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Dinâmica Populacional de Infecções Virais Paolo Zanotto LEMB - ICB - USP

Dinâmica Populacional de Infecções Virais Paolo Zanotto LEMB - ICB - USP. DNA como documento de dinámica populacional de vírus. Filogenias nos informam sobre: • Origem e distribuição biogeográfica: Arbovírus • Modo de transmissão (contágio): e VHG • Dinâmica de transmissão (R 0 ): HIV-1

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Dinâmica Populacional de Infecções Virais Paolo Zanotto LEMB - ICB - USP

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Presentation Transcript

  1. Dinâmica Populacional de Infecções Virais Paolo Zanotto LEMB - ICB - USP

  2. DNA como documento de dinámica populacional de vírus

  3. Filogenias nos informam sobre: • Origem e distribuição biogeográfica: Arbovírus • Modo de transmissão (contágio): e VHG • Dinâmica de transmissão (R0): HIV-1 • Mecanismos de seleção (imunudade, vacinas & detecção): HIV-1, CoV-SARS

  4. Arvore filogenética como metáfora da história de transmissão e distribuição

  5. Arvore & Inferência Amostras ? ? ? ? Inferência ? Caso índice ? ? Modelo Evolutivo & Método

  6. Distribuição biogeográfica Flavivírus transmitidos por Ácaros

  7. Dsitribuição Clinal do TBE

  8. Flavivírus transmitidos por Mosquitos

  9. Dengue & EJ

  10. Modo de transmissão: Hepatite G (HGV)

  11. Form name Subtype structure Number % 148 73 78 27 36 166 133 1A 31 43 24 1B 1C 1 2A 11 13 2B 5 1 2C 7 3A 8 3B 3 1 4 1 c27-3BP variants 1 9 1 1 1 1 1 4 c36-3BP variants 2 7 1 1 1 2 1 4 Short F fragment variants 1 11 1 1 2 1 1 5’B/F/B3’ 1 1 PR RT 1 99 / 1 324 5 5’F/B3’ 6 3 HIV-1: FRC - (B & F) Argentina

  12. A D B E 150 54 50 140 Number of Lineages: 40 112 30 84 Epidemic 56 20 Transform 28 10 14 5 1 1 0 0.008 0.016 0.024 0.032 0.040 0 0.003 0.009 0.015 0.021 0.027 0.033 Time (substitutions per site) C F 4 7 10 10 6 ‡ 10 § 3 5 10 10 4 10 q (2 m) e 2 3 10 10 2 10 1 1 10 10 -1 10 1990 1995 2000 1990 1995 2000 Time (years) FRC - B/F Subtipo B

  13. Síndrome Respiratória Aguda Grave - SARS Civeta “gato almiscarado” Coronavírus Cov-SARS

  14. Detecção Molecular do CoV-SARS

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