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LtzS BÖHM Alexander EV MARÉCHAL Cyril

Développement et optimisation de services WebGIS interactifs et communautaires pour l’analyse intégrée de données spatiales environnementales et moléculaires. LtzS BÖHM Alexander EV MARÉCHAL Cyril. PU Christophe CLARAMUNT. Dr. Stéphane JOOST. Problématique.

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Presentation Transcript


  1. Développement et optimisationde services WebGIS interactifs et communautairespour l’analyse intégréede données spatiales environnementales et moléculaires LtzSBÖHM Alexander EV MARÉCHAL Cyril PU Christophe CLARAMUNT Dr. Stéphane JOOST

  2. Problématique Déveloper des services WebGISinteractifs et communautaires pour chercheurs en écologiemoléculaire et décideurs publics: quelsenjeux, quelles solutions? LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  3. Plan Plan Introduction • Situation: formulerles besoins et identifier les utilisateurs • Analyse des besoins en écologiemoléculaire • Démarchescientifique • Évaluation IHM des solutions • Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOME • Interface de GENOMAP • Systèmed’utilisateurs de GENOMAP • Visualisation des donnéesenvironnementaleset génétiquesdans GEOME • Interface de GEOME • Execution: Synthèse entre modèlesinteractionnelsuniversels et cohérencespatiale • Avantages des l’interfacesintégrées de GENOMAP de GEOME • Deuxplateformescollaboratives au service de la biodiversité Conclusion, Limites Références LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  4. Introduction Introduction • Situation: formulerles besoins et identifier les utilisateurs • Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOME • Execution: Synthèse entre modèlesinteractionnelsuniversels et cohérencespatiale Conclusion Références LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  5. Introduction Introduction LASIG, EPFL, Lausanne, SUI EN, Lanvéoc-Poulmic, FRA Figure 2 : Campus de l’ÉcoleNavale Figure 1 : GC D2 415 LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  6. Introduction ÉcoleNavale et PFE • FHM • D&I • Éthique • GEOPOL • EPMS • Stages Leadership • FMM • NAV, ASTRO, Voile, BIM • Corvette: BIN, BE • SCI • TC: SSA, STIC, STM, MTI • VA: GM, GE, EM, ASM, SIM • PFE • 46 binômes • 21 projets à l’étranger + 2 outre-mer • 13 pays Figure 3 : Vuedepuis la passerrelle d’un BE devantDunkerque avec unemer 3 Figure 4 : Cours dispenses le semestre de VA. LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  7. 1. Situation Introduction • Situation: formulerles besoins et identifier les utilisateurs • Analyse des besoins en écologiemoléculaire • Démarchescientifique • Évaluation IHM des solutions • Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOME • Execution: Synthèse entre modèlesinteractionnelsuniversels et cohérencespatiale Conclusions, Limites Références LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  8. 1. Situation Définition des contextesd’utilisations Figure 5 : Schéma de extraction et du séquençage d’ADN. [1] LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  9. 1. Situation Démarchescientifique Fig. 6 : Workflow “Développementcentréutilisateur” Fig. 7 : UCD @ GENOMAP LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  10. Évaluationergonomique Fig. 8 : GENOMAP Index Fig. 9 : GEOME Homepage LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  11. 1. Situation GENOMAP USE CASES GENOMAP USE CASES: Mode “Public” Fig.10: GENOMAP use case diagram 1 LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  12. 1. Situation GENOMAP USE CASES GENOMAP USE CASES: Mode “Public” Mode “Private” Plus d’options de personnalisation Fig. 11: GENOMAP use case diagram 2 LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  13. 2. Mission Introduction • Situation: formulerles besoins et identifier les utilisateurs • Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOME • Interface de GENOMAP • Systèmed’utilisateurs de GENOMAP • Visualisation des donnéesenvironnementaleset génétiquesdans GEOME • Interface de GEOME • Execution: Synthèse entre modèlesinteractionnelsuniversels et cohérencespatiale Conclusion, Limites Références LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  14. 2. Mission Interface de GENOMAP • Carte Openlayers • Accès libre • Affichages des études accessibles • Système d’utilisateur: études «privées» • Génération d’url d’accès aux études privées • Sélection de couleur prédéfinies • Affichage de trois légendes et de Landmark sur la carte • Tutorial LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  15. 2. Mission Système d’utilisateurs de GENOMAP • Inscription libre • Sélection du statut privée/public • Palettes de couleurs personnalisable • Mise à jour de l’étude • Réinitialisation du mot de passe • Administrateur 2. Mission LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  16. 2. Mission • Visualisation des donnéesenvironnementales et génétiquesdans GEOME LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  17. 2. Mission • Visualisation des donnéesenvironnementales et génétiquesdans GEOME • Fichier JSON limité à 1 degré autour de l’étude • Chaque fichier contient les valeurs des 12 mois et annuelle LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  18. 2. Mission • Visualisation des donnéesenvironnementales et génétiquesdans GEOME LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  19. 2. Mission Interface de GEOME LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  20. 3. Execution Introduction • Situation: formulerles besoins et identifier les utilisateurs • Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOME • Execution: Synthèse entre modèlesinteractionnelsuniversels et cohérencespatiale • Avantages des l’interfacesintégrées de GENOMAP et de GEOME • Deuxplateformescollaboratives au service de la biodiversité Conclusion, Limites Références LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  21. 3. Résultats Avantages des l’interfacesintégrées de GENOMAP et de GEOME • L'interface de visualisation de GEOME et de GENOMAP • offre l'exploration des données statistiques et binaires géoréférencées; • offre un fort degré d'interactivité avec les éléments représentés; • Cette interactivité permet notamment : • de sélectionner des individus ou populations; • d'interroger des surfaces de la couche des données environnementales; • d'appeler des informations dérivées; • d'appliquer des analyses statistiques ou spatiales; • Les concepts principaux qui régissent l’interface sont: • Réduire la charge cognitive ; • Mettre le contrôle entre les mains de l'utilisateur. [2] LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  22. 3. Résultats Avantages des l’interfacesintégrées de GENOMAP et de GEOME • La dynamique assure la cohérence • entre les différentes représentations; • entre la carte et les tableaux de bords; • « Le concept de tableau de bord repose sur l'intégration au sein d'une même interface d'éléments de représentation graphique complémentaires »[2] , tels que : • Compteurd’individus • Position (LAT, LON) • Valeurs précises des paramètresenvironnementaux • « L'utilisateur doit pouvoir obtenir directement les éléments nécessaires au suivi des valeurs et à une prise de décision éclairée et rapide ». LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  23. Conclusion, Limites Introduction • Situation: formulerles besoins et identifier les utilisateurs • Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOME • Execution: Synthèse entre modèlesinteractionnelsuniversels et cohérencespatiale Conclusion, Limites Références LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  24. Conclusion, Limites Limites • GENOMAP • Basemap après chargement de données(Gmaps…) • RETEX • GEOME • Grandesétudes: optimisation des JSON • Lecture du nom d’individudans le JSON • Affichageprecipitation: limites des valeurs • Inscription doit passer par un administrateur. • Lenteur d’affichage pour les études couvrant une grande surface LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  25. Conclusion, Limites Intérêt • Visualiser des données difficiles à se représenter • Faibles connaissance techniques nécessaires • Accessibilité optimale • Ne nécessite pas d’installation de logiciel • Outils de calculs performant pour GEOME: Sambada (S.Stucki) LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  26. Références Références • Présentation PFE - CF KESSLER 27 06 2013, http://cours.ecole-navale.fr/mod/resource/view.php?id=2522 (30.07.2013, 13h00) • [1] http://wwz.ifremer.fr/lareunion/Medias-Ifremer/Medias-Lareunion/CAMP-SOOI/Sequencage-ADN (08.11.2013, 08h21) • [2]Pointet, A., Solution de cartographie statistique distribuée mapIntera™, PPT, juin 2009 LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  27. Merci pour votre attention!-Thank you for having paid attention to our presentation! Questions LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  28. LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  29. LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  30. LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  31. LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  32. LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  33. LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL

  34. Futur travaux • Améliorer interface: separerfenêtres (+ sobre) • Database information on demande • Color selection and creation in popups • Generate URL to share in popup • Evaluate logs : traductionsdansd’autreslangues • Transferttechnologique (?): • futurOpenLayers 3.0 • Django & GEOME • Téléchargement des données • Extraction d’imagesannotées • Visualisation de graphes • études de diversitégénétique • = projetSemestred’uneétudianted’ici • et qui utiliseranotre service 19/09/2013 EV2 Böhm, Maréchal

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