Le cours sur la synth se et d gradation de l h me aura lieu le 25 avril 2013
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Le cours sur la synthèse et dégradation de l ’ hème aura lieu le 25 avril 2013 PowerPoint PPT Presentation


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BCM 1502. Le cours sur la synthèse et dégradation de l ’ hème aura lieu le 25 avril 2013. Diapositives seront mises sur Studium ASAP Merci de votre compréhension. Johnny Deladoëy MD PhD CHU Sainte-Justine [email protected] Thyroid4kids.org. BCM 1502.

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Le cours sur la synthèse et dégradation de l ’ hème aura lieu le 25 avril 2013

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Presentation Transcript


Le cours sur la synth se et d gradation de l h me aura lieu le 25 avril 2013

BCM 1502

Le cours sur la synthèse et dégradation de l’hème aura lieu le 25 avril 2013

  • Diapositives seront mises sur Studium ASAP

  • Merci de votre compréhension

Johnny Deladoëy MD PhD

CHU Sainte-Justine

[email protected]

Thyroid4kids.org


Biosynth se et catabolisme des nucl otides

BCM 1502

Biosynthèse et catabolisme des nucléotides

  • Voet, chapitre 28.1; 28.2; 28.3 et 28.4

Johnny Deladoëy MD PhD

CHU Sainte-Justine

[email protected]

Thyroid4kids.org


Bcm 1502 examen intra

BCM 1502 examen intra

  • 20 questions (½ qcm; ½ développement court)

  • Structure de molécules à savoir = cortisol.

  • Voies métaboliques = vision globale et schématique (tel que présenté sur les diapositives de résumé)

  • Enzyme à connaître avec leur réactions = enzyme inhibés par un médicament, impliqué dans une maladie ou enzyme clé de la voie.

  • Médicaments à connaître = tous les médicaments mentionnés sur les diapositives. Savoir leur nom et l’enzyme qu’ils bloquent.

  • Je mets une emphase sur les molécules / enzymes / voies recoupant plusieurs cours (e.g.: cortisol)


Comprendre la biosynth se des ribonucl otides c est

comprendre la biosynthèse des ribonucléotides, c’est...

  • comprendre la synthèse des unités de bases de l’ADN et de l’ARN

  • comprendre leur rôle comme source d’énergie cellulaire

  • comprendre le principe des médicaments immunosuppresseurs et anti-rejet, les chimiothérapies...


Les bases

Les bases


Nucl osides et nucl otides

nucléosides et nucléotides

1 – base

5 – résidu phosphate

3’-5’ = liaison phosphodiester


Nucl osides et nucl otides1

nucléosides et nucléotides

Voet section 16-4


D soxynucl otides adn

désoxynucléotides >> ADN


Biosynth se de novo et r cup ration des purines survol

Biosynthèse de novo et récupération des purines - survol

11 réactions

IMP

AMP

GMP

ADP

GDP

ATP

GTP


Catabolisme des purines survol

Catabolisme des purines - survol

xanthine

allopurinol

acide urique

urate oxydase recombinante

allantoïne


Biosynth se des purines 1

Biosynthèse des purines -1

  • l’acide urique = produit de dégradation des purines

  • Buchanan et al., JBC 1948 Mar;173(1):81-98

de 2 glutamines


Biosynth se des purines 2 biosynth se de novo

Biosynthèse des purines -2Biosynthèse de novo

  • 2 glutamines

  • 1 glycine

  • 2x formyl THF (acide folique)

  • 1 aspartate

  • du bicarbonate

  • ....et de l’énergie (Ribose-P + ATP)


Biosynth se des purines 3 survol

Biosynthèse des purines -3 (survol)

R5P: Ribose-5-phosphate

1) ribose posphate

pyrophosphokinase

transfet du groupe phosphophoryle

de L’ATP au C1 du R5P

PRPP: 5-phosphoribosyl-pyrophosphate

Gln

PRA: 5-phosphoribosyl-amine

2) amidophosphoribosyl

transférase

3) GAR synthase

GAR: glycinamide ribonucléotide

4) GAR transformylase

FGAR: formyl glycinamide ribonucléotide

5) FGAM synthétase

FGAM: formyl glycinamidine ribonucléotide

Aspartate

étapes 6 à 11


Biosynth se des purines 4 voet

Biosynthèse des purines -4 (Voet)


Biosynth se des purines 5 biosynth se de l amp et de la gmp

Biosynthèse des purines -5Biosynthèse de l’AMP et de la GMP

  • IMP ne s’accumule pas dans la cellule mais est rapidement transformé en AMP et en GMP.

  • les 2 sont synthétisés par une voie à 2 réactions

  • IMP deshydrogénase est une cible pharmaceutique de l’acide mycophénolique(MPA) = le mycophenolate mofetil (MMF/CellCept) est utilisé comme médicament anti-rejet lors de greffes.

adénylosuccinate


Biosynth se des purines 6 biosynth se de l amp et de la gmp

Biosynthèse des purines -6Biosynthèse de l’AMP et de la GMP

  • IMP ne s’accumule pas dans la cellule mais est rapidement transformé en AMP et en GMP.

  • les 2 sont synthétisés par une voie à 2 réactions

  • IMP deshydrogénase est une cible pharmaceutique de l’acide mycophénolique(MPA)= le mycophenolate mofetil (MMF/CellCept) est utilisé comme médicament anti-rejet lors de greffes.

  • MPA forme une liaison covalente (avec atome S de Cys 331) avec IMP deshydrogénase


Nucl osides monophosphate diphosphate et triphosphate

Nucléosides monophosphate, diphosphate et triphosphate

p.ex.)

GMP + ATP  GDP + ADP via nucléoside monophosphate kinase

GDP + ATP  GTP + ADP via nucléoside diphosphate kinase


Biosynth se des purines 7 r gulation de la synth se des purines la grande inhibition

Biosynthèse des purines -7Régulation de la synthèse des purines«la grande inhibition»


Catabolisme des purines survol rappel

Catabolisme des purines – survol (rappel)

AMP

XMP

GMP

IMP

xanthine

allopurinol

acide urique

urate oxydase recombinante

allantoïne


Catabolisme des purines 1 d gradation des purines

Catabolisme des purines -1dégradation des purines

3 réactions:

déphosphorylation

hydrolyse de liaisons glycosidiques par les purine nucléoside phosphorylase (PNP)

Désamination par désaminases


Catabolisme des purines 3 survol 2

Catabolisme des purines -3survol 2

catabolisme


Catabolisme des purines 4 la goutte

Catabolisme des purines -4la goutte

Xanthine oxydase

Allopurinol

traitement en amont


Catabolisme des purines 5 syndrome de lyse tumorale

Catabolisme des purines -5Syndrome de lyse tumorale

= use of recombinant urate oxydase

traitement en aval


Catabolisme des purines 6 voies de r cup ration des purines

Catabolisme des purines -6Voies de récupération des purines

  • vu la vitesse de renouvellement importante des acides nucléiques (surtout ARN)

  • une voie de récupération est intéressante (sauve de l’énergie)

  • cela récupère le produit du catabolisme des purines que sont l’adénine, la guanine et l’hypoxanthine.


Catabolisme des purines 7 voies de r cup ration des purines

Catabolisme des purines -7Voies de récupération des purines

  • chez les mammifères les purines sont récupérées par 2 enzymes différentes:

    • APRT (adénine phosphoribosyltransférase)

      • adénine + PRPP <---> AMP + PPi

      • adénine est récupérée en AMP

    • HGPRT (hypoxanthine-guanine phosphorybosyl transférase)

      • hypoxanthine + PRPP <---> IMP + PPi

      • guanine + PRPP <---> GMP + PPi


Catabolisme des purines 8 voies de r cup ration des purines syndrome de lesh nyhan

Catabolisme des purines -8Voies de récupération des purinesSyndrome de Lesh-Nyhan

  • par déficit sévère de HGPRTXq26-q27.2

    • lié à l’X (atteint que les garçons)

    • tableau clinique: spasticité, retard mental, agressivité, automutiation.

    • accumulation de PRPP, augmentant la synthèse d’IMP et par contre coup d’acide urique


Biosynth se des pyrimidines 1

Biosynthèse des pyrimidines -1

  • La moisissure du pain Neurospora crassa sont incapables de synthétiser des pyrimidines et doit trouver dans le milieu de culture de la cytosine et de l’uracil


Biosynth se des pyrimidines survol

Biosynthèse des pyrimidines - survol

6 réactions

UMP

phosphorylation

amination

UTP

CTP

Certains mutants de la moisissure du pain (Neurospora crassa) sont incapables de synthétiser des pyrimidines et doit donc trouver dans son milieu de la cytosine et de l’uracile.

Ces mutants croissent aussi si on substitue la cytosine et l’uracile par l’acide orotique

TTP


D gradation des pyrimidines survol

Dégradation des pyrimidines - survol

UMP

uracil

alanine

malonyl-CoA

synthèse des acides gras


Biosynth se des pyrimidines 2 biosynth se de novo

Biosynthèse des pyrimidines -2Biosynthèse de novo

  • 1 glutamine

  • 1 aspartate

  • de la quinone

  • du bicarbonate

  • ....et de l’énergie (ATP)


Biosynth se des pyrimidines 3 voet

Biosynthèse des pyrimidines -3 (Voet)


Biosynth se des pyrimidines 3 survol

Biosynthèse des pyrimidines -3 (survol)


Biosynth se des pyrimidines 4

Biosynthèse des pyrimidines -4

  • La dihydro-orotate déshydrogénase est la cible thérapeutique du A77 1726 (métabolite de la léflunomide [Arava]), médicament utilisé dans certains cas d’arhtrite rhumatoïde


Catabolisme des pyrimidines 1

Catabolisme des pyrimidines -1

comme pour les purines: 3 étapes >> desamination, déphosphorylations et hydrolyses de liaisons glycosidiques

Synthèse des acides gras


Adn formation des d soxyribonucl otides 1

ADNFormation des désoxyribonucléotides -1

L’ADN diffère de l’ARN sur 2 points:

Contient des résidus 2-désoxyriboses au lieu de résidus 2-riboses

Il contient la base thymine (5-méthyluracile) à la place de l’uracile


Adn formation des d soxyribonucl otides 2

ADNFormation des désoxyribonucléotides-2

  • Les désoxyribonucléotides sont synthétisés à partir des ribonucléotides par rédcution de leur position 2 et NON pas synthèse de novo.

  • Cette réduction est catalysée par les ribonucléotide réductases (RNR)

  • Les RNR (E. Coli) sont inhibées par l’hydroxyurée et par la 8-hydroxyquinoline


Adn origine de la thymine 1

ADNorigine de la thymine - 1

  • Thymine = uracile méthylé

  • dUMP dérivé de dUTP par dUTPase

  • Méthylation du dUMP


Adn origine de la thymine 2

ADNorigine de la thymine - 2

La triméthoprime est un agent antibactérien


R sum

Résumé


Biosynth se de novo et r cup ration des purines survol1

Biosynthèse de novo et récupération des purines - survol

11 réactions

IMP

AMP

GMP

ADP

GDP

ATP

GTP


Catabolisme des purines survol1

Catabolisme des purines - survol

xanthine

allopurinol

acide urique

urate oxydase recombinante

allantoïne


Biosynth se des pyrimidines survol1

Biosynthèse des pyrimidines - survol

6 réactions

UMP

phosphorylation

amination

UTP

CTP

TTP


D gradation des pyrimidines survol1

Dégradation des pyrimidines - survol

UMP

uracile

alanine

malonyl-CoA

synthèse des acides gras


Fin du cours

Fin du cours

  • Métabolisme des eicosanoïdes et leurs fonctions biologiques

  • Synthèse du cholestérol, sels biliaires et hormones stéroïdiennes

  • Intégration générale du métabolisme énergétique

  • Synthèse et dégradation de l’hème


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