DNA
This presentation is the property of its rightful owner.
Sponsored Links
1 / 4

DNA 序列中基因的預測(可利用 NCBI ORF finder 、 GENEMARK 、 Easy gene ) ↓ BLAST 搜尋比對所轉譯的胺基酸序列 ↓ 選取 15-20 個序列序列 PowerPoint PPT Presentation


  • 224 Views
  • Uploaded on
  • Presentation posted in: General

DNA 序列中基因的預測(可利用 NCBI ORF finder 、 GENEMARK 、 Easy gene ) ↓ BLAST 搜尋比對所轉譯的胺基酸序列 ↓ 選取 15-20 個序列序列 ↓ Display setting--FASTA text ↓ 複製到記事本中 ↓ 修改呈現的文字內容. ↓ 將記事本中文字複製,利用 DDBJ 中的 Clustal W( 多序列比對分析 ) 排比分析 (或將序列貼到 SDSC 中,再以 Clustal W 排序) ↓

Download Presentation

DNA 序列中基因的預測(可利用 NCBI ORF finder 、 GENEMARK 、 Easy gene ) ↓ BLAST 搜尋比對所轉譯的胺基酸序列 ↓ 選取 15-20 個序列序列

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Presentation Transcript


Dna ncbi orf finder genemark easy gene blast 15 20

DNA序列中基因的預測(可利用NCBI ORF finder、GENEMARK、Easy gene)

BLAST搜尋比對所轉譯的胺基酸序列

選取15-20個序列序列

Display setting--FASTA text

複製到記事本中

修改呈現的文字內容


Dna ncbi orf finder genemark easy gene blast 15 20

將記事本中文字複製,利用DDBJ中的

Clustal W(多序列比對分析)排比分析

(或將序列貼到SDSC中,再以Clustal W 排序)

下載比對後的檔案(*.dnd, *.ph),以treeview軟體打開檔案,選第四種格式

選save as graphic,存成*.emf格式

打開powerpoint、插入→圖片→從檔案(選剛剛儲存的檔案)


Dna ncbi orf finder genemark easy gene blast 15 20

在圖片點一下,按右鍵→群組物件→取消群組

(將圖形有文字的部分拉大至接近整個版面)

再按一次右鍵→群組物件→取消群組

(不要隨意拉大任一條線,需整體調整,以免演化樹的結果失真,與原圖比較修正消失的最左邊連接線)

找出圖形修改工具,逐一修改文字(18或20的大小)、線條顏色大小

將線與文字位置對齊、形狀跑掉的圖形要回去參照treeview軟體的原始檔案,修改成一樣,放大版面修改會較精確些


Dna ncbi orf finder genemark easy gene blast 15 20

Clostridium sp. 7_2_43FAA.

Clostridium lentocellum DSM 5427

C. perfringens JGS 1987

C. perfringens 13

C. perfringens ATCC 13124

C. sticklandii DSM 519

Eubacterium dolichum DSM 3991

C. ramosum DSM 1402

C. botulinum B 17B

C. botulinum E43

10%

圖:短小桿菌幾丁質水解酵素胺基酸序列與其他細菌相似基因之胺基酸序列,

利用多序列比對軟體CLUSTAL W 比對所得到的親緣性圖譜。

左下方短棒長度代表10%胺基酸序列取代。


  • Login