Bibliografické databáze Odborné informace na Internetu EBM – Evidence Based Medicine

1. Bibliografické databázeOdborné informace na InternetuEBM – Evidence Based Medicine MUDr. Jitka Feberová Ústav lékařské informatiky UK 2.LF Kasal P. a kol.: Lékařská informatika. Praha, Karolinum, 1998

2. Bibliografické databáze FEBEROVÁ Jitka. Jak na Medline efektivně.1.vyd,Praha 2004:Triton.ISBN 8072545027

3. Co jsou bibliografické databáze? • Sekundární informační prameny umožňují prohledávat databázi článků zařazených časopisů a nalézt v ní články obsahující hledanou informaci. • Databázejednotlivé články jsou rozepisovány do tzv. polí:TI – název článkuAU – autorDP – datum publikace, atd.

4. Jak vypadají pole databáze? Pole databáze odpovídají zhruba bibliografickému záznamu

5. Bibliografické databáze z oblasti biomedicíny • obecné • specializované

6. Obecné biomedicínské databáze Medline • Vytváří ji Národní lékařská knihovna v Bethesdě. • Zpracovává především anglicky psanou primární odbornou literaturu. • Zahrnuje cca 4800 časopisů. • Přístupná zdarma na: www.pubmed.com

7. Obecné biomedicínské databáze Embase • Vydává nakladatelství Elsevier Science • Akcentuje více evropské odborné časopisy • Zahrnuje cca 4000 časopisů. • Je přístupná zdarma ze všech počítačů v síti Univerzity Karlovy ze stránek http://bi.cuni.cz, jinak je přístup placený.

8. Brána k informacím http://bi.cuni.cz

9. Obecné biomedicínské databáze BMČ– Bibliographia Medica Čechoslovaca • Česká bibliografická databáze, kterou vytváří Národní lékařská knihovna v Praze. • Je přístupná zdarma ze stránek http://www.nlk.anet.cz/ • Pro indexaci článků používá stejný slovník jako Medline – MeSH (viz dále), který byl v NLK přeložen do češtiny.

10. Specializované biomedicínské databáze JCR – Journal of Citation Report • Stanovuje u časopisů impakt faktor - poměrné číslo udávající citovanost článků daného časopisu v jiných časopisech. • Zahrnuje cca 8400 časopisů • Je přístupná zdarma ze všech počítačů v síti Univerzity Karlovy ze stránek http://bi.cuni.cz, jinak je přístup placený.

11. Jak se stanovuje impakt faktor?

12. České časopisy s impakt faktorem Abbreviated Journal Title ISSN Impact Factor ACTA VET BRNO 0001-7213  0.370 ACTA VIROL 0001-723X  0.660 CERAM-SILIKATY 0862-5468  0.354 CESK SLOV NEUROL N 1210-7859  0.052 CHEM LISTY 0009-2770  0.336 COLLECT CZECH CHEM C0010-0765  0.848 CZECH J ANIM SCI 1212-1819  0.187 CZECH J PHYS 0011-4626  0.311 CZECH MATH J 0011-4642  0.120 EUR J ENTOMOL 1210-5759  0.520 FOLIA BIOL-PRAGUE 0015-5500  0.615 FOLIA GEOBOT 0015-5551  0.564 FOLIA MICROBIOL 0015-5632  0.979 FOLIA PARASIT 0015-5683  0.515 FOLIA ZOOL 0139-7893  0.234 KYBERNETIKA 0023-5954  0.341 LISTY CUKROV 1210-3306  0.042 PHOTOSYNTHETICA 0300-3604  0.773 PHYSIOL RES 0862-8408  0.984 ROST VYROBA 0370-663X  0.333 STUD GEOPHYS GEOD 0039-3169  0.571 VET MED-CZECH 0375-8427  0.204

13. Specializované biomedicínské databáze Web of Science • Informace o tom kolikrát byl daný článek citován jinýmiautory, kolik a které články sám cituje. • Zahrnuje cca 3500 časopisů, citace knih, disertací atd. • Je přístupná zdarma ze všech počítačů v síti Univerzity Karlovy ze stránek http://bi.cuni.cz , jinak je přístup placený.

14. Web of Science

15. Specializované biomedicínské databáze TOXNET • Vytváří Národní lékařská knihovna v Bethesdě. Zpracovává oblast toxikologie. • Je přístupná zdarma na adrese: http://toxnet.nlm.nih.gov/

16. Souborné katalogy http://bi.cuni.cz

17. Souborné katalogy http://bi.cuni.cz

18. Souborné katalogy http://bi.cuni.cz společný projekt Národní knihovny ČR a UK

19. Medline - charakteristika Medline • Vznikl v roce 1966. • Asi 86% citací tvoří anglicky publikované články. • Přibližně 76% citací obsahuje abstrakt. • Ročně přibývá kolem 400 000 citací. • V současné době cca 12 milionů záznamů. • K idexaci klíčových slov používá slovník MeSH (Medical Subject Headings)

20. MeSH • Je elektronický slovník odborných biomedicínských pojmů. • Používá se ke standardizaci klíčových slov. Princip standardizace spočívá v tom, že existuje-li pro pojmenování jedné problematiky více názvů - synonym, je vybráno jedno z nich jako zástupce pro celou skupinu a zařazeno mezi tzv. standardní deskriptory.

21. Standardizace klíčových slov v MeSH Primární dokumentMedline klíčová slova autora– možná synonymaklíčové slovo - zástupce pro skupinu (standardní deskriptor) louis bar syndrom bar syndrome ataxia teleangiectaticaataxia teleangiectatica louis bar disease ataxia cerebellaris teleangiectasis

22. Standardní deskriptory v poli MeSH

23. Podhesla Ke standardním deskriptorům jsou přiřazovány termíny které pojednávají různé obecné aspekty dané problematiky (vedlejší účinky, terapie, mortalita atd.).

24. Výsledek vyhledávaní v Medline • Výpis z databáze ve formě tzv. bibliografické citace. • Bibliografická citace obsahuje údaje, podle kterých lze článek jednoznačně identifikovat (název článku, jméno autora, název časopisu, ISSN atd.).

25. Jak vyhledaný článek získat? • V knihovně • Na Internetu (ve formě fulltextu - elektronicky dostupný plný text článku) Projekt MedGate – jednotná vstupní brána k informačním zdrojům v oboru a návazné služby (DDS – dodávání dokumentů, MVS – meziknihovní výpůjční služba, MMVS – meziknihovní výpujční služba),8 spolupracujících institucí (NLK, IPVZ, IKEM, Ústav hematologie a krevní transfúze, 1.LF, 2. LF, LF Hradec Králové, LF Univerzity Palackého Olomouc)

26. Fulltexty v Medline • Pomocí volby Links to free fulltext v Limitech

27. Přístup k předplaceným časopisům • Pro zaměstnance a studenty Univerzity Karlovy najdete časopisy předplacené touto organizací na stránkách http://bi.cuni.cz

28. Přístup k předplaceným časopisům

29. Fulltexty na Internetu • Na Internetu naleznete seznamy časopisů s dostupným fulltextem na různých odborných serverech, např. na stránkách Karolinska Instituted : http://kib.ki.se/tools/journals/index_en.html.

30. Fulltexty v Karolinska Instituted

31. Schéma vyhledávání • Definice problému, volba klíčových slov, překlad do angličtiny • Vyhledání standardních deskriptorů pro zvolená klíčová slovaveslovníku MeSH • Zpřesnění standardních deskriptorů pomocí podhesel • Kombinace standardních deskriptorů a podhesel pomocí operátorů do dotazu • Prohledání databáze • Zpřesnění pomocí limitů • Práce s vyhledanými citacemi (třídění, ukládání, tisk atd.) Jak se vyhledává v Medline?

32. Příklad • Vliv beta karotenu na mortalitu u nádorů plic kuřáků, mužů, články zařazené do databáze v posledních 5ti letech, psané anglicky s abstraktem.

33. Čím začít hledání? • Zvolíme si klíčová slova, která popisují tento problém a přeložíme je volně do angličtiny, slovník MeSH nám pomůže s přesným vymezením termínů pro vyhledávání Př. Předpokládaná klíčová slova (volný překlad) beta carotene tumor pulmon (nejsme-li si jisti v koncovce, zapíšeme pouze část slova) smoking

34. Definování standardních deskriptorů • V MeSH najdeme standardní deskriptory, které popisují vyhledávanou tématiku. • Elektronickou verzi slovníku MeSH najdete u všech variant vstupu do databáze Medline pod různými názvy (PubMed, Brána k informacím Univerzity Karlovy, databázová centra např. Ovid atd.). Hledejte MeSH Database, MeSH, MeSH Browser, Thesaurus nebo Thesaurus MeSH).

35. Ověřování znění standardních deskriptorů

36. Ověřování znění standardních deskriptorů

37. Výběr podhesla

38. Kombinace pomocí operátorů • AND - vyhledá citace, které obsahují oba hledané výrazy současně • OR - vyhledá citace, které obsahují kterýkoli z uvedených výrazů • NOT - vyloučí z výběru citace obsahující nechtěný výraz

39. Kombinace do dotazu

40. Kombinace do dotazu

41. Prohledání databáze

42. Změna zobrazení

43. Zpřesnění dotazu pomocí limitů

44. Nastavení limitů pro zadaný příklad

45. Práce s vyhledanými citacemi • Send to • Text - vytvoří jednoduchou textovou formu (pro tištění z prostředí PubMedu) • File – umožní uložení na disk • Clipboard – přesune vybrané citace do schránky PubMedu • E-mail – umožní odeslat si vybrané citace do pošty • Order – možnost objednání vybraných článků