1 / 14

Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот.

Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот. Ревертаза. РНК-зависимая ДНК-полимераза (ревертаза) способна катализировать синтез ДНК-копии (кДНК) на РНК-матрице. Не LTR-содержащие. LINE ( l ong in terspersed e lements). Структура мРНК кодирующие

alicia
Download Presentation

Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот.

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript


  1. Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот.

  2. Ревертаза. РНК-зависимая ДНК-полимераза (ревертаза) способна катализировать синтез ДНК-копии (кДНК) на РНК-матрице.

  3. Не LTR-содержащие

  4. LINE (long interspersed elements) Структура мРНК • кодирующие • характерна усечённость копий с 5’-конца • нумерация нуклеотидов в последовательности LINE принято вести с 3’-конца и выражать в отрицательных числах

  5. Схема жизненного цикла L1.

  6. TPRT – реакция.(target-primed reverse transcription) • в ДНК-мишень вносится одноцепочечный разрыв • 3’-конец одной из цепей используется в качестве затравки для синтеза кДНК • разрезание второй цепи ДНК-мишени [там же] • далее in vivo происходит: • лигирование цепей ДНК • разрушение РНК в составе гетеродуплекса • репаративный синтез второй цепи ДНК

  7. SINE(short interspersed elements) • не содержат кодирующих последовательностей • при транспозициях используют обратную транскриптазу из других источников • в качестве таких «доноров» выступают LINE • заканчивается олиго(А)-трактом • гомогенны по длине внутри одного семейства • не содержат 5’-концевых делеций • нумерацию нуклеотидов ведут с 5’-конца

  8. Происхождение. • Из 7SL РНК с внутренней делецией - B1 грызунов, Alu приматов. • “tRNA-derived SINE” - в 5’-части есть высокая гомология с последовательностями определённых тРНК - В2 грызунов, TS табака, MIR всех млекопитающих. В то же время их 3’-концевой домен является АТ-богатым и происходит, по-видимому, из 3’-конца LINE-элементов. • Известны случаи происхождения SINE из генов малых ядерных РНК - Bm1 B. mori – из U1. • SINE-R из генома человека обязан своим происхождением длинному концевому повтору эндогенного ретровируса семейства HERV-K

  9. LTR-содержащие

  10. Структура LTR-содержащих элементов на примере ретровирусов.

  11. Механизм обратной транскрипции.

  12. Возможная эволюция LTR-ретротранспозоны Ретровирусы Эндогенные ретровирусы

More Related