康健
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西文生物医学期刊数据库 PowerPoint PPT Presentation


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康健. 西文生物医学期刊数据库. 主讲: 潘晶亮. E-mail: [email protected] 主要内容. 第一节 PubMed和 fmjs 第二节 PubMed的字段和检索 第三节 fmjs 的使用 第四节 检索练习. 重点!. 进入途径(网址):. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed /. http://www.pubmed.gov. 二、 PubMed 概况.

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西文生物医学期刊数据库

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Presentation Transcript


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康健

西文生物医学期刊数据库

主讲:潘晶亮

E-mail:[email protected]


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主要内容

  • 第一节 PubMed和fmjs

  • 第二节 PubMed的字段和检索

  • 第三节 fmjs的使用

  • 第四节 检索练习

重点!


Pubmed

  • 进入途径(网址):

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

http://www.pubmed.gov

二、PubMed概况

  • PubMed是因特网上使用最广泛的免费MEDLINE(即Medline的网络版),是NLM所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于WEB的生物医学信息检索系统。


Pubmed1

二、PubMed概况

1.PubMed的数据来源

  • Medline:是PubMed的主体部分。记录末尾标识为[PubMed-indexed for MEDLINE]。

  • OldMedline:含1950~1965年期间发表的生物医学文献,记录中没有MeSH字段和摘要字段,记录标识[PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]。


1 pubmed

1.PubMed的数据来源

  • PreMedline(In-process citations):未经主题词标引,没有录入Medline中的数据,每天更新。标识为[PubMed- in process]。

  • Publisher-Supplied Citation:出版商直接提供的电子文献,标识为[PubMed-as supplied by publisher]。

  • 通过MeSH Database检索,查不到PreMedline和OldMedline中的记录


Pubmed2

二、PubMed概况

2.学科主题

  • PubMed内容涉及医学、护理学、口腔医学、兽医学、卫生保健系统、前临床医学、药理学、生理学、基础医学等领域。

    3.收录年限

  • PubMed收录了自1950年以来的包括MEDLINE在内的全世界80多个国家4800多种主要的生物医学期刊。到目前为止,PubMed数据库文献记录数已经超过了1900万条。其中部分文献提供免费的全文链接服务。


Pubmed3

二、PubMed概况

  • 特点:

    • 主题加工规范

    • 检索方式灵活多样

    • 免费提供题录和文摘

    • 提供与原文的网址链接(部分免费获取)

    • 提供检索词自动转换匹配

    • 操作简便、快捷


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检索词输入框

常用工具

使用帮助

更多服务

主页哦!


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FMJS介绍

FMJS简介:

<<西文生物医学期刊数据库>> Foreign Medical

Journal Full-Text Service,FMJS)为“十一五”国家

重点电子出版物规划项目,主管单位:中华人民共和国卫

生部;主办单位:中华医学会;由北京康健世讯公司承办

,中华医学电子音像出版社出版。

其国际标准连续出版物号为:ISSN 1673-8292;

国内统一刊号为:CN11-9281/R。


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FMJS的数据概述

收刊情况: 8250种(精准版)30000余种(普通版)

收录年限:1995年至今 更早

更新频率:周更新(逐步实现日更新),与印刷版和电子版期刊基本同步

文献总量:收录95年至今共约890多万篇并逐年增加

内容涵盖:基础医学、临床医学、内科学、外科学、预防医学、卫生学、医学 生物学、药学、药物化学、卫生保健及医学边缘学科等各领域。

使用对象:医院、疾控单位,科研院所和高校等


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整合资源

  • acs 美国化学学会(ACS)电子期刊

  • bmj BMJ Journals Collection

  • cbd Cambridge Journals Online剑桥期刊在线

  • cig CIG Media Group

  • emerald Emerald期刊数据库

  • informa Informa Healthcare 医学、生命科学、药学数据库

  • karger (卡尔格医学全文电子期刊)

  • nature Nature医学电子期刊全文数据库

  • oclc OCLC《美国联机图书馆系统》

  • OVID(Lippincott, Williams & Wilkins) 医学期刊数据库

  • OXFORD 牛津大学出版社电子期刊

  • PML(proquest) 《保健、医学与药学电子期刊全文数据库》

  • rsc 英国皇家化学学会(RSC)期刊及数据库

  • sage 电子期刊

  • science science电子期刊全文数据库

  • SDOS ScienceDirect Online 《Elsevier电子期刊全文数据库》

  • SPRINGER SPRINGER数据库

  • TAYLOR Taylor & Francis 医学和生命科学数据库

  • THIEME Thieme化学与药学电子期刊

  • WILEY John Wiley 电子期刊全文数据库

  • EBSCO数据库


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FMJS系统功能

A、期刊资源:

  • 1、Medline期刊

  • 2、临床核心期刊

  • 3、SCI期刊

  • 4、PubMed OA期刊

  • 5、非PubMed OA期刊


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第二节 检索

  • PubMed中供显示和限定检索用的字段共有60多个

主要字段一览表


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第二节 检索

主要字段一览表


Pubmed4

第二节 PubMed的字段和字段检索

  • PubMed的字段限定检索,格式是:检索词[字段标识符]。

  • 例如:

    aspirin[ti],osteoporosis[majr],hepatitis[tiab];Clin Infect Dis [ta];smith ab [au] 。

  • 注:也可以通过Limits中的字段下拉菜单进行字段限定检索。


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第三节 PubMed的使用

一、检索机制和规则

  • 1.单词、词组检索

  • 2.短语检索

  • 3.截词检索

  • 4.布尔逻辑运算

  • 5.MeSH检索(主题词检索)


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  • 1.单词、词组检索

直接输入检索词,不加任何限定


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  • 返回的结果页面


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  • 2.短语检索

  • 自动词语匹配功能(Automatic Term Mapping):即指系统的词语自动转换、匹配的功能。

  • 在检索输入框输入的检索词若不用截词算符、双引号、字段限定,系统依次会在以下3个表中词语的匹配、转换和检索:MeSH转换表(MeSH Translation Table)、刊名转换表(Journals Translation Table)、作者索引(Author Index)。如果在上述3个转换表中均找不到相匹配的词语,系统将检索词拆小,继续依次到上述3个表中查找,找到后以逻辑与“AND”组配检索。


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  • 2.短语检索

  • 短语检索又称精确短语检索或者强制检索,即对检索词加上双引号(需在英文状态下输入),如检索框中输入"traditional Chinese medicine",PubMed将"traditional Chinese medicine"作为一个不可分割的词组在数据库的所有可检索字段中进行检索。


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  • 2.短语检索

  • ①直接输入检索词traditional Chinese medicine:

    检索结果为:20322,实际检索策略为:

    "medicine, chinese traditional"[MeSH Terms] OR ("medicine"[All Fields] AND "chinese"[All Fields] AND "traditional"[All Fields]) OR "chinese traditional medicine"[All Fields] OR ("traditional"[All Fields] AND "chinese"[All Fields] AND "medicine"[All Fields]) OR "traditional chinese medicine"[All Fields]

  • ②强制短语检索,输入"traditional Chinese medicine":

    检索结果为:10784,实际检索策略为:

    "traditional Chinese medicine"[All Fields]


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  • 3.截词检索

  • 对词根或词尾略有变化的词进行检索时需要应用截词检索。

  • PubMed允许使用“*”进行右边截词检索,如: “viru*”,检索以viru开头的单词。

  • 如果单词数量大于600,则PubMed自动提示延长词干。

  • 截词功能只限于单词,对词组无效;使用短语功能、截词功能、限定检索时,PubMed会自动关闭自动词语匹配功能。


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  • 4.布尔逻辑运算

  • 逻辑运算符号主要有“AND”、“OR”、“NOT” ,分别表示“逻辑与”,“逻辑或”,“逻辑非”。

A

A

A

B

B

B

A AND B

A OR B

A NOT B


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  • 4.布尔逻辑运算

  • 逻辑运算符号的前后都要有空格,顺序为从左至右,可以用全括号来改变其运算顺序,全括号中的检索词最优先。


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3.主题词检索

  • 主题词(headings)又叫做叙词,是描述文章重点讨论的内容,是对文献规范化处理后的结果,主要用于文献的标引和检索。

  • 副主题词(subheadings)是用于对主题词做进一步限定的词语,又叫限定词(qualifier),如对某一疾病的诊断、治疗,某种药物的毒性、副作用等。使用副主题词的主要目的是为了增强主题词的专指性,可缩小检索范围、提高检索效率。


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3.主题词检索

  • 第一,主题词检索克服了同一概念由于拼法不同而导致的漏检或误检。

  • 第二,主题词检索具有下位词扩展检索功能。

  • 第三,主题词检索支持副主题词限定功能,使检索更专指。

  • 主题词检索与自由词检索相比,具有3个方面的优势:


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例子

  • 肿瘤:主题词:Neoplasm【Mesh】

  • 代表了以下众多自由词

  • •Tumors(复数)

  • •Tumor(美国拼法,而英国拼法是tumour)

  • •Cancer

  • •Cancers

  • •Benign Neoplasms

  • •Neoplasms, Benign

  • •Benign Neoplasm

  • •Neoplasm, Benign

  • 如果不用主题词检索 就得把所有的同义词进行 OR 检索 其中还得考虑英式和美式拼法的不同

  • 所以所有的正规EBM检索都会告诉你:检索时请同时使用Mesh词(查全)和文本词(查新)


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主题词(MeSH)检索的具体方法和步骤如下:


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4.作者检索

  • 有三种作者检索的方式:

  • 一是利用PubMed自动词语匹配功能,其输入规则是:姓在前,用全称,名在后,用首字母。

  • 二是利用作者字段限定检索,其输入规则是:在作者姓名之后加上作者字段符[AU],例如:Smith J[AU]。

  • 三是通过“Limits”或“Advanced Search”中的“Author”限定,可以检索该作者的文献。

Limits页面右下方


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fmjs

B、检索特点:

  • 1、自由词检索

  • 2、主题词检索

  • 3、高级检索

  • 4、期刊导航检索

  • 5、检索史&策略检索

  • 6、加载PubMed检索


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  • C、过滤功能

  • 1、循证医学过滤

  • 2、评价工具过滤

  • 3、文献类型、格式过滤

  • 4、语种及年代过滤


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  • 1、循证医学过滤

  • 循证医学(Evidence Based Medicine,简称EBM),指运用最新、最有力的科研信息,指导临床医生采用最适宜的诊断方法、最精确的预后估计和最安全有效的治疗方法来治疗病人。强调医师应认真地深思熟虑地将目前所得到的最佳证据,用于对每位患者进行健康服务时的决策,使提供的医疗服务建立在目前所能获得的证据基础上。循证医学是把双刃剑,既能让病人受益(病愈),又能让医生受益(医术提高),它告诉医生要每天坚持学习、终身学习,现已成为解决临床问题的最便捷方法之一。

  • FMJS所提供的循证医学过滤器,便于用户在检索结果中快速获取最好的临床研究证据与临床实践信息,包括系统综述(SR)、Meta分析(荟萃分析)、随机对照实验(Randomized controlled trial,RCT)等等一些重要的循证文献类型,目的是指导临床医生用最少的时间获得高度相关性和透明性的证据文献,并评价应用于临床决策,以最适宜的诊断方法、最精确的预后估计和最安全有效的治疗方法来治疗疾病。


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  • 2、评价工具过滤:

  • (1)同行评议:同行评议是近年来国际上新推出的第二代网络辅助工具,是21世纪新一代的发现和评价生物学与医学文献的最新网络评价武器,为繁忙的临床医生了解最新、最重要的医学情报信息提供了尽可能多的通道,被情报专家形象地称为“仙人指路”。 同行评议的评委会成员由美国哈佛大学和英国剑桥大学等国际名校1900个生物学和2500名医学顶尖教授组成,具有绝对的权威性,每日推荐那些新发现、新技术、有趣的假说和重要确认等重要的学术论文,方便医生在浩瀚的文献大海中直接浏览本专业领域内有重要价值的前沿文献,了解已经阅读该文献的专家的评价观点和意见。FMJS对同行评议进行了整合揭示,并在检索结果里做出过滤标识,便于用户直接过滤出被世界上顶级权威医学专家评价过的重要文献,轻松获得本学科内正在或即将改变临床实践的新知识、新技术,从而保持与学科前沿视野的一致。


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  • (2)被SCI期刊收录:正因为SCI期刊收录的文献能全面覆盖全世界最重要和最有影响力的研究成果,所以SCI不仅作为一部文献检索工具使用,而且成为科研评价的一种依据,目前已成为衡量国内大学、科研机构和科学工作者学术水平的最重要的尺度。FMJS的“被SCI期刊收录”功能,可帮助用户快速查明文章的SCI收录情况(引用情况可通过康健提供的个性化服务实现)。

  • (3)Google引文:GoogleScholar是Google于2004年底推出的专门面向学术资源的免费搜索工具,它能够方便快速地帮助用户查找多种学术文献,同时屏蔽掉许多无用信息,其服务对象主要是科学家和各类从事学术研究的人士,搜索范围涵盖几乎所有知识领域的高质量学术研究资料,包括论文、专业书籍以及技术报告,并可显示文献被引情况,查证某一位专家对科学做出的实际贡献,成为当代学者、研究人员和学生查找专业文献资料的首选工具。英国学者Jeremy Laurance曾十分赞叹地说:“Google是比听诊器和体温计更好的诊断工具”。FMJS提供的Google引文功能,可方便用户即时了解文章的被引用情况,这也是国内唯一将GoogleScholar与专业检索服务超链的平台。


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  • (4)PubMed相关文献:指在研究内容上相似或相关的文献。PubMed有一强大的单词权重体系,经比较论文文摘、标题、引文和医学主题词的相符情况,列出一系列与所选某篇文摘相匹配的文献集,而且其中的任何一篇又有一个相关文献集,医学科研人员对此应特别重视。FMJS特别给出了PubMed相关文献的链接,利于用户查找更全面的文献资料。


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  • D、统计分析功能

  • 1、国家

  • 2、城市

  • 3、高产出作者

  • 4、高产出期刊

  • 5、出版年代


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  • E、全文获取通道揭示

  • 1、免费文献

  • 2、馆际互借通道

  • 3、PubMed电子资源通道揭示

  • 4、国内馆藏资源通道揭示


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  • F、人性化设计

  • 1、全中文界面

  • 2、题录输出、显示文摘

  • 3、机器翻译、鼠标即指翻译

  • 4、中英文主题词对照

  • 5、相关度、出版日期排序

  • 6、个性化设置

  • 7、我的服务中心


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服务模式

  • FMJS现提供以下三种服务模式:

  • 1、互联网版:通过互联网直接访问网址:www.kjebm.com,输入正式账号密码登录到FMJS中,享用一站式的服务。

  • 2、局域网版:通过用户端安装的镜像,以内网为入口登录到FMJS中,享用一站式的服务。

  • 3、个人账号版: 为方便单位用户中个人的使用,2012年我们特别在升级版FMJS中增加了个人账号版的服务模式,具体操作方法详见网站首页“个人账号使用说明”文件。成功注册个人账号后,不仅可享检索、馆际互借文献的自由,而且可通过系统提供的“我的服务中心”,进一步实现对文献的收藏、查询、管理及留言咨询等。


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登陆方式

  • 登陆:www.kjebm.com->新版系统


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自由词检索


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两点说明(更早,PMID号)


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主题词检索


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高级检索


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期刊导航


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点击期刊名称进入


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服务中心


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案例

  • 肌肉萎缩性脊髓侧索硬化症(Amyotrophic lateral sclerosis,ALS)

    美国人称为卢伽雷氏症,英国人也叫“运动神经元细胞病”,台湾人俗称渐冻症,并将此类病症患者称为清醒的“植物人”。这是一种渐进的神经退行性疾病,其特征是运动神经逐渐麻痹坏死并停止传送讯息到肌肉,在不能运作的情况下,肌肉逐渐衰弱、萎缩。最后,大脑完全丧失控制随意运动的能力。因其难以治愈而且致命,被世界卫生组织列为与癌症、艾滋病等齐名的五大绝症之一。

    尽管科学进步日新月异,但是ALS的致病原因,至今尚不明确,也没有任何方法能够有效治疗该病。目前虽有被FDA(美国食品药品监督管理局)和EU(欧盟)批准用于ALS的治疗药物利鲁唑(利芦噻唑riluzole )。

    但其疗效究竟如何,通过应用FMJS,检索有关双盲、安慰剂对照的临床实验,以获得最全面、最有力的循证医学证据文献。检索步骤如下:


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具体检索步骤

  • 1、通过运用自由词检索,得到利芦噻唑(Riluzole)治疗ALS(Amyotrophic Lateral Sclerosis的相关文献345篇,


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2、通过运用主题词检索,得到利芦噻唑治疗ALS的相关文献171篇,


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高产期刊统计功能


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高产作者统计


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文献过滤器


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随机对照试验文献获取

  • 勾选所需文献,点击馆际互借按钮


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提交完成


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