slide1
Download
Skip this Video
Download Presentation
Προσδιορισμός γονοτύπων ατόμων σε περιοχές ‘γενετικών δεικτών’

Loading in 2 Seconds...

play fullscreen
1 / 23

Προσδιορισμός γονοτύπων ατόμων σε περιοχές ‘γενετικών δεικτών’ - PowerPoint PPT Presentation


  • 102 Views
  • Uploaded on

Προσδιορισμός γονοτύπων ατόμων σε περιοχές ‘γενετικών δεικτών’. ΓΕΝΕΤΙΚΟΙ ΧΑΡΤΕΣ ΧΡΩΜΟΣΩΜΑΤΩΝ. ΧΑΡΤΟΓΡΑΦΗΣΗ ΓΟΝΙΔΙΩΝ ΑΣΘΕΝΕΙΩΝ. ΣΥΓΚΡΙΣΗ / ΤΑΥΤΟΠΟΙΗΣΗ ΑΤΟΜΩΝ / ΠΛ H Θ Y ΣΜΩΝ. X αρακτηριστικά γενετικού δείκτη. Μοναδιαία θέση. A1. Μενδελική κληρονόμηση. A2. Πολυμορφισμός.

loader
I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.
capcha
Download Presentation

PowerPoint Slideshow about ' Προσδιορισμός γονοτύπων ατόμων σε περιοχές ‘γενετικών δεικτών’' - keely-doyle


An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Presentation Transcript
slide1

Προσδιορισμός γονοτύπων

ατόμων σε περιοχές ‘γενετικών δεικτών’

ΓΕΝΕΤΙΚΟΙ

ΧΑΡΤΕΣ

ΧΡΩΜΟΣΩΜΑΤΩΝ

ΧΑΡΤΟΓΡΑΦΗΣΗ

ΓΟΝΙΔΙΩΝ

ΑΣΘΕΝΕΙΩΝ

ΣΥΓΚΡΙΣΗ / ΤΑΥΤΟΠΟΙΗΣΗ

ΑΤΟΜΩΝ / ΠΛHΘYΣΜΩΝ

slide2

Xαρακτηριστικά γενετικού δείκτη

Μοναδιαία θέση

A1

Μενδελική κληρονόμηση

A2

Πολυμορφισμός

slide3

Μικροδορυφόροι

Mοναδιαία αλληλουχία

Eπανάληψη 1-5bp

Εκκινητές PCR

(GT)n

(GAC)n

(GATA)n

……

1/ 20 Kb στο ανθρώπινο γονιδίωμα

slide4

Παράδειγμα : μικροδορυφόρος Α

10

……………………………………ACAACCCTAC CTGGCACTGC ATTGTGGGCC GAAACTTCGG GAGTTATGTG ACACATGAAC

CCAAACACTT CATCTACTTC TACCTGGGTC GGGTGGCCAG TCTTCTGTTC AAATCTGGTT

AAGAGCATGG ACTGTGCCAA ACACCCAGTG ACCCATCCAA AAACAAGGAC TGCATCCAAA

GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT

TYCCAAATAC CAGAGACTGA ATCTTCAGCC TTGCTAAGGG AACACCTCGT TTGAATCTGT

TGTGTTGTGT ACAGGGCTTC ATTCTCTGTA CAAGTCTGTG GTTATAAAAT TAGTAAAACC

GCTTACATTT GTATTTATTT TCTAGTCCAT ACTTCTGTAC CCTGAGCGGC CGCTGGATCC………………….

Εκκινητής 1

Εκκινητής 2

PCR

slide5

Πειραματική διαδικασία

PCR

DNAs (1, 2, 3, 4)

PCR εκκινητές (σήμανση του εκκινητή 1 με 32P)

2

3

4

1

Marker

2

3

4

1

(bp)

5

120

116

4

4

Ηλεκτροφόρηση

112

4

108

6% πολυακρυλαμίδη

0.5x TBE,

7 M Urea

2

3

104

2

Αυτοραδιογραφία

1

100

slide6

6

5

4

3

2

1

1 / 5

6 / 6

2 / 2

2 / 4

2 / 3

1 / 6

1 / 2

3 / 4

ΑΝΑΛΥΣΗ ΓΟΝΟΤΥΠΩΝ

slide7

Συχνότητα αλληλομόρφου

Αριθμός εμφανίσεων

του αλληλομόρφου

Αριθμός χρωμοσωμάτων

που εξετάζονται

Ποσοστό ετεροζυγωτίας γενετικού δείκτη

Αριθμός ετερόζυγων ατόμων

%

Χ 100

Σύνολο ατόμων

slide8

6

5

4

3

2

1

1 / 5

6 / 6

2 / 2

2 / 4

2 / 3

1 / 6

1 / 2

3 / 4

Α Β Γ Δ Ε ΣΤ Ζ Η

Ποσοστό ετεροζυγωτίας:

Ετερόζυγα άτομα / σύνολο ατόμων =

6 / 8 = 75%

(άτομα μη συγγενικά !!)

slide9

‘Αξιολόγηση’ γενετικών δεικτών

Συχνότητες αλληλομόρφων

Γενετικός δείκτης 1

Αλληλόμορφα : 8

% ετεροζυγωτίας : 20%

Γενετικός δείκτης 2

Αλληλόμορφα : 8

% ετεροζυγωτίας : 85%

slide10

15

16

13

14

Οικογένεια CEPH # 104

1

2

11

7

8

9

10

12

3

4

5

6

D10S2314

DNA

slide11

13293.1

13292.2

13292.1

13293.2

1423.2

1350.1

1420.2

1331.1

1345.1

1346.2

1331.2

1345.2

1420.1

1350.2

1423.1

1346.1

1377.1

1334.2

1334.1

1375.1

1377.2

1408.1

1375.2

1408.2

35.1

23.2

28.2

35.2

28.1

21.1

45.2

37.1

23.1

45.1

21.2

17.1

37.2

17.2

2.2

Άσκηση 1η

Προσδιορισμός γονοτύπων σε δείγματα DNA από 40 μη συγγενικά άτομα

των οικογενειών CEPH,για τον μικροδορυφόρο D10S2314(*)

2.1

(*)D10S2314: επανάληψη του τετρανουκλεοτιδίου (GATA)

στο χρωμόσωμα 10

slide12

ΠΙΝΑΚΑΣ 1 :Αποτελέσματα ανάλυσης γονοτύπων για τον D10S2314

slide13

1o ZHTOYMENO

  • Mε βάση τον Πίνακα 1 να υπολογιστούν:
  • Οι συχνότητες των αλληλομόρφων και
  • το ποσοστό ετεροζυγωτίας του μικροδορυφόρου D10S2314
slide14

Άσκηση 2η

Προσδιορισμός γονοτύπων σε δείγματα DNA 61φοιτητών για τον μικροδορυφόρο DXS101

DΧS101: επανάληψη του τρινουκλεοτιδίου (CΤΤ) στο χρωμόσωμα Χ

slide15

1 2 3* 4 5 6 7 8 9 10 11 121415 16 1718192021222324 252627282930 31

13

12

11

10

9

m

m

m

m

m

8

7

6

5

4

3

2

Δείγματα Τετάρτης Τ

slide16

1 2 3 4* 5 6 7 8 9 10 11 1213141516 17181920 21 22 2324 25 26 27282930 32

13

12

11

10

9

8

7

6

m

m

5

m

m

m

4

3

2

1

Δείγματα Πέμπτης Π

slide17

ΠΙΝΑΚΑΣ 2 :Αποτελέσματα ανάλυσης γονοτύπων για τον μικροδορυφόρο DXS101

slide18

2o ZHTOYMENO

  • Mε βάση τον Πίνακα 2 να υπολογιστούν:
  • Οι συχνότητες των αλληλομόρφων και
  • το ποσοστό ετεροζυγωτίας του μικροδορυφόρου DXS101
slide19

Άσκηση 3η

Προσδιορισμός γονοτύπων σε δείγματα DNA 55 φοιτητών για τον μικροδορυφόρο DXS101

DΧS101: επανάληψη του τρινουκλεοτιδίου (CΤΤ) στο χρωμόσωμα Χ

slide20

10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36

14

12

13

11

10

m

9

m

m

m

m

8

7

4

3

2

1

Δείγματα Τετάρτης 2012

slide21

10 8* 9 11 12 13 1415 16 17 19 20 21 222324 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36

12

11

10

9

m

m

m

m

m

8

7

6

4

3

2

1

Δείγματα Πέμπτης 2012

slide22

ΠΙΝΑΚΑΣ 3 :Αποτελέσματα ανάλυσηςτων γονοτύπων σας για τον μικροδορυφόρο DXS101

slide23

3o ZHTOYMENO

Mε βάση τις εικόνες των πηκτωμάτων των δειγμάτων σας,

να καταγράψετε τους γονότυπους στον Πίνακα 3