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选修一 生物技术实践 专题 5 DNA 和蛋白质技术 课题 2 多聚酶链式反应扩增 DNA 片段. 阜阳市 阜南一中 杨金立. 教学目标. 重点难点. 问题探讨. 教学过程. 知识结构. 教学反馈. 课后习题. 教学参考. 课题 2 多聚酶链式反应 扩增 DNA 片断. 【 课题目标 】. (一)知识与技能 1 、了解 PCR 技术的基本操作 2 、理解 PCR 的原理 3 、讨论 PCR 的应用 (二)过程与方法
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选修一 生物技术实践专题5 DNA和蛋白质技术课题2多聚酶链式反应扩增DNA片段 阜阳市 阜南一中 杨金立 教学目标 重点难点 问题探讨 教学过程 知识结构 教学反馈 课后习题 教学参考
课题2 多聚酶链式反应 扩增DNA片断
【课题目标】 (一)知识与技能 1、了解PCR技术的基本操作 2、理解PCR的原理 3、讨论PCR的应用 (二)过程与方法 在多聚酶链式反应扩增DNA片段的实验过程中,应避免外源DNA污染,严格控制温度等反应条件 (三)情感、态度与价值观 通过对PCR实验的操作及结果分析,培养学生严谨的科学态度和实事求是的科研精神
【课题重点与难点】 • 课题重点: PCR的原理和PCR的基本操作。 • 课题难点: PCR的原理。
美国科学家 穆利斯(K.B.Mullis) 发明了PCR技术 1993年诺贝尔奖 ★ 分子生物学研究中最强大的实验技术之一 ★ 其本质是在体外模拟胞内DNA分子复制的过程
一、多聚酶链式反应 是一种体外迅速扩增DNA片段的技术。 能以极少量的DNA为模板,在几小时内 复制出上百万份的DNA拷贝。 广泛应用于遗传病的诊断、刑侦破案、 古生物学、基因克隆和DNA序列测定等。
脱 氧 核 苷 酸 磷酸 脱氧核糖 腺嘌呤(A) 脱氧核苷 嘌呤 含氮 碱基 鸟嘌呤(G) 胞嘧啶(C) 嘧啶 胸腺嘧啶(T) 二、DNA分子的结构 1、基本组成单位——脱氧核苷酸
5 3 脱氧核苷酸结构式
2、多脱氧核苷酸链的形成 一个核苷酸上的磷酸基团上的“-OH”和另一个核苷酸分子的第3位碳原子上的羟基之间失去一分子水,形成磷酸二酯键,即在相邻的两个脱氧核苷酸的 3’和5’碳原子之间形成磷酸二酯键。 数量庞大的四种脱氧核苷酸通过3',5'-磷酸二酯键彼此连接起来形成脱氧核苷酸链。 通常将DNA的羟基 “-OH”末端称为3’端,而磷酸基团的末端称为5’端。
5’ OH 碱基 5’ 碱基 O HO O P 脱氧核糖 O 3’ 磷酸基团 O 碱基 碱基 5’ O HO O P 脱氧核糖 O 3’ OH 碱基 脱氧核糖 3’ 多脱氧核苷酸链结构简图
C A A T G C T G DNA单链两端的命名 3,端 5,端含磷酸基团 连 接 3,端(含羟基) 5,端
3、DNA分子的双螺旋结构特点 ① DNA分子是由两条反向平行的(即一条链为3’-5’,另一条链为5’-3’)脱氧核苷酸长链盘旋而成的规则双螺旋结构。 ②脱氧核糖与磷酸交替连接,排列在外侧,构成基本骨架;碱基排列在链的内侧。 ③两条链上的碱基通过氢键连接起来,形成碱基对。碱基对的组成有特定的规律:即腺嘌呤一定与胸腺嘧啶配对,鸟嘌呤一定同胞嘧啶配对。
三、DNA的复制 1、概念 由一个DNA形成两个完全相同的DNA的过程 2、时期 有丝分裂间期或减数第一次分裂前的间期 3、场所 细胞核(主)(线粒体、叶绿体) 4、模板 DNA母链
5、原材料 脱氧核苷酸 6、基本条件 酶、ATP、原料、模板 7、复制过程 ① DNA的解旋 亲代DNA分子利用细胞提供的能量在解旋酶的作用下氢键断裂,部分双螺旋链解旋为两条平行的双链 ② RNA引物的合成 以单股DNA为模板,在引物酶的作用下合成小段的RNA引物。
③ DNA的生成 以单股的DNA为模板,在DNA聚合酶的作用下,在RNA引物的末端由5’端→3’端合成DNA。 8、复制特点 边解旋边复制(过程) 半保留复制(结果) 9、遵循原则 碱基互补配对原则
10、精确复制的原因 ①规则的双螺旋结构为复制提供了精确的模板 ②碱基互补配对保证了复制准确无误的进行 11、复制的意义 DNA分子通过复制使遗传信息从亲代传给了后代,从而保持了遗传信息的连续性。
总结:胞内DNA复制的基本体系 打开DNA双链 提供DNA复制的模板 合成子链的原料 催化合成DNA子链 使DNA聚合酶能够从引物的3’端开始连接脱氧核苷酸
四、 PCR(多聚酶链式反应) 1、 PCR原理 ①在80-100℃的温度范围内, DNA的双螺旋结构将解体,双链分开,这个过程称为变性。 ②当温度缓慢降低后,两条彼此分离的DNA链又会重新结合成双链。 ③ PCR利用了DNA的热变性原理,通过控制温度来控制双链的解旋与结合,现在使用的PCR仪实质上也是一台能够自动调控温度的仪器。
加热到95℃,DNA双链 解旋为单链 变性 降到55℃,引物通过碱基 互补配对与单链DNA结合 复性 升温到72℃,四种脱氧核苷酸 在DNA聚合酶的作用下,根据 碱基互补配对原则合成新的DNA链 延伸
2、细胞内和细胞外DNA复制环境的区别 细胞内源 引物合成酶 细胞内源 细胞内源 细胞内环境 外源加入 外源加入 外源加入 外源加入 缓冲液
3、细胞内复制和PCR的主要不同点 ① PCR过程需要的引物不是RNA,而是人工合成的DNA单链,其长度通常为20-30个脱氧核苷酸。 ② PCR过程中DNA的解旋不依靠解旋酶,而是通过对反应温度的控制来实现的。
4、 DNA聚合酶特性 不能从头合成DNA,只能从DNA的3′端开始延伸DNA链,因此, DNA复制需要引物。 5、 DNA聚合酶作用过程 当引物与DNA母链通过碱基互补配对结合后, DNA聚合酶就能从引物的3′端开始延伸DNA链, DNA的合成方向总是从子链的5′端向3′端延伸。
6、 Taq DNA聚合酶的应用 高温解决了打开双链的问题, 但又导致DNA聚合酶失活的问题,耐高温的Taq DNA聚合酶解决了高温导致DNA聚合酶失活,促成了PCR技术的自动化。 7、 缓冲液需要为PCR反应提供的物质 DNA模板,分别与两条模板链相结合的两种引物,四种脱氧核苷酸,耐热的DNA聚合酶存在于缓冲液中,同时通过控制温度使DNA复制在体外反复进行。
8、 PCR技术的特点 PCR技术是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。 它具有特异、敏感、产率高、快速、 简便、重复性好、易自动化等特性。
五、 PCR的反应过程 1、PCR的反应步骤 PCR一般经历三十多次循环,每次循环可以分为三个基本步骤──变性、复性和延伸 2、循环过程 ①变性(模板DNA解旋) 模板DNA经加热至950C左右。一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使成为单链,以便于它与引物结合,为下轮反应作准备。
靶序列 靶序列 PCR 循环第一步:高温变性
②复性(退火)——低温复性 模板DNA经加热变性成单链后,温度降到550C左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合。
PCR 循环第二步 :引物与靶序列退火 靶序列 3’ 5’ 5’ 3’ 引物 Ⅰ 引物 Ⅱ 3’ 5’ 5’ 3’ 靶序列
③延伸 ——中温延伸 DNA模板-引物结合物在TaqDNA聚合 酶的作用下以脱氧核苷酸为原料,以母链为 模板,按碱基互补配对的原则与半保留复制 的原理,合成一条新的DNA链。
PCR 循环第三步 :引物延伸 靶序列 3’ 5’ 5’ 3’ 引物Ⅰ Taq DNA 聚合酶 引物Ⅱ 3’ 5’ 5’ 3’ 靶序列
第1个PCR循环完成后 :得到两个靶序列 靶序列 靶序列
95℃变性 (1)PCR循环--变性
(1)PCR循环--变性 95℃变性
(1)PCR循环--变性 95℃变性
55℃复性 (2)PCR循环—复性
循环特点: ①上一次循环的产物为下一循环的模板 ②结果单链中有最初母链的只两条(无引物存于两个子代DNA分子中 ③其它子代DNA分子都为双引物分子式 ④处于两引物之间的DNA序列呈指数增长1×2N
六、 PCR 的实验操作 (一)设备及用具 1、PCR仪 实质上一台能够自动调控温度的仪器 2、微量离心管 一种薄壁塑料管,总容积为0.5ml 3、微量移液器 用于定量转移PCR配方中的液体,其上的一次性吸液枪头用一次更换一次
PCR仪 微量离心管
推动按钮 微量移液器 调节轮 卸枪头按钮 一 次 性 吸液枪头 卸枪头器
(二)实验操作步骤 ①准备好PCR反应体系的配方 ②用微量移液器按配方在微量试管中加入各组分 ③盖严盖子,用手指轻轻弹击管壁 ④离心10分钟 ⑤将离心管放入PCR仪上,设置好循环程序 ⑥电泳检测PCR结果
(三)、操作提示: • 1.为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头、缓冲液以及蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌。 • 2.PCR所用的缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。 • 3.在微量离心管中添加反应成分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。所有的成分都加入后,盖严离心管口的盖子,用手指轻轻弹击管的侧壁,使反应液混合均匀,再将微量离心管放在离心机上,离心约10s,使反应液集中在离心管底部,再放入PCR仪中进行反应。 目的: 避免外源性DNA大量扩增造成假阳性反应。
七、课题成果评价 (一)理论上DNA扩增数目的计算 1 、一条DNA,复制n次, DNA为2n 2 、a条DNA,复制n次, DNA为 a×2n (二)实验中DNA含量的测定原理 可以通过计算DNA含量来评价扩增的效果,DNA在260nm的紫外线波段有一强烈的吸收峰,峰值的大小与DNA的含量有关。