PERFILES DE EXPRESIÓN GÉNICA Y DIAGNÓSTICO / PRONÓSTICO EN CÁNCER

1. PERFILES DE EXPRESIÓN GÉNICA Y DIAGNÓSTICO / PRONÓSTICO EN CÁNCER 17 DE JUNIO MONTSERRAT SERÉS ROIG 2013 GENÓMICA Y PROTEÓMICA CURSO 2012-2013

2. DEFINICIONES • EXPRESIÓN GÉNICA : proceso por el cual todos los organismos procariotas y eucariotas transforman la información por los ácidos nucleicos ( DNA ) en las proteinas necesarias para su desarollo y funcionamiento . • PERFIL DE EXPRESIÓN GÉNICA : medida de expresión de varios genes en una célula en un momento dado.

4. METODOS DE DETECCIÓN GEN PORTERO : • Secuencia conocida . • Caraterísticas visulamente identificables . • Luminiscentes / fluorecentes . NOTHERN BLOT : • Sonda radioactiva-mRNA • Electroforesis en gel • Separación de fragmentos según su tamaño .

5. WESTERN BLOT : • Detectar proteinas específicas . • Electroforesis en gel . • Unión mediante Ag-Ac . HIBRIDACIÓN IN SITU : • Capacidad de AANN de hibridación . • Complementariedad • Sonda marcada con isotopo radioactivo con secuencia de ADN o ARN .

6. PCR : • gran número de copias . • Fragmento ADN en particular .

7. MICROARRAYS ( chip de ADN ) • Superficie sólida a la cual se une una colección de ADN • Medir el nivel de hibridación entre sonda y molécula diana (target ) mediante fluorescencia .

8. APLICACIONES • Estudio de expresión de genes . • Clasificar enfermedades • Identificar genes específicos de ciertas patologias . • Predicción de respuesta a un tratamiento . • Detección de polimorfismo de un gen ( SNP’s).

9. DIAGNÓSTICO/ PRONÓSTICO EN CÁNCER • Pulmon / hígado / mama / próstata / digestivos / hematológicos / pancreas etc . • Clasificación de subtipos . • Diagnóstico . • Pronóstico : - respuesta a un tratamiento - supervivencia del paciente . • Buscar nuevas moléculas diana ( TARGETS ) .

10. CÁNCER / GENÉTICA • Visualizar el cáncer como una enfermedad genética . (mutaciones heredables ) • Ciertos genes se convierten en oncogenes causantes de cáncer . • Otros genes , supresores , previenen el crecimiento incontrolado de células ; si son anulados provocan aparición de cáncer . • Las mutaciones aisladas , generalmente no son suficientes para causar cáncer , sino que producen cambios que predisponen a las células al crecimiento maligno .

11. EL CANCER ES UN PROCESO DE MUCHAS ETAPAS

12. CLASIFICIÓN MOLECULAR EN EL CÁNCER DE MAMA • Clasificado en 4 subtipos : luminal A / luminal B / Her2neu / Basal Like . • Estudio descriptivo transversal en 399 pacientes . • Seguimiento en 5 años . • Se mide : - EFECTIVIDAD DEL TRATAMIENTO - PRONÓSTICO - CLASIFICACIÓN GENÉTICA - RIESGO • DIAGNÓSTICO INICIAL : mediante biopsias guiadas por ultrasonidos .

13. CÁNCER DE MAMA DESDE EL PUNTO DE VISTA INMUNOHISTOQUÍMICO

14. DIAGNÓSTICO GENÉTICO MICROARRAYS : • Identificar la expresión génica . • Precisión en el diagnóstico . • Un pronóstico más preciso . • Selectividad en el tratamiento con QT : • menos morbi/mortalidad inducida por el tratamiento QT. • menos coste • más índice de curación

16. GENÉTICA EN CÁNCER DE MAMA • De los 4 subtipos luminal A / B son menos agresivos respecto a los otros 2 . • Diagnóstico subclinico mayor en luminal A / B. • Menor / mayor agresividad . • Selectividad del tratamiento . • Posibilidad de realización de un ONCOTYPE

17. TCGA( The Cancer Genome Atlas ) • Artículo publicado : « Endometrial cancer findings emerge from genome sequencing study « . • Publicación del análisis genético de 7 cánceres , entre ellos el endometrial . • Publicado en el New England Journal of Medecine . • Intenta caracterizar el análisis genómico de hasta 20 cánceres diferentes . • Gracias a la contribución de muchos pacientes en proporcionar sus datos clínicos

18. Cáncer de Endometrio • 4 subtipos . • Analizar similitudes con otros cánceres comunes (ovario , mama , colorectal ) . • Determinar que pacientes se benefician de un tratamiento más agresivo . • Es el 4° cancer más común en U.S en mujeres . • Clasificamos 2 tipos : • Endometrial : asociado a un exceso de estrógenos y obesidad . • Seroso : más común en mujeres en edad post menopáusica .

19. OBJETIVOS DEL ESTUDIO • Clasificar la mortalidad asociada segun el tipo de cáncer . • Adecuar un tratamiento agresivo a cada subtipo . • identificación de mutaciones : • Gen supresor TP53 • Extensión de «copy numbers « Que proporcinan mayor agresividad al tipo serosos.

20. Compartir características genéticas con otros tipos de cánceres : • Ovario seroso / basal-like mama / endometrio comparten similar « copy numbers « y mutación en el gen TP53 . • Menos frecuente la mutación en el gen PTEN • Endometrio- colorectal comparten la mutación en el gen POLE involucrado en la reparación del ADN .

21. CONCLUSIONES • TCGA permite conocer el perfil genético de ciertos cánceres . • Mayor efectividad en los tratamientos de ciertos cánceres con diferente perfil genético . • Asociación de anomalías genéticas entre cánceres . • Contribución pública del conocimiento de la genética de un cáncer para un mejor futuro en su manejo y tratamiento

22. BIBLIOGRAFIA • « Endometrial cancer findings emerge from genome sequencing study «. Broad Institute of MIT and Harvard .8 de mayo 2013 • Clasificación molecular del cáncer de mama y su correlación – J.Uribe , C. Herenandez, F.Menolascino . Rev Venez Oncol 2010;22(2):109-116. • Pubmed : perfiles de expresión génica en cáncer .

23. MUCHAS GRACIAS