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化 学 信 息 学

化 学 信 息 学. 乐 英 红 催化楼 314 Tel:22409 Email:yhyue@fudan.edu.cn. 如何面对出现的大量化学信息 ?. 束之高阁. 有效利用. 第一章 前 言. 1.1 产生的背景 化学学科的重要性 化学信息量的快速增长 计算机与网络技术的发展. 现 状

Anita
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Presentation Transcript


  1. 化 学 信 息 学 乐 英 红 催化楼 314 Tel:22409 Email:yhyue@fudan.edu.cn

  2. 如何面对出现的大量化学信息 ? 束之高阁 有效利用 第一章 前 言 1.1 产生的背景 • 化学学科的重要性 • 化学信息量的快速增长 • 计算机与网络技术的发展

  3. 现 状 截止1999年12月31日,美国化学文摘登记的分子、化合物和物相数目已超过23,000,000种,但有百年历史Merck Index,12th Ed.(1996),收录的分子和化合物只有10,330种,占0.05%,从最大的试剂商店和药房能买到的药品和试剂不超过10,000种。 所以目前在起作用(为人类服务和为非作歹)的分子和化合物不到0.05% ,而其中有突出贡献的更不到0.001% 。 99.9%以上的分子深藏在文献库中。

  4. 如果你挣了一大笔钱? • 存在银行里 ?(没有利息、贬值) • 再投资 ? 化学信息就是一个大金库 !!!

  5. A discipline buried by success Nature, 24 May 2001 Vol 411 no 6836, p.399 化学形象被与起交叉学科的成功所埋没 • 药物学 • 蛋白质组学 • 纳米技术 • 材料科学 … ...

  6. 1.2 化学信息学的定义 化学信息学是信息科学与化学的交叉学科 利用数学、统计学与计算机科学的理论、方法和网络技术作为手段,研究化学信息的获取、表示、管理、传播、分析、加工和应用,在此基础上进行知识创新,促进化学学科的发展。

  7. 1.3 化学信息学的内容 • 化学信息的产生和获取 • 利用检索工具 • 通过实验方法 ... … • 化学信息的表达、存储和管理 • 化学运筹学 • 数据整理可视化 • 数据库管理技术 ... ...

  8. 化学信息的加工和处理 • 化学计量学 • 化学软件 • 目的是获取更多的信息 ... … • 化学信息的深化 • 化学模式识别 • 计算机模拟设计... ...

  9. 3.4 本课程的目标 • 化学信息的获取 (重点) 图书, 工具书, 期刊, CA 检索, 专利检索, 网络检索等手段 • 网络和多媒体技术及在化学上的应用 化学信息的简单总结,表示

  10. 3.5 本课程的现实意义 • 今后科学研究的基础 科研的第一步 文献调研 (例子) • 科学方法的掌握 在其他领域的应用

  11. 第二章 科技文献及检索概论 2.1 科技文献的基本常识 • 科技文献的分类 印刷型、缩微型、声像型、光盘型…… 一次文献、 二次文献、 三次文献 …… (原始文献) (检索工具) (总结报告)

  12. 期刊 图书 会议文献 专利文献 科技报告 学位论文 技术标准 产品样本 目录 题录 文摘 索引 一次文献种类 二次文献种类

  13. 2.2 科技文献检索基础知识 • 科技文献检索的意义 假如一个化学家懂 30 国语言,每小时读 4 种杂志,一周阅读 40 小时,从年初开始,要读完全年化学文献,需要 10 年以上的时间  美国前化学文摘总编辑 Bernler

  14. 科技文献检索的途径 主题途径 作者途径 引文途径 其他途径 如号码途径、分类途径、关键词途径等

  15. 科技文献检索的方法 追溯法 工具法 交替法 手工检索 光盘检索 网络检索 其他途径

  16. 科技文献检索的步骤 分析检索课题  选定检索工具  确定检索途径  阅读二次文献  获取原始文献

  17. 第三章 美国“化学文摘” 3.1 概 况 • 名称 (CA,Chemical Abstract) • 内容 以化学化工为主,涉及生物、医学、轻工、冶金、物理等领域,最常用的检索工具. • 出版情况 周刊,两卷/每年,26期/卷 (1967-)

  18. 特 点 • 摘录广泛 收录 136 个国家 56 种文字出版的 14,000 多种期刊,包括期刊、图书、学位论文、科技报告、 会议论文、专利等,占总文献 98 % • 出版迅速 • 索引完备 • 组 成 CA文摘和 CA索引

  19. 3.2 CA文摘 • CA文摘的内容 以报道性为主,其内容包括研究的目的和范围、新的化学反应、化合物、材料、工艺、操作、设备、性质机器理论,新知识的应用,以及研究结果和作者的判断、结论等。

  20. CA文摘的编排方式 • 单期号 (一)生物化学 1-20 类 (二)有机化学 21-34 类 • 双期号 (三)大分子化学 35-46 类 (四)应用化学和化学工程 47-64 类 (五)物理化学、无机化学与分析化学 65-80 类

  21. CA文摘的信息 标题(篇名) ? 出处(来源) ? 作者 ? 单位 ? 地址 ? 其他  文字 ? 大小 ? 价钱 ? 不同类型的文献略有不同

  22. CA文摘的著录格式 论文题目 作者姓名 文摘号 A. 期刊论文 107:3735gGas-phase hydrolysis of proteins and peptides. Meltzer, Noel M.; Tous, Guillermo I.; Gruber, Stephen; Stein, Stanley (Schering-Plough Corp., Kenil worth, NJ07033 USA) Anal. Biochem. 1987, 160(2), 356-61 (Eng). 作者单位地址 原文文种 期刊名称 年份 卷号 页码

  23. 会议或出版物名称 B. 会议录和资料汇编 107:16969mStationary phase effects in RP-TLC/HPTLC. Gonnet, C.; Marichy, M. (Lab. Chim Anal., Univ. Claude Bernard, Lyon I, F-69622 Villeurbanne, Fr.) Proc. Mp. Instrum. High Perform. Thin Layer Chromatogr. 3rd. 1985, 49-60 (Eng). Edited by Kaiser, R. EInst. Chromatogr.: Bad Duerkheim, Fed. Rep. Ger. 会议录编者姓名 出版社及所在国家

  24. 报告总页数 C. 技术报告 107:15373aMicroemulsions and colloidal semiconductor dispersions. Graetzel, Michael (Ec. Polytech. Fed., Lausanne, Switz.). Report 1986.Order No. AD A173248/6/GAR, 19pp. (Eng). Avail NTIS.From Gov. Rep. Announce. Index (U.S.) 1987, 87(3), Abstr. No. 703870. 本文摘转摘自 报告收藏单位 技术报告编号

  25. 出版年份 D. 学位论文 107:15759fLaser induced silicon crystal growth mechanics.Grigoropoulos, Constantine (Columbia Univ., New York, NY USA). 1986.121pp. (Eng). Avail Univ. Microfilms Int. Order No. DA8703031.From Diss Abstr. Int. B 1987, 47(10), 4275 本文摘转摘自 论文收藏形式及序号

  26. 原书名的音译名 E. 新书 107:14456tWorld of Nuclear Energy. (Kaku Enerugi no Sekai)Suzuki, Eiji (Tokyo Denki University Press: Tokyo, Japan). 1986. 144pp. (Japan). Y1200 出版年份及总页数 原价(出版国家)

  27. 专利号 国际专利分类号 F. 专利 107:10494fFuel cell system. Tajima, Hiroyuki (Fuji Electric Co., Ltd.). U.S. US 4,657,828 (Cl. 429-12; H01M8/06)14 Apr. 1987, JP Appl. 85/75,579, 10 Apr. 1985; 4pp. 专利公布或批准日期 专利申请号 专利申请日期

  28. 3.3 CA的索引 • CA索引体系 (一)分期索引 每期文摘后 (二)卷索引 每半年 (三)累计索引 每十年

  29. 物质的名称或表示事物的概念性名称 CA索引介绍 • 主题索引( Subject Index ) (一)1907-1915年 初级阶段 (二)1916-1966年 发展阶段 (三)1967-1971年 成熟阶段 (四)1972-至今 分成 化学物质索引 和 普通主题索引 出现索引指南

  30. 副标题 文摘号 标 题 说明语 主题索引的例子 Acetic acid, analysis chromatog. of,70:26684w Acetic acid,preparations purification of,by cation exchange,70:91101t Acetic acid,compounds calcium salt catalysts, for manuf. of,phenol condensation products,70:58536r

  31. 化学物质索引(Chemical Substance Index) 化学成分确定、结构明确、价键清楚的化学物质作为索引的标题,按字序排列,是CA索引中使用最广泛的索引之一。 包括:已知的元素、化合物及衍生物、特种 金属的合金、矿物、特殊化合物的混合物和聚合物、各种抗菌素、酶、激素、蛋白质、多糖及基本粒子等

  32. 化学物质索引以化学物名称为主题词,按字顺排列,基本格式如下: 化学物质索引以化学物名称为主题词,按字顺排列,基本格式如下: 主题词(登记号) 副标题 说明语 文摘号

  33. 登记号 CA文摘号 普通副标题 化学功能副标题 取代基 A.化学物质索引的格式 Benzoic acid [65-85-0] B1246g,R28695b Benzoic acid [65-86-0],analysis chromatog. of,75444t Benzoic acid [65-86-0],compounds aluminum salt [555-32-8],catalysts,116449u Benzoic acid —,4-acetyl-[586-89-0],56669d

  34. B. 化学物质索引的编排程序 化合物名称  普通副标题  化学功能基副标题  取代基(字母顺序) • analysis • biological studies • occurrence • preparation • properties • reactions • uses and miscellaneous Acetals;anhydrides; anhydrosulfides;compounds derivatives;esters; ethers;hydrazides; hydrazones;lactones; mercaptals;mercaptoles; oxides;oximes; polymers

  35. C. 化学物质索引的说明语 对索引标题起说明和解释作用。(采用倒读法) Benzene [71-43-2], reaction reaction of with at. oxygen. Mechanism of, 159507d mechanism of reaction benzene with at oxygen (苯与氧反应的机理) Benzoic acid [65-85-0], analysis detn. of, in food, 41804d detn. Of benzoic acid in food (食品中苯甲酸的测定)

  36. D.检索实例 检索有关“发酵法 L-赖氨酸”的文献 一. 选择主题词 L-赖氨酸(L-lysine) 二. 选择副标题 制备(preparation) 三. 根据选定的标题、副标题查阅化学物质索引 以 105 卷为例,查得: L-Lysine [56-87-1],preparation manuf. of by fermn.,R 113473m 四. 查阅文摘,决定是否需要获取原始文献

  37. 检索有关“聚2-甲基丙烯酸甲酯机械性能”的文献检索有关“聚2-甲基丙烯酸甲酯机械性能”的文献 一. 选择主题词 propenoic acid,2-methyl- 二. 选择副标题 esters(酯) 三. 查阅化学物质索引 以 105 卷为例,查得: 2-Propenoic acid,2-methyl [799-41-4],esters methyl ester homopolymer [9011-14-7] mech. Properties and durability of,liq. Medium and stress effect on, 192114w mech. Properties of,solvent immersion effect on,115760b 四. 查阅文摘,决定是否需要获取原始文献

  38. 普通主题索引(General Subject Index) 收录除具体化学物质名之外的其他有关化学化工主题,大致包括化学物质大类名、成分未确定的化合物,有关物化概念和现象、化学反应名称及化工过程和设备、生物化学和生物学主题,是CA最主要的索引之一。 除化学物质名称外的所有名称

  39. 普通主题索引的格式 副标题 Acids, analysis detn. of in crude oil by water extn., 45554m Acids, use and miscellaneouss removal of from magnesium sulfite liquors, P2685a 说明语 文摘号

  40. 检索实例 检索 有关“流化床反应器设计”的文献 选择主题词 反应器(Reactor) 以 105 卷为例,查得: Reactor fluidized-bed of design and performence of,gas-solid reactions in relation to,118047k 查阅文摘,决定是否需要获取原始文献

  41. 普通主题索引与化学物质索引 既有区别又有联系,检索时应相互结合 如:检索“烷基苯磺酸盐表面活性剂的废水处理方法” 可用“苯磺酸”“衍生物”查化学物质索引 也可用“表面活性剂”“磺酸盐类”查普通主题索引 适当的索引 快速、全面的资料

  42. 个人作者 团体名 • 作者索引(Author Index) 将作者、合作者、团体名称(企业、研究机构等)按字序混合编排,个人作者以姓在前,名在后。 期索引的格式: Masson A 246438s Masson C R 246008b Matsushita R 249135b Matsushita Electric Industrial Co. Ltd. P238230c

  43. 原始文献篇名 第一作者 其他作者(非第一作者) . 卷索引的格式: Boatman, Rodney J. —; Cunningham, S. L.; Ziegler, D. A. A method for measuring the biodegradation of organic chemicals, 1734r Cunningham, S. L. see Boatman, Rodney J.

  44. . 卷索引与期索引的区别: 期索引只有文摘号,无题目, 所有作者后都有文摘号 卷索引有文摘号和篇名 但只有第一作者后才有 作者索引的特点: 稳定、使用方便,跟踪最新进展

  45. 专利授权国 文摘号 专利号 • 专利索引(Patent Index) A. 专利号索引(Numerical Patent Index) 按所收录专利的国家简称字顺编排,相同国家的按专利号大小排列 GREMAN 2947001 172314s UNITED STATED  4177056 8976p 141 9996g 4191013 98325c

  46. 文摘号 相同专利 CA首次报道的专利 • 专利对照索引 (Patent Concordance) 用于检索相同专利,以调节文种及馆藏 GERMAN 254280 Brit 152361 86:24448d Can 1081523 2925524 US 4190419 UNITED STATE 4190419 Brit 2030291 93:3438e Fr 2436994 Ger 2925524

  47. 专利检索的例子 检索联邦德国专利2925524的相同专利及其文摘 DE 2925524  US 4190419  无文摘 US 4190419  Brit 2030291 Fr 2436994 Ger 2925524 93:3438e 查阅文摘

  48. 专利索引(Patent Index) 1981年起,由专利号索引和专利对照索引合并。 已知某篇与课题有关的专利,利用专利索引 就能查到与发明内容基本相同的所有专利文献

  49. 相同专利 部分连续专利 相关专利 专利索引的格式 JP (Japan) 59/074288A2 [84 74288],101:160176u US 4483748A US 4545863A(Continuation-in-part) 104:98148t 59/078527A2 see EP 107356A2 59/074288A2 [84 93055],101:210764g AU 560016B(Related)

  50. 分子式索引(Formula Index) 按分子式符号的英文字顺序排列,相同分子式下又按化学物质名称的字顺序排列。 # 分子式按 Hill 系统排列 含碳化合物碳在前、氢在后,其他按字序; 不含碳化合物按分子式内元素字序。

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