L’amélioration génétique dans l’élevage laitier

1. L’amélioration génétique dans l’élevage laitier

2. Méthodes d’indexation : les principes • Indexer = estimer la valeur génétique des animaux à partir de deuxtypes d’information, les performances mesurées et les généalogies. • la base de tout protocole d’évaluation génétique : identification des animaux, leur filiation et le contrôle de leurs performances • L’index = meilleure estimation de la valeur génétique d’un reproducteur ( valeur génétique la plus probable)

3. L’INEL en France • Une méthode internationalement reconnue pour des index fiables : (depuis mars 1990) • 5 index élémentaires : • Quantité de lait (QL) : en kg • Quantité de matière grasse (MG) : en kg • Quantité de matière protéique (MP) : en kg • Taux butyreux (TB) : en ‰, ou en g/kg • Taux protéique (TP) : en ‰, ou en g/kg • 1 index synthétique = combinaison des 5 index • INEL INdex Economique Laitier • INEL = 1,15 (MP + 3TP)

4. L’INEL en France • fondée sur une méthode« BLUP appliquée au modèle animal » • BLUP = Best Linear Unbiased Predictor (meilleur prédicteur linéaire non biaisé) • Méthode statistique complexe : permet l’analyse simultanée des effets de milieu identifiées et des effets génétiques • «modèle animal» : considération de l’individu qui réalise la performance (et non son père ou son grand-père maternel)

5. L’INEL en France • Avantage du « modèle animal » : • considération de toutes les relations de parenté • tous les individus pris encompte et formules de calcul identiques pour tous lesanimaux comparaison directe • prise en compte des effetsde la sélection passée • tient compte des accouplementsraisonnés • autres sources de biais également prises en compte

6. L’INEL en France • L’index de valeur génétique d’un animal exprime sa valeur en tant que reproducteur. • Lasomme de l’index de valeur génétique et de la valeur individuelle non transmissible (A + V)exprimerait quant à elle la valeur de l’animal en tant que producteur.

7. L’ISU • Intégration des caractèresfonctionnels et morphologiques dans l’INEL : 04/02 • ISU (Index de Synthèse Upra) : il traduit l’objectif de sélectiond’une race et est défini au seinde l’UPRA (unité nationale de Promotion de la Race) • Les caractères d’intérêt économique ajoutés : • Fertilité femelle • Comptage cellulaire • Longévité fonctionnelle résiduelle • Format ou développement

8. L’ISU • Fertilité femelle : • action sur les réformes pour infertilité, sur l’intervalle vêlage-vêlage,et donc sur la production par lactation et le nombre de veauxpar an, et sur les frais d’insémination • sa corrélation génétique avec la production laitière est négative(rg =-0.37).

9. L’ISU • Les comptages cellulaires (CEL) : • mesure indirecte de la résistance aux mammites (corrélation génétique entre fréquences de mammitescliniques et comptages cellulaires est 0.70) • liaison génétique entre comptages cellulaires et quantité de lait défavorable (rg = 0.20)

10. L’ISU • La longévité fonctionnelle résiduelle : • correspond aux réformes dues aux causes autres • liaison génétique entre longévité fonctionnelle (LGF) (normalementinsensible aux réformes dues à l’insuffisance de production) et laproduction au travers de l’INEL pratiquement neutre

11. L’ISU • Le format ou développement : • avec sa conséquence sur le poids de l’animal, il est lié directement auproduit viande et aux besoins d’entretien • la taille des animaux et leur capacité corporelle semblent quasi indépendantesde la production laitière (rg = 0.10)

12. L’ISU • Estimation de leur valeur économique marginale = somme des conséquencesd’une élévation du niveau génétique d’une unité du caractère considéré pris isolémentpour une femelle du troupeau • Cette somme de conséquences est mesurée sur la carrière decette femelle et ramenée ensuite à la marge nette de l’exploitation. • Le gain génétique en productionparticipe pour environ 50 % àl’amélioration de la marge nettede l’exploitation

13. Indexation Scandinave : inclusion des caractères de reproduction et de santé • Problèmes concernés : taux cellulaires, taux de mammites, pathologies de l’appareil locomoteur, fertilité, vêlage dystocique et mortalité périnatale • Sources d’information pour leur intégration : bases de données existantes depuis les années 60 • Etude sur une population de vaches rouges (Suédoise rouge et blanche – SRB) et de vaches pie-noires holsteinisées (SLB) : 2 x 700 000 vaches et 2 x 450 taureaux d’IA

14. Indexation Scandinave : inclusion des caractères de reproduction et de santé • durant les 3 dernières décennies : • SRB : échange uniquement entre populations scandinaves (+2700 kg de lait) • SLB : holstéinisation internationale (+3000 kg) • gain de production supérieur des SLB • Une observation : faible héritabilité des caractères de fertilité et de pathologies (<5%)

15. Indexation Scandinave : inclusion des caractères de reproduction et de santé • But de cette étude : mettre en relation productivité, méthodes d’évaluations génétiques, sélections pratiquées et réponses observées (en considérant les caractères de fertilité, de vêlage et de mammites)

16. Indexation scandinave : 1. la fertilité femelle • Mesures pour deux caractéristiques différentes : • intervalles vêlage-1ere ou dernière insémination • taux de gestation par rapport au nombre d’inséminations • Variation génétique : • Faible héritabilité (2-3 %) • Grande variation génétique additive (6-9 %) • Corrélation génétique de fertilité entre les catégories d’âge : • Très haute chez les vaches • Régie différemment chez les génisses (gènes partiellement différents)

17. Indexation scandinave : 1. la fertilité femelle • Evaluation génétique : • Conséquence de la faible héritabilité  sélection des taureaux sur base de progeny test (grand nb de filles) • Sélection et réponse : • TMI : Total Merit Index (tous les pays nordiques) incluant la fertilité femelle

18. Indexation scandinave : 1. la fertilité femelle

19. Indexation scandinave : 2. Caractères de Vêlage • Collecte des dates de vêlages, du taureau utilisé, de l’état du veau à la naissance, d’un score de performance au vêlage et des pedigree des parents • Variation génétique : • Héritabilité faible des caractères de vêlage • Variation génétique additive plus importante • Taux de mortalité périnatale • au 1er vêlage : grande disparité entre les races • chez les vaches : différences minimes • Variation génétique indépendante du type de vêlage

20. Indexation scandinave : 2. Caractères de Vêlage • Evaluation génétique : • Compliqués à définir malgré une apparente facilité d’observation (intéraction de 2 générations) • Variation considérable entre les génisses et les vaches • Nombreuses études biaisées par une population unique de primipares (différence flagrande avec les pluripares)

21. Indexation scandinave : 2. Caractères de Vêlage • Sélection et réponse : • Dystocie et mortalité périnatale incluses dans le TMI • Une hypothèse : propagation d’un gène récessif provoquant une malformation vertébrale chez les Holstein (graphe)

22. Indexation scandinave : 2. Caractères de Vêlage

23. Indexation scandinave : 3. Résistance aux mammites • Problème le plus coûteux dans la production laitière • Mêmes bases de données que les précédentes pour les cas cliniques de mammites • Utilisation du compte de cellules somatiques comme outil de gestion

24. Indexation scandinave : 3. Résistance aux mammites • Variation génétique : • Héritabilité basse pour les cas cliniques (CM) 2-5% • Héritabilité variable entre 8 et 15 % pour le SCC • Correlation génétique entre CM et SCC : 50 - 80 % • Rapport défavorable entre la production et la sensibilité à la mammite

25. Indexation scandinave : 3. Résistance aux mammites • Variation génétique : • Absence de sélection des taureaux sur le critère SCC • Progrès réalisé sur lesvaches en première lactation (graphe) • Sélection et réponse : • Grande importance des caractéristiques des mammites dans l’élaboration du TMI

26. Indexation scandinave : 3. Résistance aux mammites

27. Indexation scandinave : 4. Total Merit Index • Début d’application en Norvège et en Suède • Inclus tous les paramètres vus jusqu’à présent • Contribue à un gain économique de 10 à 25 % par rapport au simple caractère de production

28. Indexation scandinave : Conclusion • Adoption unanime des autres pays de l’attitude scandinave car : • Développement de bases de données similaires • Intérêt croissant du public pour le bien-être animal • Nécessité d’une harmonisation sur la définition et les modèles d’évaluation génétique des caractères

29. Bibliographie • Philipsson J., Lindhé B. Experiences of including reproduction and health traits in Scandinavian dairy cattle breeding programmes, Livestock production science 83 (2003) 99-112 • http://www.inst-elevage.asso.fr/html1/rubrique.php3?id_rubrique=507 • http://res2.agr.gc.ca/lennoxville/activ/informatise-computerized_f.htm • http://dga.jouy.inra.fr/sgqa/equipes/bl.htm • http://www.agrireseau.qc.ca/bovinslaitiers/ • http://www.web-agri.fr/infos/dossiers/31_01_02_taureaux

30. Travail réalisé par : • Camus Stéphan • Ceysens Nicolas • Charbonneau Alexandre MERCI DE VOTRE ATTENTION