200 likes | 298 Views
Diagnostický systém CANSCREEN 3 určený pro trh “Data Mining” nástrojů ve vyspělých státech. J.Jansa 1 , M.Cesal 2 , P.Zubina 3 1. Immobiliser Central Europe , s. r .o., Česká republika 2.BIOCONS, Slovenská republika 3.Krajská zdravotní, Ústí n .L., Česká republika.
E N D
Diagnostickýsystém CANSCREEN 3 určený pro trh “Data Mining” nástrojůvevyspělýchstátech J.Jansa1, M.Cesal2, P.Zubina3 1.ImmobiliserCentralEurope, s.r.o., Česká republika 2.BIOCONS, Slovenská republika 3.Krajská zdravotní, Ústí n.L., Česká republika
Historieprojektu CANSCREEN CANSCREEN 1 – 1986 – 1999 Bio Analyst 1– 2004 – 2010 CANSCREEN 2 – 2011 – 2013 BioAnalyst 2 – 2013 -? CANSCREEN 3 - 2013 - ?
TezeprofesoraThieryv 2013 • Budoucnost mají nové přístupy, jako je analýza metabolismu a především proteinů • Stále více budou používány přístroje bez chemikálií, jako jsou spektrální analyzátory • Základ vyhodnocování bude víceparametrová analýza a metody „data mining“ platformy • Bio informatika bude zabudována přímo do laboratorních přístrojů a omezí subjektivní diagnostické závěry, typické pro mladé lékaře • Medicína, která v současnosti nestačí sledovat technologický rozvoj přístrojů a počítačových programů musí projít kvalitativní změnou v přístupu k jejich aplikaci
CANSCREEN 1 v 90tých letech • Analýza proteinů byla základem řešení projektu CANSCREEN 1 od jeho zahájení • Byly testovány metody jako je automatická elektroforéza a další, většinou s minimem reagencií ( suchá chemie fy BOEHRINGER MANNHEIM atp.) • Základ vyhodnocování tvořil produkt na víceparametrovou shlukovou analýzu CLUSTEX • Byly odzkoušeny přístroje firem BOEHRINGER MANNHEIM , OLYMPUS i DYNATECH se zabudovaným software CLUSTEX • Snaha o tuto změnu byla cílem týmu CANSCREEN 1 v 90.letech a je i cílem týmu CANSCREEN 2 v současnosti
Hlavní prvky projektu CANSCREEN Sběrbiochemických a ostatníchlaboratorníchdat Tvorbapotvrzenýchdiagnostickýchshluků pro každouskupinunemocí Simulacevirtuálníchsouborůdatpomocímetody Monte Carlo Optimalizacenezbytnéhomnožstvíparametrůvkaždéskupině Vyhodnocenídatkonkrétníhopacienta
Cíle projektu CANSCREEN • Vyvinoutnovoumatematickoumetodushlukovéanalýzy • Zaměřit se navyhodnocovánístandardníchbiochemickýchparametrůmístodrahýchmarkerů • Odstranitredundantníparametry • Vyvinoutuživatelskypříjemné software CLUSTEX Cílembylovyvinutí “low – cost” systému pro plošný screening populace
CANSCREEN 1 partneři Ústav sér a očkovacích látek, Praha(USOL) Nemocnice Gottwaldov(nyní Zlín) Nemocnice Sokolov Nemocnice TrencianskeTeplice Onkologický ústav na Žlutém kopci, Brno Karlova univerzita, FN Motol
Jak bojovat s rakovinou? • Nejdůležitějšímprostředkembojesrakovinou je časnádetekcetétonemoci, a to vobdobíbezsymptomů. • “Early detection of cancer greatly increases the chances for successful treatment. There are two major components of early detection of cancer: education to promote early diagnosis and screening” WHO definition
CANSCREEN 2 partneři Krajskázdravotní, a.s. Ústín.L. CompuGroup Medical Českárepublika, s.r.o. MacTech City, spol. sr.o.,
Použitíbiomarkerůpotřebuje IT přístup Vývojbiochemickýchdiagnostickýchmetodvposledníchletechprokázal, ženenímožnospoléhatnaidividuálníbiomarkery, neb žádnýnesplňujepožadavkynavysokousenzitivitu a specificitu. Perspektivnímřešením je proto kombinacemarkeru, kterýdíkvysokésenzitivitězachytípočáteknádorovéhoonemocnšěnívčas, ale mávysokoufalešnoupozitivitu, smarkerem, kterýmánižšísenzitivitu, avšakdíkvysokéspecificitětutofalešnoupozitivituvyloučí
CANSCREEN 2 • S ohledemnanáročnostzískáváníklinickyověřenýchlaboratorníchdatbylyzahájenyjenvybranéaplikace. • Screening nádorůprostaty – Data získánavespoluprácisKrajskouzdravotní, Ústín.L. • Screening melanomu – SpoluprácesFrauenhoferovýmústavem, Porto
Zvolenélaboratorníparametry S ohledemnazkušenostizprací, prováděnýchv 90tých letech, kdypozornostbylavěnovánaproteinůmakutnífázem, předevšímpakglykoproteinům, jakojsou alfa-1-antitrypsin, haptoglobin, orosomukoidbylozahájenotestováníkomplexnějšíchparametrů, a to alfa -1, alfa-2, beta a gamaglobulinů. Tytoparametrytakurčíprvnípodezřenínanádorovéonemocnění. Pro testováníonemocněníprostatybylypoužityběžnéparametry, jako PSA, volnéPSA a p., avšakvždyspřiřazenýmvěkemjakokvantitativnímparameterem pro shlukouanalýzu. Tímjižbylomožnoodlišit 2 základnídiagnózynemocíprostaty, a to C 61 a N 40.
an Vyhodnotitanamnézovýdotazník, jakonapř. I-PSS unádoruprostaty, a tokvantitativněpomocí SW CLUSTEX Vyhodnotitzákladníparametrypomocí SW CLUSTEX, např. jakojsouunádoruprostaty PSA, fPSA a p. spřiřazenýmvěkem Použítprincip “watchful waiting” a opakovatměřeníivyhodnocenípo 3 či 6 měsících Je lipravděpodobnostnádoruurčenáshlukovouanalýzouvětšínež 70% provéstbiopsii Preferovatimunoterapiipředoperativnímzásahem Je linezbytný, sledovatdáleparametrydlebodu 2
Závěry • Testovánísystému CANSCREEN 2 vletech 2012 – 2013 ukázalo: • Výsedkyz 90tých let bylypotvrezny • Bylvyporacivánnávrhnovédiagnostikyrakovinyprostaty • Pro potvrzenívýsledkůjsounutn= rozsáhlajšíklinicképokusy • Je nutnonaléztstrategicképartnery
Jaké verze našeho DSS připravujeme Vývojverzí pro různánádorováijináonemocnění VývojBioAnalystverze pro Nemocničníinformačnísystémy, založenénaplatformě “cloud” Vývojexpertního Call centra pro komuniakci se smartphonypacientů a zasílání“disease warning messages”
Klony projektu CANSCREEN BioAnalyst PC - verzebiochemickéhoexpertníhosystému pro PC BioAnalyst Portal –webováverzespřístupemzesmartphonů CarDiab – verze pro kardiaky a diabetiky -TBD InpresOl –verze pro stanovenírizikapředčasnéhoporodu–doplněksystémuPrenCarefirem MEDETRON, s.r.o. a COMINFO, a.s. - TBD