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新药研发技术前沿. 彭雷 08.12. 简介. 一、研发大体流程 二、新药筛选 三、新药合成 四、新药检测 五、其他. 多标准先导化合物优化过程示例。. 每个分子需要满足一套标准，研发小组决定进行测试的标准的顺序，这就需要有一个标准筛选策略。 如果一个分子满足了标准中定义的阶段模型，便进一步检测该分子的其他属性。如果它没有达到预期，需要解释结果，并重新设计新的分子。 一个分子只有满足了所有可能的标准才能成为候选分子，并对其开始临床前开发阶段。. 药物研发程序及各阶段大约时间. 迭代结构活性关系检测示意图。假说驱动的新药研究通常是根据这一周期性模式来执行的。.
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新药研发技术前沿 彭雷 08.12
简介 • 一、研发大体流程 • 二、新药筛选 • 三、新药合成 • 四、新药检测 • 五、其他
每个分子需要满足一套标准，研发小组决定进行测试的标准的顺序，这就需要有一个标准筛选策略。每个分子需要满足一套标准，研发小组决定进行测试的标准的顺序，这就需要有一个标准筛选策略。 • 如果一个分子满足了标准中定义的阶段模型，便进一步检测该分子的其他属性。如果它没有达到预期，需要解释结果，并重新设计新的分子。 • 一个分子只有满足了所有可能的标准才能成为候选分子，并对其开始临床前开发阶段。 • 药物研发程序及各阶段大约时间
迭代结构活性关系检测示意图。假说驱动的新药研究通常是根据这一周期性模式来执行的。迭代结构活性关系检测示意图。假说驱动的新药研究通常是根据这一周期性模式来执行的。
筛选 • 筛选模型 • 筛选机器人 • 筛选的效率并不高。 • 最近桑迪亚仅仅用了2.5年他们就得到了4 个（可能是6个 ）候选化合物。相比一般的筛选手段，研究效率和结果是提高了10倍。
以基因为靶标筛选药物，各阶段的筛选结果以几何级数的形式递减。以基因为靶标筛选药物，各阶段的筛选结果以几何级数的形式递减。
目前缺点 • 化合物库的纯度并不高，约平均大于85%。 • 筛选模型有一定的误差，需多种模型相结合。 • 目前的高通量筛选（HTS）方式多利用低分子量（LMW）化合物的大文库，通过设计反映化合物与治疗目标蛋白之间的亲和力的抑制性分析来进行筛选。这些分析检测根据阴性结果来检测hits（活性化合物），很容易产生的假阳性结果。例如，化合物可能直接干扰标记系统，或通过非特异的蛋白结合来发生反应。因此，通过高通量筛选分析鉴定出的大部分hits都证实是假阳性，而不能选择性地与目标结合位点结合。
应对策略 • 在过去几年中筛选策略发生变化，重点是关注数据的质量和相关性。命中率通常介于0.1-5 ％由于截止参数设置和动态范围的分析。多数化合物检测限在1-50微摩尔。 • 利用结构信息进行虚拟筛选和设计定向文库有助于改善筛选过程。那些可在筛选早期提供全面、高质量的结合和选择性数据的筛选方法将大大提高筛选效率。
全细胞靶点筛选抗生素新药的方法 • 全细胞的检测的优点是，只有选择的化合物，能够穿透细胞和细胞内达到目标。尽管这一优势，大部分存在于整个细胞的筛选显示很低的目标选择性。
Biacore系统以无标记的检测方式来实时监测分子间的相互作用。独特的平行处理能力和灵活性让Biacore A100成为挑选能与复杂的蛋白靶点选择性结合的化合物的有力工具。 – 根据选择性结合来筛选化合物– 无标记、实时筛选虚拟活性化合物（virtual hits）和片段文库化合物 利用蛋白质阵列对复杂的蛋白靶点进行快速、高信息量的化合物分析– 每天的处理速度相当于3800个相互作用– 与HTS分析相比蛋白靶点的消耗量低 可从蛋白质集合(Panels)的平行分析获得独特的化合物筛选标准– 可同时分析与野生型和突变型蛋白靶点的结合特性、以及与特定靶点蛋白 亚基和对照蛋白的结合特性– 可鉴别出高度选择性结合特定靶点的化合物– 可最终鉴定出非特异性的蛋白结合物 更快速、信息更丰富的化合物筛选，最大程度降低靶点相关的假象风险 可实现项目中过去HTS无法进行的重要进程– 可在生物分析中验证具激动剂活性的化合物
合成 • 近年来，化学合成引进了一些新技术。其中最重要技术上的改进，最大的影响已经得到了聚合物辅助液相合成（ PASPS ） ， 微波辅助有机合成（ MAOS ） ，以及连续流动化学合成过程。
聚合物辅助液相合成（ PASPS ） • 最显着的改善，当PASPS比较传统的合成，是这项工作的后续行动大大简化，并减少到简单过滤。使用一个大的超过试剂（常常是必要的驱动反应完成） ，然后有可能，而不需要额外的净化步骤。有毒，有害或危险试剂及其副产品可以固定，因此不能释放到解决方案，从而改善他们的普遍接受和安全性。由于网站孤立试剂对树脂珠，物种是不相容的解决方案可能是一起使用，以实现一锅变革是不可能的条件下传统的同质性。
微波辅助有机合成（ MAOS ） • MAOS是主要基于微波介质的热效应（通过偶极极化和离子导电）进行材料的高效加热，有以下优点： • 更高的反应温度（结合微波和密封容器）; • 缩短了反应时间，更高的产量和清洁性; • 由于容器密封，可以使用低沸点溶剂; • 适用于强烈吸收微波的金属催化剂; • 更多的重复性实验条件的精确控制温度和压力的特性。
流动化学合成 • 流动化学又被称为微化学或连续流动化学, 他的出现为化学研究和发展提供了一个崭新的,高产的并且快速的手段. • 由于采用的是微米尺寸的混合器, 流动化学合成是非常理想的纳米颗粒合成技术. • 流动化学合成的优势: • 系统具有对反应条件优异的控制功能.如时间,温度,试剂,混合等条件进行控制.并且使一些放热反应在无冷却的条件下进行. • 增加反应速度:提高系统的压力(300 psi)和加热可以使反应速度比回流反应快几百倍. • 可以达到微波的反应速度, 但又克服了微波反应的放大问题. • 合成和分析同时进行: 反应通过取样器和稀释器快速流动到HPLC进行检测. • 自动化:反应和分析通过软件来自动控制进行。
流动合成化学应用 • ThalesNano公司从最初推出H-Cube产品到现在的三年内，世界排名前20名的制药公司均已经引进并应用了这项最新的技术。 H-Cube是一款独立使用的台式连续流动加氢化学反应装置，独特地将连续流化学技术，安全的内置氢气发生器和可更换的催化剂柱系统完美结合。
生物合成 • 前一段时间美国基因学家克雷格·文特尔即将宣布，他的研究小组已经合成人造染色体，地球上即将首次诞生“人造生命”。 • 他们从生殖支原体内提取整组基因，随后经过一系列技术，建立新的染色体。这个染色体有381个基因，包括58万对基因代码。随后，科学家们将它嵌入已经被剔除了遗传密码的细菌细胞之中。按照实验计划，最终这个染色体将控制这个细胞并变成一个新的生命形式。
生物反应器 • 更为实用的是生物反应器。如我国科学家提出的乳腺反应器。 • 最近，核糖体人工合成又告成功。 • “信使RNA”把DNA的遗传指令传输给细胞的核糖体，核糖体根据指示，制造出符合要求的蛋白质。哈佛大学医学院的遗传学教授乔治·丘奇带领的科研组并不是寻找在试管里制造生命的方法，而是寻找在实验室器皿里制造设计蛋白(designer protein)的方法。他说：“如果你要制造一种跟现在的生命一样的合成生命，那么你必须获得这种生物机器（biological machine）。”而且这项发现还具有非常重要的工业应用价值，尤其是制药业和制造自然界没有的蛋白质的产业。
组合生物转化技术 • 组合生物转化技术是发现微生物新药的有效途径组合生物转化是指利用一种以上的具有特殊转化功能的微生物或酶，对同一个母体化合物进行组合转化，以得到化学结构的多样性。它是从已知化合物中寻找新型衍生物，这是从简单化合物制备复杂化合物的有效手段。已有研究表明：用3种不同的酶对一个腺苷分子进行两轮催化，可得到92种各种类型的衍生物；用7种不同的酶对岩白菜内酯分子进行两轮催化，可得到600种各种类型的衍生物；用3种不同的酶对BOD(一种重要的化合物)分子进行三轮催化，可得到l222种不同类型的衍生物。通过组合生物转化技术，构建某种具有潜在成为药物分子化合物库，这是一种发现新药的有效方法和途径。
