丙氨酸 A G U C U UAA终止信号 UAG终止信号 UAU酪氨酸 UAC酪氨酸 UGA终止信号 UGG色氨酸 UGU半胱氨酸 UGC半胱氨酸 UUA亮氨酸 UUG亮氨酸 UUU苯丙氨酸 UUC苯丙氨酸 UCA丝氨酸 UCG丝氨酸 UCU丝氨酸 UCC丝氨酸 A G U C C CAA谷氨酰胺 CAG谷氨酰胺 CAU组氨酸 CAC组氨酸 CGA精氨酸 CGG精氨酸 CGU精氨酸 CGC精氨酸 CUA亮氨酸 CUG亮氨酸 CUU亮氨酸 CUC亮氨酸 CCA脯氨酸 CCG脯氨酸 CCU脯氨酸 CCC脯氨酸 A G U C
2.核糖体(ribosome):rRNA + prs :是蛋白质合成的场所 • 主要活性部位: • A位(受位acceptor site):氨酰tRNA(tRNA-a.a)进入的部位. • P位(供位 donor site,peptide site): 肽酰tRNA(tRNA-a.a-a.a-a.a-a.a…a.a) 占据的部位. 3.tRNA:氨基酸的运输工具, 细菌中约30种-40种。 4.各种蛋白质:起始因子:IF:IF-1;IF-2;IF-3。 延伸因子:EF:EF-Tu;EF-Ts;EF-G。 终止因子:RF:RF-1;RF-2;RF-3。
5.氨基酰-tRNA合成酶:催化氨基酸与tRNA结合形成tRNA-a.a, 具有特异性. (二)氨基酸的活化: tRNA + a.a tRNA-a.a (三) 翻译过程: 三个阶段 1.起始阶段: IF-3+ 30S mRNA fmet-tRNAfmet-IF-2-GTP(IF-1促进该三元复合物形成) 50S 释放IF-1,IF-2,IF-3,GDP,Pi 形成70S.mRNA. fmet-tRNAfmet三元起始复合物.
2.延长阶段: 许多循环组成,每个循环包括三步 (1)进位::甲硫氨酰-tRNA首先进入P位( 由起 始密码子AUG编码)此后的所有aa-tRNA都首先进入A位. (2)转肽:肽键形成 (3)移位::A位P位.
二、真核生物蛋白质合成的特点 : 与原核生物基本相同 三、肽链的翻译后加工 • 1.肽链的折叠 • 2.各种共价修饰 • 3.水解修饰 • 4.亚单位聚合
修饰水解 高尔基体中切除部分肽段/修饰 蛋白原 成熟的分泌蛋白