ORGANEL SEL

1. ORGANEL SEL Agustina Setiawati, M.Sc., Apt

2. NuKleus • Ditemukan oleh ROBERT BROWN • Fungsi • Mengandung informasi genetik • Sebagian besar gen ada di nukleus • Beberapa ditemukan di mitokondria dan kloroplas • Ukuran • Diameter ~ 5 microns (µm)

3. STRUKTUR NUKLEUS

4. Nukleusterdiridari • Selaputinti • Struktur internal : • Kromatin : kompleks DNA & protein • Matriksinti : network protein fibillar • Lamina inti : network protein fibillardibawahselaput • Nukleolus : strukturamorfus & kompakdmngabunganribosommenempatinukloeplasma.

5. SELAPUT INTI (NUCLEAR ENVELOPE) • Memisahkansitoplasmadenganbagian internal inti • Double membran • Membranluarberhubungan dg sitoplasma, membrandlmmemisahkan dg bag luar & menghadap interior dlminti • Adaperforasi dg adanyapori 70-90 nm • Pori intimenyerupaicincinygberisi protein (annulus) ygmengaturpergerakanmolekulbesarspt DNA & protein

6. FUNGSI SELAPUT INTI • Memisahkanmaterigenetikdarisitoplasma • Memisahkan RNA immature darielementranslasi (mRNA harusdiprosesdulusblmditranslasi) • Mengaturmasukkeluarnyamolekulbsr & kompleks

7. PORI INTI • Pori intiberhubungan dg tingkataktivitasinti • 20 pori per μm persegiselaputinti, 3000-4000 per nukleusmamalia • Berperandlm transport inti-sitoplasma

9. Struktur pori inti

10. Struktur pori inti

11. KROMATIN DNA dalam nukleus dikemas dalam KROMATIN Berdasarkanlokasinyakromatindibedakanmjd 3 daerah : • Kromatinperinukleolar, beradadisekelilingnukleolus • Kromatininternukleolar, beradadlmnukleolus • Kromatinperiferal, berikatan dg selaputinti sel. Kromatin internukleolar & periferalmerupakanheterokromatin

12. KROMATIN • Ditinjaudrperanannyasbgmaterigenetik, heterokromatindibagimjd 2 : heterokromatinfakultatif & heterokromatinkonstitutif. • Heterokromatinkonstitutifselamanyatdkaktif & tetapdlmkeadaanmampatselamadaurhdpsel • Heterokromatinfakultatiftdkselamanyaberadadlmkeadaanmampat. Pd saattertentu dapat ditranskripsikan kemudian ditranslasikan • Dr analisiskimiaternyatakromatintdrdr DNA, RNA & protein.

14. KROMATIN yang mengandung DNA mengalami pemadatan menjadi KROMOSOM Sebelum sel membelah, KROMOSOM berubah menjadi KROMATID KROMOSOM

17. KROMOSOM • Jmlhkromosomberbeda2 sesuaiorganisme • Berdasarkan letak sentromer, kromosom dibedakan menjadi 3:

18. MATRIKS INTI • Merupakan jaringan fibril protein dlm sel, fgs tdk pasti tp diduga terlibat dlm maintenance btk inti • Berperan dlm pengaturan & pemisahan kromatin • Berperan sbg mesin perlekatan pd proses transkripsi & replikasi & membantu keluarnya mRNA dr inti

19. LAMINA INTI • Tdrdrjaringanygteraturdrfilamen (protein) berdiameter 10 nm ygmelekat pd bag dlmmembran. • Bfgssbgtempatperlekatankromatin, memperkuatselaputinti

20. Nukleolus • Daerah yg lebih padat dari sekelilingnya= • Fungsi: • Produksi sub unit ribosom • Sub unit ribosom dikeluarkan lewat pori nukleus

21. RIBOSOM • Organel tempat sintesis protein • Struktur: • Mengandung rRNA dan protein • Mempunyai 2 sub unit (besar & kecil) yg bergabung untuk melakukan sintesis protein

22. Tipe Ribosom • Ribosom Bebas • Tersebar di sitoplasma • Mensintesis protein yang berfungsi di sitosol • Ribosom Terikat • Terikat pada membran RE • sintesis protein membran atau protein yg dieksprot ke luar sel

23. Ribosom • Prokaryotes & eukaryotes mempunyai perbedaan • Perbedaan ukuran sub unit • Perbedaan protein

24. Ribosom Pro & Eukariot • Sub unit satuannya S:svedverg • Svedberg: koefisien pengendapan pada larutan kental • Eukariot: 60S dan 40 S • Prokariot 50S dan 30S

25. Ribosom Pro & Eukariot 30S + 50S = 70S dan 60S + 40S = 80S??

26. ORGANEL ENDOMEMBRAN Organel endomembran -rangkaian organel yang berbentuk membran - membagi sel menjadi beberapa kompartemen 1. Retikulum Endoplasma 2. Badan Golgi 3. Lisosom

27. RETIKULUM ENDOPLASMA • Ditemukan oleh Albert Claude, Belgia (1945) • Dibedakan menjadi 3: 1. RE kasar 2.RE halus 3. RE sarkoplasmik

28. RE KASAR • Struktur berupa membran berlapis, disebut cisterna • Terdapat ribosom yang melekat pada membrannya • Fungsi: tempat sintesis protein, karbohidrat dan fosfolipid

29. RE KASAR ... • Jenis PROTEIN yg disintesis oleh RE kasar: • `Protein yang diekskresikan keluar sel • Protein integral membran

30. RE HALUS • Hanya sedikit ribosom yg melekat • Fungsi: • Sintesis lipid dan steroid • Metabolisme karbohidrat dan steroid (tidak lipid) 3. Detoksifikasi zat asing 4. Mengatur kadar Ca dalam sel

31. RE SARKOPLASMIK • Bagian dari RE halus • Menyimpan kalsium dalam sel • Ditemukan di sel otot polos dan lurik, mengapa???

32. Badan Golgi • Ditemukan oleh CAMILLO GOLGI (1897) • Terletak disisi luar RE kasar • Nama lain: diktiosom • Membran berlapis CIS ? TRANS?

33. median

34. Fungsi Badan Golgi • Tempat memodifikasi protein dan lipid • Tempat sortasi dan mengemas makromolekul • Modifikasi: proses pematangan makromolekul yang disintesis oleh RE seperti protein dan lipid • Enzim dalam sisterna menambahkan gugus karbohidrat (glikosilasi) dan fosfat (fosforilasi) pada protein

35. Proses Modifikasi Protein • Protein hasil sintesis RE diekskresikan melalui vesikel • Vesikel menyatu dgn bagian cis bdn golgi • Protein dalam vesikel lepas, dimodifikasi, sortir dalam lumen • Protein matang dikemas dlm vesikel dalam selubung protein KLATRIN

36. LISOSOM • Lisosom : badan pencerna • Organel yang dibatasi membran dalam vesikel • Fungsi: mencerna makromolekul (protein, polisakarida, lipid dan asam nukleat) • Mengandung ± 40 enzim hidrolitik

37. LISOSOM... • 40 enzim kelas hidrolase yang ada di lisosom protease , nuklease , glikosidase lipase, fosfolipase, fosfatase, sulfatase • Enzim hidrolitik tsb aktif pada pH asam (pH 5) padahal pH sitoplasma 7.2-7.4 • Enzim tsb telah mengalami maturasi di badan golgi • Bagaimana cara supaya pH-nya tetap 5?

38. LISOSOM... • Pompa H+/pompa proton memasukkan ion H+ ke dalam lisosom dari sitoplasma • Membutuhkan energi dalam bentuk ATP • Contoh lisosom?

39. Proses digesti oleh Lisosom • Lisosom primer? • Lisosom sekunder? • Autofagi? • Heterofagi?

41. DISKUSI • Beda kromatin, kromosom & kromatid? • Beda protein hasil sintesis ribosom bebas dan terikat? • Beda fungsi RE kasar, RE halus dan RE sarkoplasmik? • Beda lisosom primer & sekunder, autofagi & heterofagi? • Bagaimana alur proses sintesis protein dari awal hingga menjadi protein fungsional? • Bagaimana alur proses pencernaan (digesti) dalam sel?

42. Badan Mikro • Vesikel yang diselimuti membran • Tidak termasuk sistem endomembran • Ada 2 macam : -glioksisom (tanaman) mengandung enzim yg mengubah lemak menjadi karbohidrat -peroksisommengandung enzim oksidatif dan katalase

43. Peroksisom • Terdapat pada semua sel eukariot • Mengandung enzim oksidatif: KATALASE dan URAT OKSIDASE • Enzim katalase: degradasi H2O2 • Selain degradasi hidrogen peroksida, digunakan utk degradasi fenol, asam format, formaldehid & alkohol • Reaksi detoksifikasi ini penting untuk sel HATI dan GINJAL

44. MITOKONDRIA • Ditemukan oleh Benda (Yunani) mito : benang, chondrion : granula • Tempat pembentukan energi metabolik (ATP) pada eukariotik • Mempunyai DNA sendiri sehingga mampu mensintesis protein sendiri (mt-DNA) • Protein mitokondria berasal dari: diri sendiri dan ribosom

45. Struktur Mitokondria • Membran luar (Outer membran) • Membran dalam (Inner membran) • Krista (Interspace membran) • Matriks

46. Membran luar • Berisi enzim utk rantai respirasi, sintesis ATP • Enzim penanda: monoamin oksidase

47. Membran Dalam • Lebih kompleks dibandingkan membran luar • Mengandung enzim fosforilasi oksidatif dan transport elektron • Enzim penanda: suksinat dehidrogenase

48. Matriks • Mengandung enzim utk siklus Kreb • Terdapat DNA (sirkuler maupun doble helix) dan ribosom Krista • Hasil pelipatan membran dalam

49. Jumlah mitokondria • Setiap sel mempunyai jumlah mitokondria yg beragam (tidak punya, bahkan ratusan ribu) • Mengapa demikian?

50. DANK U