1 / 22

Transferència gènica horitzontal

TRANSFERÈNCIA GÈNICA HORITZONTAL EN EUCARIOTES. Transferència gènica horitzontal. TGH/L: fenòmen omnipresent. Es defineix com el moviment o transferència d’informació genètica a organismes que no són els propis descendents . Teoria de l’endosimbiosi. HGT: com es produeix ?.

mare
Download Presentation

Transferència gènica horitzontal

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. TRANSFERÈNCIAGÈNICAHORITZONTAL EN EUCARIOTES Transferènciagènicahoritzontal

  2. TGH/L: fenòmenomnipresent Es defineixcom el moviment o transferènciad’informaciógenètica a organismes que no sónels propis descendents.

  3. Teoria de l’endosimbiosi

  4. HGT: com es produeix?

  5. HGT: comhodetectem?  Incongruènciesfilogenètiques

  6. HGT: problemes per a detectar-la • Pèrduagènica diferencial • Artefactes en la reconstrucciófilogenètica • Degeneració (milionsd’anys) • Poca diferència si es tracta de llinatges moltemparentats. • Duplicaciógènica ancestral…

  7. Destí HGT • No tots els gens/rutes metabòliques tenen la mateixa probabilitat de ser transmesos. • Alguns gens HGT tenen funcions clarament adaptatives. • ... la majoria semblen “transitoris”: el seu avantatge va lligat a un hàbitat particular, no són adaptatius ad aeternum.

  8. Tipus HGT • Tenimdiversespossibilitats…

  9. Tipus HGT • Procariotes  Eucariotes. • Eucariotes  Eucariotes (infraestimada?) • Procariotes  orgànuls (molt estranya). • Nucli  Orgànuls • Orgànul  Orgànul (gènere d’escarabats mexicans) • Eucariotes  Procariotes (menys comú que vice-versa: N molt més grans en procariotes, altres mecanismes, poc “interès” pels gens eucariòtics?

  10. Procariotes Eucariotes • És la més comuna (procariotes N moltgrans). • Factorsdecisiuperquè es produeixi: “contacte”: connexió “íntima” amb el sistema vascular de l’hoste, engoliment i digestió… • Exemples: Saccharomycescerevisiae. Gen DHODadquirit de Lactobacilliales(pèrdua del DHOD nadiu) i DBS1delsα-proteobacteris.

  11. Tipus HGT: Eucariota  Eucariota • Entre diferents llinatges de fongs (factors de virulència, MAT loci al gènere Stemphylium). • Entre diferents patògens de plantes (fongs filamentosos del fílum ascomicets  oomicets). • Molts d’aquests gens provenen de procariotes: detecció més fàcil.

  12. Tipus HGT • Orgànul  Orgànul: Citocrom b de mitocondris entre 3 espècies d’escarabats mexicans. • Plastidis: cap cas documentat d’incorporació de gens nuclears (compactació genoma). • Mitocondris: múltiples gens provinents del nucli. • Quimeres (gen nadiu + gen d’orígenforani recombinació  gen amb nova funció!). • No- funcionals?

  13. Transposons: cas especial d’HGT • Degut a la sevanaturalesa, HGTforçamés probable que la dels gens convencionals. • Semblaméscomú entre llinatgesemparentats. • Correlació entre HGT de transposons i HGTgènica?

  14. HGT: reconstrucció filogenètica

  15. Exemples HGT • Cromosoma 19 d’Ostreococcus tauri: no s’assembla al d’altres algues verdes. Sembla derivat completament d’un altre llinatge!

  16. Casos HGT • Coanoflagel·lats (Monosigabrevicollis): Més de 1.000 gens provinents d’algues, alguns dels quals van passar a animals.

  17. Exemples HGT Elysiachlorotica Cargols marins “fotosintètics”: Aquests organismes adquireixen els cloroplasts d’una espècie d’algues de la qual s’alimenten (Vaucherialitorea) i poden fer la fotosíntesi amb l’energia solar: molt important en períodes d’escassetat, perquè poden emmagatzemen els sucres. Elysia no pot fabricar els cloroplasts per sí sol, però tot indica que la seva capacitat de mantenir-los depèn d’alguns gens (psbO) que haurien passat al nucli per HGT, originalment provinents d’aquestes algues.

  18. Bibliografia • Schwartz, J. A., Curtis, N. E., & Pierce, S. K. (2010). Usingalgaltranscriptomesequencestoidentifytransferred genes in the sea slug, Elysiachlorotica. EvolutionaryBiology, 37(1), 29-37. • Hall, C., Brachat, S., & Dietrich, F. S. (2005). Contribution of horizontal gene transfer to the evolution of Saccharomycescerevisiae. Eukaryotic Cell, 4(6), 1102-1115. • Bergthorsson, U., Adams, K. L., Thomason, B., & Palmer, J. D. (2003). Widespread horizontal transfer of mitochondrial genes in flowering plants. Nature, 424(6945), 197-201. • Nedelcu, A. M., Miles, I. H., Fagir, A. M., & Karol, K. (2008). Adaptiveeukaryote‐to‐eukaryote lateral gene transfer: stress‐related genes of algalorigin in theclosestunicellularrelatives of animals. Journal of evolutionarybiology, 21(6), 1852-1860. • Derelle, E., Ferraz, C., Rombauts, S., Rouzé, P., Worden, A. Z., Robbens, S., ... & Moreau, H. (2006). Genomeanalysis of thesmallest free-living eukaryoteOstreococcustauriunveilsmanyuniquefeatures. Proceedings of theNationalAcademy of Sciences, 103(31), 11647-11652. • Patron, N. J., Rogers, M. B., & Keeling, P. J. (2004). Gene replacement of fructose-1, 6-bisphosphatealdolasesupportsthehypothesis of a single photosyntheticancestor of chromalveolates. EukaryoticCell, 3(5), 1169-1175. • Andersson, J. O., Sarchfield, S. W., & Roger, A. J. (2005). Gene transfers from nanoarchaeota to an ancestor of diplomonads and parabasalids. Molecular biology and evolution, 22(1), 85-90. • Richards, T. A., Dacks, J. B., Jenkinson, J. M., Thornton, C. R., & Talbot, N. J. (2006). Evolution of filamentousplantpathogens: gene exchangeacrosseukaryotickingdoms. CurrentBiology, 16(18), 1857-1864.

More Related