Praktická taxonómia

1. Rad (-aceae) ,- Rod (-us) , Druh binominálna nomenklatúra - rodové druhové Praktická taxonómia Rôzne Mycoplasma, Ureaplasma, Chlamydia Ricketsiaceae Spirochetales - Spirochetes, Leptospira, Borrelia Mycobacterium Nocardia , Actinomycetes,

2. Mycobacterium – rod (genus) nepohyblivé, nesporulujúce, aeróbne paličky Bunková stena bohatá na lipidy = hydrofóbny povrch = rezistentné na dezinfekciu = nepríjimajú farbivo. Ak sa zafarbia odolávajú odfarbeniu aj silným kyselinám = acidorezistentné Pomalý rast Skupina pomaly rastúcich a III. rozdelia sa každých 12-24 hodín viditeľné kolónie 3-8 týždňov. Skupina I., II. a IV. - 3 dni a viac M. leprae – nekultivovateľné 41druhov (species) z toho 27 izolovaných u ľudí z toho 95% spôsobených M.tbc, M. avium-intracelulare, M.kansasii, M. foruitum, M. chelonae a M. leprae.

3. Bunková stena – komplexná Peptidoglykan (rigidita celej štruktúry) s fosfodiestericky viazanými molekulami D- arabinozy a D-galaktozy na mykolovú kyselinu (najvýznamnejší lipid v bunkovej stene). s voľnými lipidmi(vosky, mykozidy – cord factor) – zodpovedný za paralelné radenie sa bacilov u virulentných kmeňov polypeptidmi (PPD) na povrchu. – antigénne vlastnosti, stimulácia bunkovej imunity, extrahovaný a čiastočne purifikovaný sa používa na kožné testy Polypeptid PPD Mykolová kyselina Arabinoza, galktoza s peptidoglykanom Cytoplazma s cytoplazmatickou membránou

4. Patogenéza a imunita Mycobacterium tuberculosis Deštrukcia tkaniva a fibróza – odpoveď hostiteľa na infekciu M.tbc Intracelulárny parazit – unikajú vrodeným imunitným mechanizmom Tuberkulóza – klasické mykobakteriálne ochorenie po inhalácii M.tbc * pohltenie alveolárnymi makrofágmi * rozmnožovanie intracelulárne unikajú imunitným mechanizmom a deštruujú fagocyty, ktoré ich pohltili. * opakovanie tohto procesu(fagocytóza bacilov, replikácia M.tbc, lýza bb. = mnoholaločnaté obrovské bunky nahromadených makrofágov „Langhansove bb“ * infikované makrofágy sa šíria do lokálnych uzlín, krvného riečišťa, kostnej drene,sleziny, ľadvín, kostí CNS...)

5. Klinické syndrómy M.tbc môže postihnúť akýkoľvek orgán * pľúcna * extrapulmonálna tbc * Tbc u HIV infikovaných M.avium-intracellulare * pľúcne ochorenie (u imunokompromitovaných) * asymptomatická kolonizácia * diseminované ochorenie u HIV pozitívnych M. leprae * Lepra lepromatózna, * Lepra tuberkuloidná Ostatné mykobaktoriózy * Pľúcne ochorenie (M.kansasií) * Kožné ochorenie (M. marinum,M.ulcerans)

6. Klinická diagnostika a liečba: Kožný test i.d 0,1 mcg = 5TU aplikácia PPD purifikovaného proteinového derivátu bunkovej steny, po 48 hodinách <15mm negat – bez reakcie, anergia (aj HIV infikovaní), 15mm v poriadku >15mm kontakt s M.tbc v okolí, ochorenie Rezistencia na bežné ATB, dlhodobá terapia (18 –24 mesiacov 6-9 mesiacov), rýchlo nastupujúca rezistencia = používanie kombinácie antimykobakteriálnych chránených prípravkov INH, rifampicin, pyrazinamid, ethanbutol,streptomycin + cycloserin (atypické), chinolóny (sprievodná infekcie) 1990 mnohočentná rezistencia v USA u HIV (u nás 1 kmeň na Rýchlorastúce mykobaktérie – veľmi rezistentné na bežné, citlivé na aminoglykosidy, cefalosporíny, TTC, chinolóny M.leprae rýchly nástup rezistencie – kombinácie dapson+rifampicin, clofazimin+etionamid

7. Aktinomycéty a Nokardie aeróbne gram pozitívne kataláza pozitívne paličky v pôde tvoriace niekedy až vláknité štruktúry – ako huby, Sírové granuly Nokardie podobné ako mykobaktérie – obsahujú kys. mykolovú a sú acidorezistentné Pľúcné - bronchopneumónia Kožné lézie- lokalizované (abscesy a nekrózy) celulitída, akútne a chronické hnisavé (tvorba sínusov)- Mycetom – chron.granulomatózny zápal, drénujúce sínusy Diseminované - CNS – tvorba mozgových abscesov Imunokompromitovaní Diagnostika a terapia: pomaly rastúce, mikroskopia, chirurgická intervencia+sulfonamidy,amikacin, betalaktámove atb Rhodococcus – u AIDS., dlhodobá terapia kombinovaná + RIF+ERY

8. RAD : SPIROCHETALES ROD : TREPONEMA, BORRELIA, LEPTOSPIRA, DRUH:Treponema pallidum – spp.pallidum - syfilis, - ssp.pertenue, ssp.endemicum Treponema carateum – pinta Borrelia recurrentis – epidem. návratná horúčka Borrelia (rôzne) species. – endem.návratná horúčka Borrelia burgdorferi – borelióza Leptospira interrogans, L. icterohemorhagicus ...... – leptospiróza Spoločné vlastnosti – tenké helikálne gram negatívne - prakticky nekultivovateľné

9. Treponema pallidum ssp. pallidum – syfilis - ( 1530 Fracastor : „syphilis sive Morbus Gallicus“)lues - morová rana 1493 prinesená do Európy Kolumbusovými námorníkmi zo Z. Indie 1497 liečba ortuťou 1906 Wassermannov diagnostický serologický test Ehrlich – arzenoterapia 1927 – Wagner –Jauregg Nobelova cena za prácu o liečbe neurosyfilis maláriou navodenou hyperpyrrexiou 1947 PNC terapia Najväčší zabíjač v celosvetovom meradle – zdravotnícka osveta – 50 miliónov treponematóz na svete napriek účinnej terapii

10. Patogenéza a imunita OMP – proteíny vonkajšej membrány – adherencia na povrch hyaluronidáza – len virulentné – perivaskulárna infiltrácia Hostiteľská bunky pokryje T.p. fibronektínom – ochrana pred fagocytózou Imunitná odpoveď pacienta na infekciu = tkanivové poškodenie Klinický priebeh – 3 fázy (lokalizované množenie a tk.deštrukcia) 1) kožná lézia v mieste penetrácie spirochéty – tvrdý vred – primárne miesto prvotnej replikácie - mnohopočetné T.sp vo vrede endarteritis a periarteritis, infiltrácia vredu PMNL a makrofágami, fagocytóza – spirochéty prežívajú 2) diseminovaná choroba – kožné lézie na celom povrchu mnohopočetné T.sp v krvnom riečišti 3) pozdná manifestácia v akomkoľvek orgáne a tkanive Spontánna remisia možná

11. Klinické syndrómy Primárny syfilis–ulcus v mieste penetrácie (papula – erózia a tvorba bezbolestného vredu, lymfadenopatia 1-2 týždne po objavení sa vredu, možnosť diseminácie lymfatickou cestou do krvi. Zhojenie do 2 mesiacov spontánne. Falošné vyliečenie Sekundárny syfilis– chrípkovité ochorenie, generalizovaná lymfadenopatia, generalizovaný mukokulánny rash rôzne morfy – makuly, papuly, pustuly), veľmi infekčný, pomaly sa sám vstrebáva – prechod do latentného obdobia. Neskorý syfilis – difúzny chronický zápal, devastujúce poškodenie ktoréhokoľvek orgánu a tkaniva (arteritída, demencia, slepota ... neurosyfilis, kardiovaskulárny syfilis) – granulomatózne léžie - gumata Kongenitálny syfilis – potrat, multiorgánové postihnutie, latentné ochorenie, väčšinou sa prejaví až neskôr – rinitída, deskvamujúci rash, deštrukcia kostí, kardiovaskulárny syfilis

12. Ostatné treponematózy T.pallidum ssp.endemicum –bejel, endemický syfilis, interhumánny prenos, neveneické ochorenie, príborom, 3 štádiá: iniciálne orálne lézie, sekunárne orálne a slizničné defekty, neskoré gumata T.pertenue – framboizia (yaws) – granulomatózne ochorenie priamy kontakt s postihnutou kožou skoré štádiu – koža neskoré štádium – deštrukcia kože, lymfatických uzlín, kostí T. carateum – pinta – primárne postihnutie kože. Prenos kontaktom Malé svrbiace papuly rozširujúce sa a perzistujúce roky, kým sa zhoja. Rekurentné, diseminujúce hypopigmentované lézie končiace znetvorujúcimi jazvami. Terapia: PNC, TTC, CMP Dg: klinicky, Mi z lézií, VDRL

13. BorreliaB.recurrentis- Návratná horúčka – epidemická - blcha ľudská - endemická - kliešte B.burgdorferi – Lymská choroba – borrelióza – 1977 typický tvar spirochét slabo sa farbiace (anilínové farbivo), bičíky, pohyblivé, neúspešná kultivácia nutrične náročné, doba delenia 18 hodín – pomaly rastúce, diagnostika: *Mi v krvnom nátere (návratná horúčka), ...........biopsie kože (borrelióza) *serologicky (borrelióza)

14. Borrelia burgdorferi–Lymská choroba – borrelióza 1977 nahromadenie artritíd detí, kliešťom prenášaná - Ixodes ricinus... (jar-jeseň, najviac v štádiu nýmf.... rôzne borélie - B. garini... rôzne klinické prejavy prítomné v koži, izolované aj v neskorých štádiách (? príznaky – následky živých borélii alebo imunopatologických mechanizmov?) Klinické prejavy: INK 3-30 dní, 1) erytema chronicum migrans +nešpecifické príznaky-4 týždne 2) neskorá manifestácia (80% neliečených) *neurologické a kardiálne symptómy *artralgie a artritídy Diagnostika : Mi – vzácne serologicky a klinicky (ECM stačí) Terapia:PNC – dlhodobo, DOXY, AMOX, aj v kombináciách

15. Leptospíry L.interrogans ? – 19 séroskupín a 172 sérotypov (ssp.icterohemorhagica) L.biflexa – 38 séroskupín a 65 sérotypov Patogénne pre divoké a domáce zvieratá zdrojom infekcie (psy, mačky, hlodavce) – asymptomatické ochorenie renálnych tubulov – šírenie močom, kanálmi – prežívajú až 6 týždňov 22 sérotypov zodpovedných za ľudské ochorenia (ochorenia nie sú sérotypovošpecifické) Klinické prejavy: subklinické ochorenia, chrípkovité horúčkovíté ochorenia, ťažké systémové (Weilova ch.) – ikterus, hemorhagie, GNF Patogenéza: Prienik intaktnými sliznicami a malými poraneniami kože do krvi (poškodenie epitelu malých ciev) a všetkých orgánov (meningitída, hepatálna a renálna dysfunkcia, hemorhagie)

16. Mykoplazmy 69 sérotypov a ureaplazmy 3 sérotypy Spoločné vlastnosti, rozšírené v prírode, 3 ľudské patogény, rôzne klinické obrazy, etiologická úloha nie je jednoznačná Mycoplasma pneumoniae, M. hominis, Ureaplsma urealyticum Najmenšie voľne žijúce baktérie bez bb steny – PNC rezistentné považované pôvodne za vírusy, G negat., Kultivácia – pôdy so sterolmi, generačný čas 1-6 hodín, kolónie „volské oko“ Skrížená reaktivita ( hlavné Ag sú proteiny a glykolipidy) extracelulárny patogén , respiračné ochorenia v lete a na jeseň (epidémie po 4-8 rokoch, najčastejšie deti školského veku) Prenos inhalačnou cestou a sexuálne

17. Klinický obraz: M.pneumoniae – infekcie DC, atypická pneumónia M.hominis- pyelonefritis, zápaly pánve, popôrodné horúčky, Ureaplazma – uretritídy Diagnostika: mikroskopia – slabo sa farbiaca – neprítomná bunková stena , kultivácia: M. pneumoniae – špecifické médiá, volské oko, pôda s glc – zmena farebného indikátora pri zmene pH spôsobenej metabolizmom glc indikuje rast Ureaplazma – dôkaz metabolizmu urey ezistencie na ATB – rýchlotest serológia : dôkaz protilátok M. pneumoniae Terapia ERY, TTC – M. pneumoniae M. hominis – rezistentný na ERY

18. Chlamýdie • Pôvodne považované za vírusy – sú i.c. paraziti, majú zvlášny rastový cyklus, nemajú peptidoglykan – ale majú DNA aj RNA, vonkajšiu aj vnútornú membránu podobnú G- (LPS), citlivé na niektoré ATB C. trachomatis, C. psittaci, C.pneumoniae Existujú v 2 morfologických formách: - Elementárne teliesko EB – malé, infekčné, nedelí sa - Retikulárne teliesko RB – väčšie, neinfekčné, delí sa, i.c., metabolicky aktívne – energetický parazitizmus – dokáže syntetizovať proteiny , ale nevie získavať energiu

19. Klinika, diagnostika, terapia • Trachom – chronická keratokonjunktivitída – celá spojovky, jazvenie, chronické dráždenie rohovky viečkom, panus, slepota – prenos rukami, uterákmi, hmyzom., nosičstvo v DC a GIT u detí – prenos. • Inkluzná konjunktivitída dospelých - folikulárna – - mukopurulentné hnisanie, keratitída, infiltrácia rohovky – súvisí so skorším genitálnym ochorením, autoinokulácia • Neonatálna konjunktivitída a pneumónia – inokulácia pri pôrode – hyperémia a bohaté hnisanie, intersticiálna pneumónia, rhinitída, afebrilná, staccato kašeľ • Urogenitálne infekcie – sexuálne prenosné negonokokové uretritídy – mukopurulentný výtok, hypertrofické ektopium, u mužov asymptomaticky • Reiterov sy – uretritis, konjunktivitis, polyartritis, mukokutánné lézie – mladí muži – pôvod v Cl.uretritíde • Therapia: i.c. – ERY, TTC, AZI

20. LVG - Chronické sexuálne prenosné ochorenie, častejšie u mužov, primárna lézia – malá nebolestivá prehliadnuteľná. Vyhojenie – bolesť hlavy, teplota, myalgia. Sekudárne štádium – zápal LU – bolestivé, fluktuujúce bubo, zväčšujúce sa, drénujúce fistulami Systémová manifestácia – teplota, zimnica, anorexia, meningizmus, artralgie. Chronické LVG – genitálne ulcerácie, fistuly, strikktúry, elefantiáza genitálna • Laboratórna diagnostika – cytológia – Giemsovým farbením – kultivácia – na tkanivových kultúrach – dôkaz antigénu (OMP alebo LPS) – ! v bunkách! – odber epitelu – dôkaz NK -PCR – dôkaz živých aj neživých – nevhodné na sledovanie terapeutických úspechov – sérologia – v endemickej oblasti – premorenosť. IgM u novorodenenckej pneumónie

21. C. psittací, C.pneumoniae • Respiračné ochorenie – prenosné z papagájov – IDC a šírenie cez RES a hematogénny rozsev. Postihnutie pľúc. Predominantne lymfocytárna odpoveď. – edém, zhrubnutie alveolárnej steny, cynóza, anoxia – príznaky pľúcneoho ochorenia, CNS, GIT, systémové (rash, carditis, hepatomegalia, keratokonjunktivitída • Konjunktivitída detí na Taiwane, faryngeálne nosičstvo – TWAR kmene – spôsobuje IDC – bronchitída, pneumónia, sínusitída...., atypická pneumónia, • Dg – sérologicky • TH – ERY, TTC

22. Rickettsiae • Aerobne, i.c. parazity, G-, rastú len v eukaryotických bb – pôvodne považované za vírusy, prežívajú fagocytózu, uvoľnia sa do cytoplazmy, kde sa binárne delia • 4 rody – Rickettsia, Coxiella ( prežíva v prostredí roky) Rochalimea – e.c., Ehrlichia ( vytvára elementárne, iniciálne teliesko a morulu - všetky sú i.c.) • Prenosné hmyzom – (okrem Coxielly)

23. Rickettsiae • Rickettsia rickettsii – horúčka skalistých hôr – kliešť – transovariálny prenos, rezervoár – hlodavce – škvrnitá horúčka. Dg – Giemsovo farbenie, tkanivové kultúry, Weil Felixov test – skrížená reaktivita s antigénmi Proteus sp. – dnes sa nepoužíva – sérologicky. Th: TTC, CMP • Rickettsia prowazekií – škvrnitý týfus – voš – rezervoár je človek ( zlé živ. podmienky) . Voš zomiera na infekciu – nie je transovariálny prenos – epidemický týfus – makulárny exantém. Reaktivácia po rokoch Brill Zinserova choroba. • Rickettsia typií – endemický týfus – blcha – Xenophylla cheopsis, rezervoár -hlodavci . Postupný nástup príznakov. Makulopalózny rash. Nekopmlikované. • Ricketsia Tsutsugamushi – východná Ázia Pacifik

24. Coxiella, Ehrlichia, Rochalimaea • C. burnetti – Q horúčka – inhalácia infekčných častíc z kontaminovaného prostrendia, nie vektor. Proliferuje v DC – diseminácia – pneumónia, granulomatózna hepatitída. Nákaza rozšírená u divých zvierat a hmyzu –vylučovanie močom, mliekom, stolicou – nepasterizované mlieko. Akútne ochoreni – náhly nástup, chrípkovitú ochorenie, respiračné príznaky, hepatosplenomegalia. Chronické ochorenie – difúzna granulomatóza – chronická endokarditída. Dg – variácia antigénnych fáz – fáza I a II • Ehrlichia – Paul Ehrlich – leukocytárne rickettsie, ktoré parazitujú na lymfocytoch, neutrofiloch a monocytoch. Nie ery. Ochorenie ehrlichioza – prenosná kliešťovým vektorom – chrípkovité príznaky, leukopenia, trombocytopenia. Rash len u 20%. Dobrá prognóza • R. quintana, R. henselae

25. Bakteriológia - taxonómia, G+koky, G-paličky • Názov, začlenenie • Morfológia a rastové vlastnosti • Antigénna štruktúra • Nástroje patogenity a virulencie • Typy ochorení • Laboratórna diagnostika • Terapia, prevencia

26. Klasifikácia, názvoslovie, taxonómia,identifikácia • Klasifikácia - usporiadanie do skupín na základe rozlišovacieho znaku ( ten istý mikroorganizmus môže byť klasifikovaný rôzne podľa rôznych znakov: klasifikácia podľa sérotypov, klasifikácia podľa ATB citlivosti, podľa hemolýzy, antigénnych znakov…) • Názvoslovie - pomenovanie, základ odbornej komunikácie – binomické názvoslovie • Taxonómia – veda o klasifikácii, identifikácii, názvosloví a vytváraní systému • Identifikácia – praktické použitie klasifikačných kritérií na odlíšenie mikroorganizmov jedného od druhého

27. G+koky • Micrococcaceae - Staphylococcus vyskytujú sa v nepravidelných zhlukoch, akultatívne anaeróbne, nepohyblivé, kataláza +, diferenciačný znak - produkcia plazmakoagulázy, rast na pôdach s obsahom NaCl S. aureus, S. epidermidis, S. saprophyticus • Streptococcaceae - Streptococcus vyskytujú sa v pároch alebo retiazkach, fakultatívne anaeróbne, nutrične náročné, kataláza -, diferenciačný znak zmeny krvi - hemolýza alfa, beta, gama, CAMP test, inhibícia rastu optochínom, bacitracínom S. pyogenes, S. agalactiae, S. pneumoniae

28. G+koky anaeróbne • Peptostreptococcus, -Peptococcus,- Sarcina, - Coprococcus, - Ruminococcus -kolonizujú kožu a mukózne povrchy GIT, UGT, oportunistické patogény často v súvislosti s cudzím telesom kultivačne náročné, pomaly rastúce - pleuropneumonia po aspirácii, sinusitída, mozgový absces šírením z orofaryngu alebo pľúc, intraabdominálna infekcia a sepsa šírením z čreva, infekcia pánve (endometritída, pánvový absces, puerperálna sepsa, bakteriálna vaginóza) infekcia mäkkých tkanív(celulitída), endokarditída, osteomyelitída • Laboratórna diagnostika - odlíšenie od kolonizujúcej flóry, odber a transport za anaeróbnych podmienok, predĺžená kulticácia na obohatených pôdach • Th - PNC, cefalosporíny, imipenem, CMP - často polymikróbna etiol.

29. G+paličky • Sporulujúce - Bacillaceae - Bacillus cereus, B. antracis -bičíky, fakultatívne aneróbne alebo striktne aeróbne. Produkcia toxínov. • Nesporulujúce - Listeria monocytogenes - pohyblivá, aeróbna, prežívajúca pri t 22*C a v širokom pH rozmedzí, infikuje zvieratá -Corynebacteriaceae -aeróbne nepohyblivé mierne zahnuté ukladajúce sa do pozície písmen, nepravidelne sa farbiace - Obsahujú metachromatické granuly, produkuje toxin - lyzogénna konverzia - toxigenicita kmeňa - Elekov test.Corynebacterium diphtheriae, C. pseudodiphtericum,Erysipelotrix rusiopathiae - fakult. anaeróbna, prenosná zo zvierat, šedavé kolónie, alfa hemolýza,NocardiaceaeNocardia asteroides - obsahujú lipidy v b.stene - farbenie modifikovaným Ziehl Neelsenom, nepohyblivé, vláknité útvary, dlhá kultivácia

30. G+paličky anaeróbne • Nesporulujúce - Actinomycetaceae Actionomyces israeli, A.naeslundii ---cerebrrálna, cerevicofaciálna, abdominálna, hrudná aktinomykóza, chronické hnisavé ochorenia s tvorbou abscesov. Lab.dg. Odber z hĺbky sínusu, sírové granuly, kolónie tvaru zubného moláru, náročné, dlhá kultivácia. Th: chirurgická +ATB dlhodobá PNC -Propionibacteriaceae Propionibacterium acnes --- kolonizuje kožu, vonkajšie ucho, spojovkový vak, orofarynx, ženský genitálny trakt. Spôobuje akné a oportunistické infekcie u pacientov s cudzími telesami. Lab. dg. Na bežných médiách, predĺžená kultivácia -Mobiluncus ---gram variabilné, stavba G+, ohnuté,kultivačne náročné, kolonizujú genit. Trakt žien - vaginóza - porucha eubiózy. -Bifidobacteriaceae, Eubacteriaceae,- Lactobacillaceae. -súčasť FMF

31. Anaeróbne gram + sporulujúce paličky • Sporulujúce -striktne anaeróbne, spóry typicky umiestnené a rozširujúce paličky, proteolytické vlastnosti, produkcia toxinov, intoxikácia, anaeróbna traumatoóza Clostridium botulinum, C. tetani, C. septicum,C. novyi • Clostridia - 100 species, niektoré aerotolerantné - C. histolyticum, niektoré vyzerajú jako gram negatívne, u niektroých nie je možné detekovať spóry. Bežne prítomné v pôde, vode, GIT ľudí a zvierat. • C. perfringens - Bakterémia, myonekróza - plynová gangréna, infekcia mäkkých tkanív, nekrotizujúca enteritída • C. tetaní - tetanus • C. botulinum - botulizmus - novorodenecký, ranový, potravinový • C. difficile - pseudomembranózna kolitída súvisiaca s ATB, 2 toxíny, je súčasťou FMF, expozícia ATB zabije ostatnú črevnú bakt. Flóru - prerastenie C. difficile a jeho spór • C. septicum - netraumatická myonekróza, pacienti imunodeprimovaný - Ca čreva - prerušenie integrity steny čreva a šírenie clostridií do tkanív

32. G-koky • Neisseriaceae - aeróbne koky, diplokoky - kávové zrná, kataláza +, oxidáza + Neisseria - N. meningitidis, N. gonorrhoeae, • Moraxella - M.catarrhalis -bežný komensál HCD, šedavé kolónie posúvateľné po agare, dôkaz butyresterázy, rezistencia na AMP • G-koky anaeróbne • Veillonella, Megasphera - prítomné v orofaryngu, nízka virulencia, pri kultivácii a ochorení obvykle prítomné v zmesi

33. G-paličky • 1) Fakultatívne anaeróbne fermentujúce paličky:Enterobacteriaceae - E. coli, Salmonella, Schigella, Enterobacter, Citrobacter, Serratia, Klebsiella, Proteus, Morganella, Providencia Vibrionaceae - Vibrio, Aeromonas, Plesiomonas Campylobacter, Helicobacter • 2) Obligátne aeróbne nefermentujúcePseudomonadaceae - Ps. aeruginosa, Stenotrofomonas maltofilia, Acinetobacter, Burgholderia cepacia • 3) Haemophilus a príbuzné rody (Actinobacillus, Psteurella) • 4) Ostatné G- paličky - (Bordetella, Brucella, Legionella, Franciscella, Afipia, Bartonella, Calymmatobacterium, Cardiobacterium Eikenella, Flavobacterium, Streptobacillus, Spirillum)

34. G-paličky anaeróbne • Bacteroides fragilis - obligátne anaerobné paličky, nesporulujúce, najvýznamnejšia časť FMF v orofaryngu, UGT, GIT. - pleuropneumónie, intraabdominálny absces, genitálne infekcie. Endogénne a polymikróbne infekcie, tvorba abscesov pri prerušení bariér.. Lab.dg. striktne anaeróbny odber, transport a kultivácia, stimulácia rastu v 20% žlči. Th chirurgická + ATB, - produkcia betalaktamáz, Metronidazol • B. stearothermophilus- spóry používané na testovanie účinnosti sterilizátorov • Prevotella, Porphyromonas, Fusobacterium, Leptotricha, Wolinella - kolonizujú orofarynx, GIT, UGT, tvoria súčasť FMF, uplatnia sa pri prerušení prirodzených bariér - napr. chirurgickým zákrokom, produkujú histolytické enzýmy, vyvolávajú abscesy a polymikrobiálne infekcie (CNS, UGT,intraabdominálne) produkujú betalaktamázu - rezistentné na PNC. Lab. dg. anaeróbny odber a transport, predĺžená kultivácia

35. Stafylokoky – základná charakteristika • Patogénne pre človeka • Rozdelené na 2 skupiny: na základe plazmakoagulázy – umelé delenie – nezodpovedá patogenite ani viruencii PK negatívne – bežné komenzále kože ľudí a zvierat, niektoré môžu spôsobovať ochorenia za určitých podmienok (S.epidermidis, warneri, haemolyticus, saprophyticus, hyicus) PK pozitívne - Staphylococcus aureus (bežne prítomný v axile, nosných krídlach) St. intermedius (zriedkavo patogénny)

36. Staphylococcus aureus • Kolonizuje axilu a nos • Štruktúra: púzdro, peptidoglykan, protein A, kyselina teichoová, viazaná koaguláza - clumping factor, cytoplazmatická membrána (osmotická bariéra)Toxiny: alfa, beta, delta, gama, leukocidin, exfoliativny toxín, toxín toxického šokového syndrómu TSST, enterotoxín Enzymy: koaguláza, katalázae, hyaluronidáza, stafylokináza, lipáza, fibrinolyzín, nukleáza, penicilináza • Multifaktoriálna patogenita • adherencia - povrchové proteíny (väzba na fibronectin), fibrinogén/fibrín viažúci protein (väzba na tromby a poškodené cievy, dôležité súčasti hlenovej vrstvy na biomateriále katetrov • obídenie obranných mechanizmov hostiteľa- púzdro, protein A • poškodenie tkaniva - toxínmi a enzýmami

37. Ochorenia vyvolané St. aureus • abscesy, akné, karbunkul, impetigo, • endokarditída, pnuemónia,bakterémia, osteomyelitída, septická artritída, flebitídy, mastitídy, meningitída • GIT infekcie - zvracanie, hnačky • TSS - toxic šok syndróm SSS- scalded skin syndrome osteomyelitis, infekcia moč. mechúra • Nozokomiálne infekcie a infekcie kože, katétrov, poálenín, imunosuprimovaných,

38. St. epidermidis a ostatné PC negatívne stafylokoky • Infekcia katetrov, shuntov, kĺbnych náhrad • Infekcia chlopní - umelých alebo poškodených - endokarditída - indolentný priebeh - niekedy až 1 rok po chirurgickom zákroku • Staphylococcus saprophyticus - močové infekcie mladých sexuálne aktívnych žien • Kontaminácia alebo etiologické agens • Terapia stafylokokových infekcií • Penicilín, stafylokokový penicilín - oxacilín, methicilín,TTC,CMP,ERY, KANA, GEN, STM, Fluorochinolóny • Rýchly vývoj rezistencie: penicilináza • Rezistencia na bežné ATB hlavne PK negat. • Nemocničné kmene rezistentné na mnohé ATB - • MRSA - meticilin resistentný St.aureus • VRSA - vancomycin resistenetný St.aureus -

39. Streptococcus - taxonomia a vlastnosti • Taxonomia - podľa hemolýzy na krvnom agare : alfa - neúplná, beta - úplná, gama-bez hemolýzy - podľa sérologických skupín Lancefieldovej A-H, K-V, nie všetky streptokoky majú tento skupinovo špecifický antigén bunkovej steny • A S. pyogenes bacitracin beta hemolýza • B S. agalactiae CAMP beta hemolýza • C S. anginosus beta, alfa • D S. bovis alfa, gama • - S. pneumoniae optochin + alfa • - S. salivarius optochin - alfa

40. Streptococcus sk A - pyogenes • V bujóne dlhé retiazky - mikroskopicky • Antigénna štruktúra - púzdro - kys.hyaluronová-identická s väzivovou - neimunogénne • skupinovo typovo špecifické antigény - najdôležitejší M antigén - na povrchu fimbrií, virulencia ochrana pred fagocytózou a spoluprácou s C´. Typ 1,3,18 - invázne ochorenia, M3 a M18 - Reumatická horúčka • Exotoxíny - erytrogénny toxín - raš pri šarlachu, Dickov test, • Streptolyzín S - oxgén stabilný, lýza ery, uvoľňovanie lyzozýmu, neimunogénny • Streptolyzín O - reverzibilne inaktivovaný kyslíkom, imunogénny, protilátky proti streptolyzínu O - ASLO, usmrcovanie leukocytov • Streptokináza - lýza krvných trombusov, rozšírenie streptokokov • DN-áza - necytolytický, depolymerizáci voľnej DNA - v hnise, znižovanie viskozity hnisu a šíreni

41. Streptokokové infekcie • Streptococcus pyogenes HSA - faryngitída - dif dg. od vírusovej - šarlach - faryngitída s exantémom - infikujúci kmeň lyzogénnou konverziou získal schopnosť produkovať erytrogénny toxín (raš - s deskvamáciou, cirkumolárny výbled, malinový jazyk) - toxický šokový syndróm - celulitída, nekrotizujúca fasciitída, hypotenzia, erytrodermia, multiorgánové zlyhanie, bakterémia, M1, M3, M18 - erysipel, pyodermia - hnisavé kožné ochorenia • Febris rheumatica - reumatická horúčka - nehnisavé streptokokové ochorenie - zápalové ochorenie srdca, kĺbov, ciev a podkožia - autoimunitné ochorenie, súvisiace s niektorými sérotypmi M proteinu ( typovo špecifický antigén, nástroj virulencie, označený číslami, M18, M3…) následok len infekcie dýchacích ciest. Nevzniká po kožnom streptokokovom ochorení • Poststreptokoková akútna glomerulonefritída - špecifické nefritogénne kmene, po str. infekcii kože aj dýchacích ciest

42. Streptococcus agalactiae, HSB • novorodenencké infekcie (menginitída, pneumonia), puerperálna sepsa /kolonizujú DC, GIT aj vagínu - nebezpečenstvo při prolongovaných predčasných pôrodoch, význam materskej imunity/ • G+ koky v retiazkach, beta hemolýza, dif dg.od HSA - CAMP test - zosílená hemolýza Staf. aureusom • Ostatné streptokoky • Beta hemolytické zo skupiny C,F,G - rôzne infekcie, nikdy poststreptokokové komplikácie • Viridujúce -.alfa a nehemolytické streptokoky - Streptococcus salivarius, viridans - bacterémia, subakútna endokarditída, caries, intraabdominálne hnisavé infekcie • Nutnosť prechádzajúceho poškodenia (zubu, chlopne) • Zubný kaz - tvorba dextranu z glukózy

43. Streptococcus pneumoniae • G+koky v dvojiciach, diplokoky, lancetovitý tvar - sviečka a plameň,viridujúce - odlíšenie - pozitívny optochínový test, rozspustnosť kolónie v žlči • opúzdrené a neopúzdrené kmene - polysacharidové púzdro - nástroj virulencie - viac ako 90 sérotypov púzdrových antigénov peptidoglykanová vrstva b. steny typická pre G+baktérie obsahuje teichoovú kyselinu a cholín ( jedinečná látka, dôležitá pre delenie bb) • 2 formy kys. teichoovej v bunkovej stene: - povrchová (C substancia) a kovalentne viazaná C substancia Precipituje globulínovú frakciu ľudského séra nazvanú CRP - C reaktívny protein - bielkovina akútnej fázy zápalu, prítomná u zdravých v nízkych hladiných, stúpa při zápalových ochoreniach - pedovšetkým bakteriálnych

44. Streptococcus pneumoniae - infekcie • Opúzdrené kmene - virulentné - pneumónia, (lobárna, krupózna - bez ATB vyliečenie až po 14 dňoch - kríza - po vytvorení antikapsulárnyhch protilátok), meningitída, bakterémia - veková predilekcia - u starých (superinfekcia vírusových IDC) a detí do 3 roku života • Neopúzdrené kmene - sínusitída, otitis media • Citlivosť na ATB • Str. pyogenes - 100% citlivý na PNC, (pri alergii makrolidy ERY) • Str. agalactiae - výborná citlivosť na PNC existuje tolerancia - inhibícia, nie rezistencia, nástup rezistencie na ERY, TTC • Str. salivarius - citlivé na PNC, existuú aj rezistentné • Str. pneumoniae - PNC, TTC, CMP, CEF., nástup rezistencie na PNC - aj multirezistencia - znížená afinita antibiotika na penicilin binding protein

45. Enterococcus • G+ koky, vo veľkom množstve v tenkom a hrubom čreve, schopné rásť zas prítomnosti žlče - dif. dg. - eskulínová pôda • E. faecalis • E. faecium • močové infekcie, intraabdominálne abscesy, bakterémia • ATB nebaktericídne, rezistentné - synergická terapia aminoglykosidov a atb účinkujúcich na úrovni b. steny • Rezistencia prenosná plazmidmi - a na stafylokoky

46. Nesporulujúce G + paličky heterogénna skupina • Corynebacterium - coryneformné, diphtheroidné paličky - C. diphteriae (diphtheria), C. jeikeium (oportúnne). C. urealyticum (IMC), C. pseudodiphthericum (endocarditis), C. ulcerans (pharyngitis) • Arcanobacterium haemolyticum - pharyngitis • Actinomyces - granulomatózne ulceratívne infekcie • Rhodococcus - hnisavá pneumónia, opportúnne infekcie • Listeria - meningitis, septicaemia, granulomatosis infantiseptica • Erysipelothrix - erysipeloid, septicaemia, endocarditis • Gardnerella - bacteriálna vaginósa

47. Corynebacterium • Pleoimorfné G+ paličky ukladajúce sa do krátkych retiazok, vytvárajúce písmená Y,V • Metachromatické granuly - výsledná farba je odlišná od farby použitého farbiva • Zvláštna stavby bb. steny - kys. mykolová s krátkymi reťazcami - taxonomická blízkosť k mykobaktériám • C. diphtheriae - preventabilné ochorenie diftéria • asymptomatické nosičstvo vo faryngu, prenosné kvapôčkovou inf. • C. jeikeium - JK - oportunistic patogen in immunocompromised - hematological disorders • Ostatné - prenosné zo zvierat

48. Corynebacterium- patogenéza a imunita • Difterický exotoxín - tox gén môže byť prinesený do baktérie (C. diftérie, C. ulcerans, C.pseudotuberculosis prostredníctvom bakteriofágu - lyzogénna konverzia • A-B protein: B fragment - väzba na povrch bb umožní vstup A fragmentu do bb. A fragment enzymaticky aktívny - blokuje syntézu proteinov- predlžovanie peptidového reťazca na ribozómoch za prítomnosti Fe • Schickov kožný test - dôkaz neutralizujúcich protilátok - i.d. podaním difterického toxínu • Klinický prejav záleží na stave imunity a mieste infekcie: - asymptomatická kolonizácia, mierne respiračné ochorenie, fulminantná diftéria

49. Klinický obraz, liečba a prevencia • Diftéria - záškrt- ochorenie HCD, s nízkou teplotou, toxínom navodeným lokálnym poškodením s tvorbou priliehajúcej psuedomembrány na tonzilách, faryngu a/alebo nose a celkovými prízankmi. Komplikáciou je myokarditída. • Kožná diftéria - prenos kožným kontaktom od infikovaných osob, kolonizácia kože a stup cez oderky - papuly až chronické nehojacie sa vredy s membránou a celkovými známkami intoxikácie • ATB - PNC, ERY - eliminujú baktériu • Terapia - difterický antitoxín • Aktívna imunizácia DTP vakcína detí + booster dávky aj v dospelosti • Preliečenie bezpríznakových nosičov a kontaktov • Protektívna imunita při kožnej forme

50. Erysipelotrix • E. rusiopathiae: G+ nesporulujúca fakultatívne anerobná palička, celosvetovo rozšírená u zvierat, onemocnenie ošípaných • Kultivácia pri redukovanom kyslíku, malé šedavé,alfa hemolytické kolónie, 2-3 dni, vzorka z hĺbky tkaniva. • Erysipeloid - profesionálna nákazy (mäsiari, potravinári - ryby) po subkutánnej inkubácii -lokalizované kožné infekcie -generalizovaná kožná forma -septikémia -súvisiaca s endokarditídou (nepoškodené chlopne - aortálna) • Terapia PNC, ERY,CLI (sulfonamidy, vancomycin, aminoglycosidy - resistencia)