mapas de ligamiento
Download
Skip this Video
Download Presentation
Mapas de ligamiento

Loading in 2 Seconds...

play fullscreen
1 / 15

Mapas de ligamiento - PowerPoint PPT Presentation


  • 109 Views
  • Uploaded on

Mapas de ligamiento. Luis Barboza Centro para investigaciones en Granos y Semillas (CIGRAS) Universidad de Costa Rica Julio 2009. Griffiths et al. 2008. Posiciones de genes en cromosomas. Mapas de ligamiento genético Hibridación in situ de influorescencia (FISH) Map based cloning.

loader
I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.
capcha
Download Presentation

PowerPoint Slideshow about ' Mapas de ligamiento' - judah


An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Presentation Transcript
mapas de ligamiento

Mapas de ligamiento

Luis Barboza

Centro para investigaciones en Granos y Semillas (CIGRAS)

Universidad de Costa Rica

Julio 2009

posiciones de genes en cromosomas

Griffiths et al. 2008

Posiciones de genes en cromosomas
  • Mapas de ligamiento genético
  • Hibridación in situ de influorescencia (FISH)
  • Map based cloning
meiosis
Meiosis

Griffiths et al. 2008

slide8

Mapas de ligamiento

  • No muy precisos debido a:
    • Dobles recombinantes
    • Interferencia
  • Funciones para corregir:
    • Haldane
    • Kosambi
pr ctica
Práctica
  • Lineas recombinantes
  • Arabidopsis thaliana
  • Poblaciones inmortales
slide10

P1

P2

Parental

x

Hybrid

F1

Het

F2 population

50 %

F2

F3

Single seed

25 %

descent

F4

12.5 %

procedure

6.3 %

F5

3.1 %

F6

1.6 %

F7

F8

0.8 %

Recombinant inbred line (RIL) population

Población:

RILs Ler×Cvi

(Recombinant inbred lines)

Parentales

Híbrido F1

Descendencia por semilla única

“Líneas

Inmortales”

Broman et al. (2005)

slide11

a b a a a a a b b b b b a a b b a b a b a b

a b a a a b b a a a a a b b a a a b b b a b

P P P P P R R R R R R R R R R R P P R P P R

Frecuencia de recombinación (FR):Núm. Recombinantes/ Total población

  • Ejercicio 1: CAPS (cleaved amplified polymorphic sequence)

FR:

(13/20)*100 = 65 cM

Conclusión:

GAPB A y GAPB B no se encuentran ligados

FR > 50 cM

chi cuadrado
Chi-cuadrado

Griffiths et al. 2008

chi cuadrado1
Chi-cuadrado

Hipótesis nula:

No hay ligamiento (loci son segregados independientemente)

Hipotesis alterna:

Sí hay ligamiento

Hipótesis nula es rechazada

Posiblemente hay ligamiento

Griffiths et al. 2008

ad