1 / 36

How much biodiversity data?

Worldwide , up to 5,000,000,000 primary records exist in museums and research organisations . 2-3 billion specimens in collections ( mostly non digital ) 1-2 billion digital observation records from biological surveys. How much biodiversity data?.

pelham
Download Presentation

How much biodiversity data?

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Worldwide, up to 5,000,000,000 primaryrecordsexist in museums and researchorganisations. 2-3 billionspecimens in collections (mostlynondigital) 1-2 billiondigitalobservationrecordsfrombiologicalsurveys Howmuchbiodiversity data?

  2. Missäon Suomenbiodiversiteettidata?Yli 50 miljoonaatietoa, joistajo10 miljoonaaGBIF:nkauttasaatavilla.

  3. Suomen luonnon monimuotoisuuden suojelun ja kestävän käytön strategia ja toimintaohjelma 2006-2016(Valtioneuvoston päätös 21.12.2006) • Verkostoyhteistyönä tulee kerätä yhteiset ja kaikille avoimet tietokannat seurannoista, niiden suorittajista, aineistoista ja raporteista. • Tavoitteena on luoda luonnon monimuotoisuuden valtakunnallisen tilan ja kehityssunnan seurantajärjestelmä vuoteen 2010 mennessä. • Luonnon monimuotoisuutta koskevat tiedot tulee järjestää siten, että ne on helposti saatavilla riippumatta siitä missä ja kenen toimesta ne on kerätty. • Luonnontieteellisen keskusmuseon (LTKM) toimintaedellytyksiä kansallisena biologisen tiedon kokoajana ja välittäjänä parannetaan. • LTKM:n hallussa oleva taksonominen aineisto ja alueellisten museoiden tärkeimmät kokoelma-ainestot muunnetaan digitaalisen muotoon. • Sovitaan taksonomisten luetteloiden päivittämisestä ja digitaalisesta vaihdosta. • Järjestetään luonnon monimuotoisuutta koskevan tiedon hallinta verkostoperiaatteella. • LUMONET-palvelusta kehitetään eri tahojen tuottamaa luontotietoa kokoava ja välittävä portaali. • Tavoitteeksi asetetaan, että kaikki aihetta koskeva yhteiskunnan tukema tai kustantama tieto on vapaasti ja mahdollisimman pienin kustannuksin saatavilla.

  4. Open Access: International mandate United Nations Convention on Biological Diversity CBD Decision VIII/11:Scientific and technical cooperation and the CHM “Invites Parties and other Governments to provide free and open access to all past, present and future public-good research results, assessments, maps and databases on biodiversity, in accordance with national and international legislation …”

  5. Yhteiskäyttö: Miksi? • Aikammekeskeisetongelmatkutenlajikatojailmastonmuutosovatniinsuuriajamaailmanlaajuisia, ettäyksittäisettutkijat, tutkimusryhmät tai laitokseteivätenäävoikerätäyksinäänniitäkoskeviakäyttökelpoisiaaineistoja. • Tietojenyhdistelysadoistatietokannoista on mahdollista vain avoimenyhteiskäytönperiaatteella.

  6. Global Biodiversity Information Facility jaGBIF-tiedonjakoSuomessa Digitointiseminaari17-18.11.2011, Joensuu

  7. Mikä on GBIF • Kansainvälinen, hallitustenväliseensopimukseenperustuvajärjestöluonnonmonimuotoisuuttakoskevantieteellisentiedonyhteiskäytönedistämiseksi, perustettu 2001. • Suuritutkimusinfrastruktuuri, jokamobilisoi “primääriaineistoja” yhteiskäyttöön • Jäsenmaita 57, jäsenjärjestöjä 47 • SihteeristöKööpenhaminassa, jäsenilläkansallisetsolmutjajoukkotietolähteitä • MuitaEncyclopedia of Life, Catalogue of Life, International Barcode of Life, Biodiversity heritage Library, … Toimivatlöyhänäkonsortiona

  8. GBIF-tiedonkäyttö • Vuonna 2011 on ilmestynytjonoin 300 tieteellistäartikkelia, jotkakäyttävätdataa GBIF-verkostosta • Ecological Niche Modelling –tekniikkaa on käytettynoin 80% artikkeleista

  9. Integrated Large-Scale Data Is Being Used in Ecological Science Ecological niche modeling of species distributions Where do species occur now? Image from http://www.lifemapper.org Where will they occur in the future? http://www.globalamphibians.org/

  10. Environmental Characteristics Of Surrounding Geographic Area Native Distribution Prediction Known Species Locations Environmental Characteristics Of Different Geographic Area Environmental Characteristics from gridded GIS layers Develop Model Temperature layer Invasion Area Prediction Many other layers Multidimensional Ecological Space Future Scenarios Of Environmental Characteristics D2 Dn Environmental Change Prediction D1 = Temperature Pistemäisestä luontohavainnoista ympäristöä koskevaan päätöksentekoon GBIF SS

  11. Vanessa atalanta:Actual observations (shown as red dots) for period 1900-1930 are used to develop ecological niche model (shown in yellow)

  12. The niche model is run against climate/environmental conditions known for the period 1960-1990 and this results in a "predicted" extended range for the species (shown in yellow). The actual observations available for the same period (shown as red dots) overlay well with the new predicted range.

  13. HäiveperhonenApatura iris Ennen 2001 Jälkeen 2001

  14. GBIF Data Portal • Data.gbif.org: 312 miljoonaatietuetta 8548 aineistosta tai kokoelmasta 342 palvelimella 50 maassa

  15. GBIF Suomessa • Tutkimusinfrastruktuurientiekartallamainittu • Suomenjäsenmaksu62 700 €/v • Tällähetkelläeikansallistarahoitusta • 2007-2010 yhteensä 500 000 € • Uudelleenorganisointitarpeen

  16. Definition of a Participant Biodiversity Information Facility (BIF or Node) • A mechanism by which a Participant coordinates and supports its GBIF networked data-sharing activities. • The Participant BIF has the overall objective of promoting, coordinating and facilitating the mobilisation and use of biodiversity data among all the relevant stakeholders within the Participant’s domain, primarily to help address the Participant’s biodiversity information needs and priorities. • The Participant BIF should be the main mechanism by which the GBIF Participant coordinates with, contributes to and benefits from the central services, infrastructure, and capacity provided by GBIF as a globally decentralised initiative. • A Participant BIF includes both physical infrastructure and human resources. Typically a Participant BIF encourages and supports the activities of the Participant’s data holders/publishers to both contribute and use GBIF-served data, provides information technology (IT) infrastructure and expertise for GBIF-related activities, and functions as an information gateway among Participants, other stakeholders, and the GBIF Secretariat.

  17. Functions of National BIF or Node Build capacity Help develop information products and services Help address data & information needs Help identify data and information gaps Engage data holders Participant NODE/BIF Promote best practices in data management Coordinate data sharing activities Promote online publication of scientific data Identify user communities – assess end user needs Implement informatics infrastructure Help formulate and adopt data sharing and management policies Helpdesk Coordinate and promote digitisation

  18. Suomen GBIF-tietolähteet • GBIF-tietolähdekaikissamuseoissa • Lähes 10 miljoonaatietuetta • Suomestaon jaettu 49 tietoainestoa • Suomeakoskee 354 tietoaineistoajanoin 100 000 näytetietoatuleeulkomailta

  19. Tiedonvaihtostandardit • Darwin Core ja ABCD -tiedonvaihtomuodot • Protokollat (XML-pohjainenkyselykielijasanomanlähetys) • DiGIR (Turku, Jyväskylä) • TAPIR (Birdlife, Helsinki, Oulu) • BioCASe (Helsinki) • Darwin Core Archive (Joensuu)

  20. Tietoaineistojenmobilisoinnintavoitteet • Suunnitelmallisuutta, tavoitteellisuutta, kattavuutta • Uuttalintudataajoehkäriittävästi… • Putkilokasvit, sienet, jäkälät, kovakuoriaiset, … • Suomendigitoinninprioriteetit on määriteltykansallisessadigitointistrategiassa: • Tyyppinäytteet • Uhanalaistenlajientiedot • Ulkopuolisten hankkeiden tarvitsemat käytetyimmät näytteet, lainat, kladikirjat, kokoelmien metatiedot

  21. GBIF strategy and action plan for mobilisation and digitisation • GBIF must facilitate access to information about non-digitized collection resources by publicizing the research potential of collections through metadata and assessing the number of non-digitized specimens; • GBIF must work with collections to continue to increase the efficiency of specimen data capture and to enhance data quality by means of technical measures, by means of ensuring attribution and professional credit and influencing institutional priorities, and by engaging with funding agencies; • GBIF must continue to improve and promote the global infrastructure used to mobilize digitized collection data through technical measures, outreach activities and political measures.

  22. Yhteenvetojajohtopäätökset • GBIF on jatkossapäosinkansallisiatarpeitavarten. • Suomen GBIF-verkostoorganisoitavauudestaan. • Nykyisin 90% datastatuleetieteellisiltäseuroilta. Museoidentehostetavatiedonjakoajavirastotjalaitoksetmukaan. • GBIF on perustavaalaatuaolevarakennuspalikkamuissatutkimusinfrastruktuureissa.

More Related