Axe Transversal Interactions Durables (ID)

1. Axe TransversalInteractions Durables (ID)

2. Une forte implication du laboratoire • 1/3 du potentiel de recherche • 1/4 des publications • 1/3 des programmes • Un ensemble de responsabilité au niveau national (prog. AFSSA, INSERM, GDR, GDRE, comité de pilotage et animation de groupes de réflexion du REID…) • Une offre d’enseignement importante et renouvelée (UE ID en M1, Epidémiologie en M2…) Répartie équitablement dans les trois départements

3. Des systèmes où la complexité est l’objet d’étude Deux organismes Un phénotype = une nouvelle unité fonctionnelle

4. symbiote Infra-population Transmission génome Co-évolution génome cellule individu population Hôte Environnement Epidémiologie (suivis de populations et modélisation) Analyse génomique (séquences et bio-info) Dynamique co-évolutive (Expérimentation, modélisation, Co-Phylogénie) Analyse fonctionnelle (quantification, post-génomique)

5. Infra-population Transmission génome génome cellule individu population Environnement • Identification • Structure du génome • Transposition • Transferts et pertes de gènes symbiote Co-évolution Hôte

6. symbiote Infra-population Transmission génome Co-évolution génome cellule individu population Hôte Environnement • Interactions moléculaires et cellulaires • Régulation (immunité…) • Mécanismes et expresssion du phénotype étendu

7. symbiote Infra-population Transmission génome Co-évolution génome cellule individu population Hôte Environnement • Epidémiologie • Conséquences du phénotype étendu • Comportements • Dynamique des populations

8. symbiote Infra-population Transmission génome Co-évolution génome cellule individu population Hôte Environnement • Gestion (relation médecine-écologie) • Transitions parasitisme-mutualisme

9. symbiote Infra-population Transmission génome Co-évolution génome cellule individu population Hôte Environnement • Adaptation locale (interaction GxGxE/spécialisation) • Émergence (perturbations environnementales / stochasticité)

10. symbiote Co-évolution Hôte symbiote Infra-population Infra-population Transmission Transmission génome génome Co-évolution génome génome cellule individu individu population population Hôte Environnement Les systèmes en poupées russes cellule

11. Hôte génome cellule individu population Co-évolution Infra-population Transmission génome génome cellule individu population Environnement Les cycles complexes et les réservoirs symbiote Co-évolution Hôte

12. Objectif de l’axe IDRenforcer les interactions • La démarche intégrative • Quels mécanismes sont en jeu ? • Sous quelles pressions de sélection se mettent-ils en place et quelles contraintes imposent-ils ? • La démarche comparative • Des modèles qui couvrent toute une gamme de type d’interactions

13. Mécanismes et conséquences génomiques Impact individuel et populationnel Le compartiment intra-hôte • Eléments transposables • HIV/FIV • Symbioses chez les insectes Régulation symbiote Infra-population Transmission génome Co-évolution génome cellule individu population Hôte Environnement

14. Transferts de gènes Mécanismes d’interactions Impact individuel et populationnel Le compartiment intra-hôte • - Listeria • Toxoplasmose • Pestivirose • Eléments transposables • HIV/FIV • Symbioses chez les insectes Compétition/coopération Favorisation symbiote Infra-communauté Transmission génome Co-évolution génome cellule individu population Hôte Environnement

15. Fonctionnement de l’axe ID • Journées thématiques intra-labo • Dynamique intra-hôte, multi-infections et ID • Comportement et ID • Biologie Moléculaire, Génomique et post-génomique des ID • … • Actions ciblées « P(ID)2 » (Programmes Interactions Durables Inter-Départements) • Financements • Co-directions • …