Proteiner enzymer
This presentation is the property of its rightful owner.
Sponsored Links
1 / 32

Proteiner, Enzymer PowerPoint PPT Presentation


  • 200 Views
  • Uploaded on
  • Presentation posted in: General

Proteiner, Enzymer. Biologisk kemi, 7,5p, KTH Vt 2010 Märit Karls. Länk till sida med enzymer. Proteinstruktur. Primärstruktur Sekundärstruktur Tertiärstruktur Kvartärstruktur. Så här bildas tertiär struktur. Fiberprotein. Olösliga i vatten Kollagen i bindväv, brosk, ben, ligament

Download Presentation

Proteiner, Enzymer

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Presentation Transcript


Proteiner enzymer

Proteiner, Enzymer

Biologisk kemi, 7,5p, KTH

Vt 2010

Märit Karls

Länk till sida med enzymer


Proteinstruktur

Proteinstruktur

  • Primärstruktur

  • Sekundärstruktur

  • Tertiärstruktur

  • Kvartärstruktur

Så här bildas tertiär struktur


Fiberprotein

Fiberprotein

  • Olösliga i vatten

    • Kollagen i bindväv, brosk, ben, ligament

    • Elastin, brosk, blodkärlsväggar

    • Keratin, hår, naglar, många S-S bryggor

    • Myosin, i muskler

    • Fibrin, behövs för koagulation


Globul ra protein

Globulära protein

  • Vattenlösliga

  • Albumin

  • Globulin

  • Hemoglobin, läs om till seminariet!

  • Insulin

  • Många olika enzymer


Hydrolys av protein

Hydrolys av protein

  • Bryter ned primärstruktur

  • Proteaser, peptidaser är enzym som hydrolyserar peptidbindningar

  • Inaktiva förstadier kallas zymogener

  • Endopeptidaser, olika specificitet

    • Pepsin, trypsin

  • Exopeptidaser

    • Karboxy- eller aminopeptidaser


Denaturering av protein

Denaturering av protein

  • Bryter bindningar i tertiär-och kvartärstruktur, se tab. 20.2, s. 587

  • Rymdstrukturen förstörs, primärstruktur oförändrad

  • Vilken typ av bindning påverkas av:

  • Värme?

  • Vispning?

  • Syra eller bas?

  • Organiska lösningsmedel?


Proteiner i cellmembran

Proteiner i cellmembran

  • Funktion

  • Transport

    • Jonkanaler

    • Gap junctions

      • Fig. 20.12

    • ”Carrier”

  • Receptorer

    • ”recognition”

Se även fig. 20.13 Holum

http://sun.menloschool.org/~cweaver/cells/c/cell_membrane/


Transport genom membran jonpumpar

Transport genom membranJonpumpar

  • Funktion: Att upprätthålla en koncentrationsgradient över membranet

  • Ex. Natrium-kalium ATPas

  • Na+-konc.: i celler: 10 mmol/L

  • i plasma: 140 mmol/L

  • K+-konc. i celler: 125 mmol/L

  • i plasma: 4 mmol/L


Transport genom membran faciliterad diffusion carrier

Transport genom membranfaciliterad diffusion, ”carrier”

  • Ex.: Glukostransportörer

    • I cellmembranet på muskel- och fettceller finns protein som underlättar för glukos att ta sig in i cellerna.

    • Insulin krävs för att glukostransportörerna skall bildas cellmembranet.

Titta på glukostransportör!


Receptorer p cellytan

Receptorer på cellytan

Förmedlar signaler in i cellerna

Glykoproteiner, kolhydrater känner igen molekyler

Varje celltyp har specifika receptorer

Ex. Insulinreceptorn

http://en.wikipedia.org/wiki/Insulin_receptor


Enzym

Enzym

  • Vad är ett enzym?

    • En molekyl som påskyndar biologiska reaktioner, en katalysator

  • Vad består ett enzym av?

    • Apoenzym, oftast ett protein

    • Cofaktor,

      Vissa enzymer består av RNA, ovanligt


Cofaktor

Cofaktor

  • Coenzym,

    • Organisk förening ej kovalent bunden

    • Ofta vitamin

    • Ex. NAD+, NADP+, FAD s.604 ”monstrous structures”

  • Prostetisk grupp

    • Kovalent bunden till proteinet

    • Ex. Hem-grupp i hemoglobin

  • Metalljon, Zn2+, Fe2+, Fe3+ mm


Exempel p typer av enzym

Exempel på typer av enzym

  • Hydrolas

    • Proteas, peptidas

    • Amylas, 1,6-glukosidas

  • Oxidoreduktas

  • Lipas (esteras)

  • Transferas

    • Aminotransferas flyttar aminogrupp

    • Kinaser flyttar fosfatjon


Ex gpdh

Ex. GPDH

  • Glycerol Phosphate

    DeHydrogenase

    i elektrontransportkedjan

  • Cofaktor FAD

  • Ett av kroppens ”hushållsprotein”, finns i alla celler

  • House-keeping gene, ”påslagen” i alla celler

http://fig.cox.miami.edu/~cmallery/255/255atp/255makeatp.htm


Dehydrogenaser

Dehydrogenaser

  • En typ av oxidas

  • Kräver alltid ett coenzym

  • NAD+ + AH2 ↔ A +NAD:H + H+

  • NAD+ tar emot ett par elektroner, blir reducerad form

  • NAD+ + H:-  NAD:H skrivs oftast NADH

  • Andra ”elektronbärare”: NADP, FAD


Proteiner enzymer

NADP

http://www.bio.davidson.edu/courses/Bio111/NADPH.html


Enzymer biokatalysatorer

Får reaktionen att ta en annan väg, med lägre Ea

Snabbare reaktion

ex. karboanhydras

107 ggr snabbare än utan enzym!

Påverkar inte jämviktsläget

Enzymer = biokatalysatorer

http://www.columbia.edu/cu/biology/courses/c2005/purves6/figure06-14.jpg


Proteiner enzymer

Enzymer är specifika,

passar bara “sitt” Substrat

Här i den aktiva ytan sker reaktionen!

Substratet inducerar en förändring

i aktiva ytan, ett aktiverat komplex kan bildas

Se även fig. 21.2 s.606

http://wps.prenhall.com/wps/media/objects/724/741576/

Instructor_Resources/Chapter_24/Ch24MR.ppt#291,29,Bild 29


S h r fungerar enzym

Så här fungerar enzym

Pyruvatdehydrogenaskomplex

Titta på animering!


Hexokinas r d innan substratet binds gr n n r substratet har bundit

Hexokinas: Röd = innan substratet bindsGrön= när substratet har bundit

Induced-fit model

http://wps.prenhall.com/wps/media/objects/724/741576/

Instructor_Resources/Chapter_24/Ch24MR.ppt#292,30,Bild 30


Varf r passar substratet i den aktviva ytan

Varför passar substratet i den aktviva ytan?

  • Sidogrupper på aminosyror i enzymet och substratet kommer i rätt position

    • Geometriskt, passar steriskt

    • Kemiskt, hydrofob, vätebindning, jonbindning

  • Grupper i enzymet kan stabilisera det aktiverade komplexet

  • Flera enzymer innehåller metalljoner som katalysatorer

  • Ofta är både enzym och substrat kirala

    • Vänster eller höger isomer (spegelbildsisomeri)


Proteiner enzymer

Exempel på aktiva ytan i tre olika enzym. Alla klyver peptider, men de

Föredrar olika substrat

Trypsin binder långa basiska a.s.

t.ex.:

Elastas binder små a.s.

t.ex.:

Chymotrypsin binder flata, opolära a.s.

t.ex.:


Carboxypeptidase a katalyserar hydrolys av c terminal peptid

Carboxypeptidase A katalyserar hydrolys av C-terminal peptid

OBS! Zn2+

Vad händer vid pH-

förändring?


Enzymer r temperaturberoende

Varför går reaktionen snabbare mellan 0-40 ºC?

Vad händer efter

40 ºC?

Enzymer är temperaturberoende

http://www.bbc.co.uk/schools/gcsebitesize/chemistry/chemicalreactions/5enzymesrev4.shtml


Enzymaktivitet r ph beroende

Enzymaktivitet är pH-beroende

  • Vilka sidokedjor ändras vid olika pH?

  • Vad händer med laddningar på sidokedjorna när pH sänks?

  • Vad händer med laddningar på sidokedjorna när pH höjs?

  • Rätt laddning vid opimalt pH

  • Fig. 21.1 s.602


Enzymaktivitet beror av substratkoncentration

Enzymaktivitet beror av substratkoncentration

  • Fig. 21.4 s. 608

  • Enzymmättnad

  • Alla platser på enzymet är upptagna

  • Mer substrat får vänta på sin tur

http://www.steve.gb.com/science/enzymes.html


Reglering av enzym allosterisk aktivering

Reglering av enzymAllosterisk aktivering

  • Vissa enzymer aktiveras inte förrän det finns tillräckligt med substrat

  • Allosterisk betyder: aktiveringen sker på annat ställe än den aktiva ytan

  • Jmf syre binder till Hb

Sigmoidal kurva

Fig. 21.5 s. 612


Allosterisk aktivering

Allosterisk aktivering

Substrat

Effektor

Fig. 21.6 s. 613


Feedback inhibering

Feedback inhibering

  • Vanlig mekanism i naturen

  • Ett sätt för kroppen att hushålla med resurser

  • När tillräckligt mycket av en amino-

    syra bildats, stoppas syntesen av nya molekyler

http://fig.cox.miami.edu/~cmallery/255/255atp/ecb4x38.jpg


Kompetitiv inhibering

Fig. 21.7 b s. 614

Behöver inte vara feedback mekanism

Andra ex.

Antibiotika

Sulfa blockerar syntes av folsyra i bakterier

Gifter

Kompetitiv inhibering

http://student.ccbcmd.edu/courses/bio141/lecguide/unit6/genetics/protsyn/regulation/u4fg5a.html


Icke kompetitiv inhibering

Icke-kompetitiv inhibering

  • Ex. Cu2+, Ag+, Hg2+, Cd2+

  • Tungmetaller binder till SH-grupper i enzymets proteinkedja (inte till aktiva ytan), enzymets tredimensionella struktur ändras, substratet passar inte till aktiva ytan


F rbered seminarium

Förbered seminarium

  • Sickle cell anemi

  • Syfte: Få insikt om hemoglobinets funktion, samt om hur mutationer i vår arvsmassa kan orsaka sjukdomar

  • Läs kap. 23.3 s. 651-5!


  • Login