1 / 25

Передовой опыт использования геномной селекции в отечественной практике

Передовой опыт использования геномной селекции в отечественной практике. Л.А. Калашникова Заведующая лабораторией ДНК-технологий ВНИИплем, доктор биологических наук, профессор. Использование ДНК-маркеров обеспечивает. Оценку достоверности происхождения Выявление генетических аномалий

yoland
Download Presentation

Передовой опыт использования геномной селекции в отечественной практике

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Передовой опыт использования геномной селекции в отечественной практике Л.А. Калашникова Заведующая лабораторией ДНК-технологий ВНИИплем, доктор биологических наук, профессор

  2. Использование ДНК-маркеров обеспечивает Оценку достоверности происхождения Выявление генетических аномалий Выявление посторонних включений в ДНК (провирусная, чужеродная ДНК) Маркирование признаков продуктивности Анализ степени родства

  3. ДНК-оценка генетических аномалий Обязательно тестируется у быков-производителей, имеющих любую долю голштинской крови ! BLAD - наследственный иммунодефицит, CVM - синдром деформации позвоночника BY – синдром костной деформации «брахиспайн»

  4. ДНК-маркеры продуктивных признаков ДНК-маркеры молочной продуктивности, качества и технологических свойствмолока – CSN3, LGB, PRL, GH,LEP, DGAT1

  5. Оценка достоверности происхождения Вероятность исключения неправильных записей об отцовстве при использовании 6 STR- локусов – 99% 11STR- локусов - 99,99% Микросателлитный анализ – по 12 локусам, утвержденным ISAG

  6. ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ БЫКОВ ХОЛМОГОРСКОЙ ПОРОДЫ

  7. С 1 января 2009 года новая официальная оценка - молочного скота в США включает в себя 40000 генетических маркеров на каждое животное – это SNPs

  8. Секвенирование генома крупного рогатого скота ACGGTCGATCGGCCTAGCTAGCTAGCCTAGCCTATATAGCGCTAGCTACGATCGGATCGATCCGATCGATCGATATGCTCGATGCAGTCGATAGTT 30 пар хромосом 3 биллиона нуклеотидов от каждого родителя

  9. Однонуклеотидные полиморфные варианты - снипы (SNP) ACGGTCGATCGGCCTAGCTAGCTAGC ACGGАCGATCСGCCTAGCTТGCTAGC

  10. Генотипирование Illumina Bovine SNP50 BeadChip™, 2007

  11. Темпы генотипированияпо SNP 2007 - Illumina Bovine SNP50 BeadChip™ Январь 2009 –генотипировано 15860 голов (из них более 15000 быков). Март 2009 – генотипировано более 23000 голов И так далее В настоящее время в США и Канаде генотипированы все быки-производители голштинской и джерсейской породы

  12. Новая оценка по SNP обеспечивает Все эти задачи решаются одновременно, одноактным анализом одной пробы. Опроделение достоверности происхождения Выявление генетических аномалий; Маркирование продуктивных признаков; Определение степени родства и генетической гетерогенности.

  13. Однонуклеотидные маркеры (SNP) для генетической идентификации, утвержденные ISAG

  14. Сравнительный тест ISAGпо 100 SNP - маркерам 63% маркеров показало соответствие 100% 34% маркеров показало соответствие 98-99.65% 2% маркеров показало соответствие 94-97.7%.

  15. Анализ генома позволяет на уровне ДНК определить, какие именно участки генома и варианты генов унаследовало данное животное от своих предков и может передать потомкам, и таким образом дать более точный прогноз его племенной ценности. Что дает геномная оценка ?

  16. Голштинская порода Точность прогноза племенной ценности по быкам (генотипировано более 14000 голов) возросла в среднем по всем признакам на 25%. Точность прогноза по содержанию жира в молоке возросла на 43%, выходу молочного жира – на 33%, содержанию белка - на 34%, выходу молочного белка – на 22%.

  17. Что еще дает геномная оценка ? Использование молодых быков позволяет ускорить генетический прогресс молочных стад на 50%! Переход на раннюю оценку быков и ускоренное их использование как оцененных по результатам геномной оценки

  18. GPTAвычисляетсяна основе прямого анализа ДНК, определяющего наследование важных функциональных генов данным животным; собственных индивидуальных показателей; информации о происхождении; информации о потомстве.

  19. Выбор быка 200 000 рожденных бычков 2000 длягеномного теста 200 ставятся на испытания 20 отбирают к 14 месячному возрасту Семенем молодых быков осеменяют ≈ 30% коров В возрасте 57 месяцев остается не более 10 элитных быков

  20. Сотрудничество в рамках проекта ЕвроГеномикс по голштинской породе • Объединение референтных популяций для улучшения надежности оценки • 20 000оцененных быков (самая большая популяция голштинской породы в мире) • Европейские партнеры: • Викинг Генетикс • UNCEIA – Франция • CRV – Голландия • DHV и VIT – Германия • CONAFE – Испания

  21. Значимость новой генетической оценки для эффективности селекции приравнивают к значимости искусственного осеменения

  22. Использование геномной оценки в России Оценка по SNP главных генов Закупки за рубежом с учетом GPTA Оценка импортных животных на основе генотипирования и зарубежных баз данных Оценка животных отечественной селекции на основе генотипирования и ???

  23. Стоимость анализа 100 - 200 SNP - только идентификация - 2700 рублей 9000 SNP - идентификация + GPTA для крс с достоверностью 70% - 3700 рублей 50000 SNP - идентификация + GPTA для крс с достоверностью 74% + дополнительные тесты (BLAD, бета-лактоглобулин, бета-казеин A/B, каппа-казеин A/B/E, DUMPS, цитруллинемия) - 9300 рублей.

  24. БЛАГОДАРЮ ЗА ВНИМАНИЕ

More Related