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「 癌研究知識表現技術開発 」

「 癌研究知識表現技術開発 」. 100. 80. 60. 40. 20. 0. 0. 1. 2. 3. 目的 実験的なデータベース作成等を通じて癌の分子データと臨床情報の統合、表現を想定ユーザーにわかりやすい形で実現する。 実施事項 1 ．癌遺伝子発現臨床情報データベース の機能拡張。 2 ．臨床情報の整理（成人病センター乳腺内分泌外科症例）。 成果 CGED (Cancer Gene Expression Database) 臨床情報を利用する研究者のニーズを把握。. モザイクプロットによる分子及び臨床データ表示. カプランマイヤープロット.

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「 癌研究知識表現技術開発 」

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Presentation Transcript

  1. 「癌研究知識表現技術開発」 100 80 60 40 20 0 0 1 2 3 • 目的 • 実験的なデータベース作成等を通じて癌の分子データと臨床情報の統合、表現を想定ユーザーにわかりやすい形で実現する。 • 実施事項 1．癌遺伝子発現臨床情報データベース の機能拡張。 2．臨床情報の整理（成人病センター乳腺内分泌外科症例）。 • 成果 • CGED (Cancer Gene Expression Database) 臨床情報を利用する研究者のニーズを把握。 モザイクプロットによる分子及び臨床データ表示 カプランマイヤープロット 臨床 情報 遺伝子 発現 ９８乳癌症例

  2. 「癌研究知識表現技術開発」実施項目（成果）「癌研究知識表現技術開発」実施項目（成果） • 実験的データベースの開発 分子データと臨床情報の表現方法開発の試み モザイクプロットを利用した分子データと臨床情報の統合表示（CGED) 1) 癌遺伝子発現臨床情報データベース(Cancer Gene Expression Database, CGED) →　臨床情報から遺伝子を選択する機能を付加　実装済み →　神経膠腫など新規データのアップロード乳癌（抗癌剤耐性研究）、胃癌、甲状腺癌はアップロード済み、神経膠腫などは次年度以降の予定 2) 肺癌分子情報臨床情報統合データベース →　遺伝子発現以外のゲノム情報を付加した新しいデータベース今後の課題 2. 臨床情報の収集とニーズ調査 癌研究者のニーズは生存分析がほとんど。データベースの出力はKaplan-Meier解析が有用。 1) 成人病センター内の各種固形癌の臨床情報収集　乳癌は終了、他は今後の課題 2) 臨床医のニーズにあった知識表現技術のデザインデザインは終了、次年度以降データベースとしてとして構築　

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