四、 RNA 的分子结构

四、RNA的分子结构 (一) RNA的一级结构：组成RNA的核苷酸按特定序列通过 3’,5’-磷酸二酯键连接的线性结构。 • 对于RNA的一级结构，研究最多的是tRNA。tRNA的5，-末端总是磷酸化，而且常是pG ；3，-末端最后三个氨基酸顺序相同，总是CCAOH ；tRNA中含有较多的稀有碱基，每分子含7～15个，稀有碱基中最常见的是甲基化的碱基。

在rRNA分子中，研究最多的是5SrRNA和16SrRNA。大肠杆菌中的5SrRNA的5，-端常出现pppU，3，-端为UOH ；第43～47位的核苷酸顺序为CGAAC（真核细胞此序列则出现在5.8SrRNA），这是rRNA与tRNA相互识别、相互作用的部位；原核细胞16SrRNA的3，-端总存在序列ACCUCCU，这是mRNA的识别位点。

超速离心机 转速2.5-8×104rpm，相对离心力5*105g；用于DNA、RNA蛋白质及细胞器病毒分离纯化；检测纯度；沉降系数和相对分子量测定等。

密度升高 密度梯度离心又称速率—区带离心,沉降系数较接近的物质分离的方法；原理：不同颗粒之间存在沉降系数差时，在一定离心力作用下，颗粒各自以一定速度沉降，在密度梯度不同区域上形成区带的方法。介质梯度应预先形成，介质的最大密度要小于所有样品颗粒的密度。常用的有蔗糖、甘油；密度梯度液的制备用梯度混合器，形成由管口到管底逐步升高的密度梯度；操作：离心前将样品小心铺放在密度梯度溶液表面，离心形成区带。离心后不同大小、不同形状、有一定沉降系数差异的颗粒在密度梯度液中形成若干条界面清楚的不连续区带；可用来分离核酸、蛋白质、核糖体亚基及其它成分。

mRNA相对分子质量不均一，代谢活跃，这给一级结构的研究带来一定困难。真核细胞mRNA与原核mRNA比较，在结构上具有明显的区别。真核细胞mRNA的3，-末端有一段可长达200个左右的聚腺苷酸（poly A），称为“尾”结构；5，-末端有一个甲基化的鸟苷酸,称为“帽”结构，m7G 5’ ppp 5’ N p N p、 m7G 5’ ppp 5’ N mp N p、 m7G 5’ ppp 5’ N mp N mp这种“尾”和“帽”的结构在mRNA功能表现中具有重要作用。

帽子结构

（二） RNA二级结构 单链RNA自行盘绕形成局部双螺旋的多“臂”多“环”结构，螺旋部分称为“臂”，非螺旋部分称为“环”，在螺旋区，A与U配对，G与C配对。

tRNA的二级结构：三叶草形状 RNA三叶草型的二级结构可分为：氨基酸接受区、二氢尿嘧啶区、反密码区、TΨC区和可变区。除氨基酸接受区外，其余每个区都含有一个突环和一个臂。

（三）tRNA的三级结构：倒"L"形 所有的tRNA折叠后形成大小相似及三维构象相似的三级结构，这有利于携带的氨基酸的tRNA进入核糖体的特定部位。

16s rRNA作为细菌进化的计时器 ●生物共有的 ●一定的信息量（1542个核苷酸） ●一定的保守性 ●便于比较研究

16s rRNA核苷酸序列分析： ● DNA-PCR法提取DNA ↓ PCR扩增16S rRNA基因 ↓ PCR产物纯化 ↓ 16SrRNA基因序列测定 ↓ Genbank检索

●相似性结果的一般判断： 1. SAB≥97% 同种 2. SAB为85~97% 同属 3. SAB≤85 % 不同属

HIV的形态

包膜糖蛋白 gp120 gp41 人类免疫缺陷病毒结构模式图脂双层膜内膜蛋白衣壳蛋白 RNA 蛋白酶逆转录酶整合酶

吸附 CD4＋细胞 RNA进入细胞内 HIV的包膜与细胞膜融合逆转录酶整合至宿主细胞的染色体上拼接成mRNA 一部分转录整合酶 RNA DNA 一部分转译拼接成子代RNA 结构蛋白调节蛋白核衣壳出芽的方式释放获得包膜子代HIV 病毒的复制 HIV包膜上的gp120

皮肤病变 Kaposi’s肉瘤鹅口疮

四、 RNA 的分子结构

四、 RNA 的分子结构

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