… ένα μικρό «λεξικό».

1. Το πρωτεϊνοσυνθετικό εργοστάσιο του κυττάρου, και …. 5 2 4 3 6 1 8 7 … ένα μικρό «λεξικό».

2. Συναρμολογημένα ριβοσώματα rRNA Πρωτεΐνες Υπομονάδες L1 L2 L3 5S + 23S 23S 5S (2900 βάσεις) (120 βάσεις) 50S (Σύνολο: 31) Προκαρυωτικό S1 S2 S3 16S + 70S 16S 30S (1540 βάσεις) (Σύνολο: 21) L1 L2 L3 5,8S 5,8S 5S (160 βάσεις) + 28S 28S 5S 60S Ευκαρυωτικό (θηλαστικού) (4800 βάσεις) (120 βάσεις) (Σύνολο: 50) S1 S2 S3 + 18S 80S 18S 40S (1900 βάσεις) (Σύνολο: 33)

3. 3΄ αμινοακύλo άκρο: θέση για τη σύνδεση του αμινοξέος Η πραγματική τρισδιάστατη δομή του tRNAγια το αμινοξύφαινυλαλανίνη στη ζύμη. βρόχος αντικωδικονίου αντικωδικόνιο αντικωδικόνιο ασπαρτικό φαινυλαλανίνη Δύο μόριαtRNAαπό τη ζύμη της αρτοποιίας, σε υπέρθεση. Όταν αναδιπλωθούν στην τελική τρισδιάστατη δομή τους, το tRNAγια το αμινοξύγλουταμίνη (μπλε) επικαλύπτεται σχεδόν πλήρως με το tRNAγια το αμινοξύφαινυλαλανίνη (κόκκινο) με εξαίρεση δύο περιοχές τους, τον βρόχο του αντικωδικονίου και το 3΄αμινοακύλo άκρο όπου φορτώνεται το αμινοξύ.

4. πολυπεπτίδιο (Α)Σχηματικό μοντέλο επιμηκυνόμενη πολυπεπτιδική αλυσίδα απακυλιωμένοtRNAμόλις απελευθερωμένο από τη θέση Ε κέντρο πεπτιδυλοτρανσφεράσης μεγάληυπομονάδα μικρήυπομονάδα (Β)Υπολογιστικό μοντέλο κέντρο αποκωδικοποίησης μετατόπιση ριβοσωματίου θέσηΡ θέσηΕ θέσηΑ Θέσεις αλληλεπιδράσεων με καίριο ρόλο κατά τη φάση της επιμήκυνσης στη μετάφραση. (Α) Σχηματικό μοντέλο του ριβοσώματοςκατά την επίμηκυνση της μετάφρασης. (Β) Υπολογιστικό μοντέλο της τρισδιάστατης δομής του ριβοσώματοςστο οποίο συμπεριλαμβάνονται το μεταφραζόμενο μόριο mRNA, τα αναγκαία μόρια tRNA και η επιμηκυνόμενη πολυπεπτιδική αλυσίδα καθώς αναδύεται από τη μεγάλη ριβοσωματικήυπομονάδα. μεγάληυπομονάδα μικρήυπομονάδα Οι περιοχές για την πρόσδεση μορίων RNA στο βακτηριακόριβόσωμα. περιοχή πρόσδεσης του mRNA

5. επιμηκυνόμενη πολυπεπτιδική αλυσίδα 1ο βήμα νεοεισαχθέν tRNA 1ο βήμα νεοεισαχθέν tRNA εξερχόμενο tRNA θέσηΑ εξερχόμενο tRNA θέσηΕ θέσηΡ Η μεταφραστική επιμήκυνση 3ο βήμα 2ο βήμα 4ο βήμα

6. θέση Ε θέση Ρ θέση Α διορθωτικός έλεγχος κάθε αταίριαστοtRNAαποβάλλεται διορθωτικός έλεγχος κάθε αταίριαστοtRNAαποβάλλεται Η μεταφραστική επιμήκυνση με λεπτομέρεια.

7. EF-Tu EF-G·GTP απακυλιωμένοtRNA Οι τρισδιάστατες δομές των αλληλεπιδρώντων συστατικών κατά τη μεταφραστική επιμήκυνση. Σημείωσε την ομοιότητα ως προς το σχήμα και τον προσανατολισμό μεταξύ του αμινοακύλο-tRNAμε τον συνδεδεμένο σε αυτό παράγοντα EF-Tu,όταν προσδένονται στη θέση Α, και του παράγοντα EF-G,όταν ο τελευταίος προσδένεται επίσης στην ίδια θέση. αμινοακύλο-tRNA·EF-Tu EF-G·GDP

8. παράγοντες έναρξης + GTP Met·tRNAi υπομονάδα 40 S μικρή υπομονάδα(30S) παράγοντες έναρξης μικρή υπομονάδα(40S) & συστατικά της έναρξης IF2·fMet·tRNAi IF3 σύμπλοκο έναρξης 30S μεγάλη υπομονάδα(60S) μεγάλη υπομονάδα(50S) παράγοντες έναρξης σύμπλοκο έναρξης 80S IF1 + IF2 σύμπλοκο έναρξης 70S Μεταφραστική έναρξη στους ευκαρυώτες. Το σύμπλοκο έναρξης σχηματίζεται στο 5΄άκρο του mRNA,το οποίο στη συνέχεια «σαρώνει» με κατεύθυνση 3΄ αναζητώντας κωδικόνιο έναρξης. Αφού αναγνωρίσει το κωδικόνιο έναρξης, τότε πυροδοτείται η συγκρότηση του πλήρους ριβοσώματος και απομακρύνονται οι παράγοντες έναρξης (δεν δείχνονται εδώ). Από την υδρόλυση του ΑΤΡ παρέχεται ενέργεια αναγκαία για τη διεργασία της σάρωσης. Μεταφραστική έναρξη στους προκαρυώτες. Οι παράγοντες έναρξης επικουρούν τη συναρμολόγηση του ριβοσώματος στη θέση της μεταφραστικής έναρξης, και ακολούθως απομακρύνονται πριν από την μετάφραση.

9. διάσπαση του πεπτιδυλο-tRNA Λήξη της μετάφρασης. Η μετάφραση τερματίζεται όταν ένας παράγοντας απελευθέρωσης (RF1) εισέλθει στη θέση Α της μικρής υπομονάδας και αναγνωρίσει το κωδικόνιο λήξης. Τότε ένα μόριο νερού εισέρχεται στο κέντρο της πεπτιδυλοτρανσφεράσης, και οδηγεί στην απελευθέρωση του πολυπεπτιδίου από το τελευταίο tRNAστη θέση Ρ· μέσω μιας σειράς αντιδράσεων κατά τις οποίες απαιτούνται πρόσθετες πρωτεΐνες και υδρόλυση GTP, οι ριβοσωματικέςυπομονάδες αποχωρίζονται, και η μικρή υπομονάδα είναι πλέον έτοιμη να σχηματίσει ένα νέο σύμπλοκο έναρξης.

10. βρόχος αντικωδικονίου στο μόριο του tRNA Αντικωδικόνιο θέση αστάθειας G 3΄ 5΄ A G G U C C/U 5΄ Κωδικόνιο 3΄ Η αστάθεια/ταλάντευση (wobble).Στην 3η θέση του αντικωδικονίου, η G μπορεί να καταλάβει μία από τις δύο θέσεις αστάθειας, και έτσι καθίσταται ικανή να ζευγαρώσει είτε με την C είτε με την U. Αυτό σημαίνει ότι σε ένα μόριο mRNA μπορούν να αναγνωρίζονται 2 κωδικόνιαταUCU και UCC, από το αυτό μόριο tRNAτο οποίο φέρει συγκεκριμένο αμινοξύ (στο εδώ παράδειγμα, τη σερίνη).